Statistics and Modelling for Health Sciences

Biostatistics Health Group

Subtil Fabien

Maître de conférences - praticien hospitalier

UCBL

Address: 162 avenue Lacassagne
69424 LYON cedex 03

Tel: 33 04 72 11 52 38

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Activité de recherche

Recherche actuelle

Identification de profils de trajectoires typiques dans les études cliniques ou épidémiologiques

Une trajectoire est constituée par les mesures longitudinales d’un biomarqueur chez un individu. L’identification de profils typiques de trajectoire permet de classer les individus, et d’avoir une meilleure connaissance de l’hétérogénéité naturelle entre les patients. Le lien entre les groupes de trajectoire et le pronostique peut ensuite être recherché, ainsi que des facteurs prédisposant à l’appartenance à un groupe donné.
Deux travaux principaux ont été menés dans cette thématique de recherche.

Application à la recherche de facteurs cliniques prédisant la réponse à un traitement antihypertenseur
Recherche des facteurs de réponse au traitement lorsque la réponse est évaluée par des mesures répétées de pression artérielle. Travail réalisé en partenariat avec le Pr Gueyffier de l’équipe EMET.

Adaptation des méthodes à des biomarqueurs binaires ou résultant d’un comptage
Participation aux tâches 3 (KmlCov) et 5 (KmlVar) de l’ANR IDOL (responsable : C. Genolini, Bordeaux ; financement obtenu en 2012).
Travail fondamental d’adaptation des méthodes usuelles de classification de trajectoires à des biomarqueurs binaires ou résultant d’un comptage.

 

 

Projets de recherche

Utilisation des trajectoires typiques pour établir le diagnostic précoce de maladies

Utilisation de la méthodologie d’identification de trajectoires typiques pour évaluer la capacité d’un biomarqueur longitudinal à établir un diagnostic précoce. L’application portera sur l’analyse des variations de β-HCG suite à un premier curetage de mole hydatiforme pour le diagnostic d’échec du curetage.

Prise en compte des conséquences cliniques dans le choix des tests diagnostiques

Le choix d’un test diagnostique (ou de son seuil) repose très fréquemment sur l’analyse de sa courbe ROC. Le succès de cet outil en a fait oublier la non prise en compte de la prévalence et des conséquences cliniques des erreurs de classement (maladie non détectée ou traitement à tort). Ces paramètres impactent pourtant grandement le bénéfice espéré en population de la stratégie diagnostique.
Le travail de recherche visera à adapter de façon simple les courbes ROC pour prendre en compte ces deux facteurs. L’objectif est que cet outil aussi populaire en recherche clinique soit désormais, par des modifications simples, utilisé de façon rationnelle en termes de prise de décision médicale.

Etablissement de seuils pour la médecine personnalisée

La médecine personnalisée repose sur des biomarqueurs qui orientent le choix de la stratégie de traitement. Aujourd’hui, les seuils de décision associés à ces biomarqueurs tiennent compte du caractère répondeur ou non du patient au traitement, mais rarement de la qualité de vie. La thématique de recherche portera sur les méthodes de prise en compte de l’état de santé futur d’un patient dans le choix du seuil optimal d’un biomarqueur prédictif, et sur l’intérêt de la prise en compte de ce paramètre.

 

 

Activités d'enseignement

Enseignements au sein du Master Santé Publique

- M2 UE " Modéle linéaire et linéaires généralisé " : TD.
- M2 UE " Inférence Fréquentiste et Bayésienne, Paramétrique et non Paramétrique " : cours et TD sur les méthodes d’estimations en situation de paramètres multiples.
- M2 UE " Modélisation diagnostique et pronostique. Propriétés prédictives des modèles " : cours/TD
- M2 UE " Modèles linéaires et linéaires généralisés à effets mixtes " : cours/TD
- M2 UE " Méthodes statistiques pour les essais cliniques " : cours/TD

 

Enseignements au sein de l’INSA de Lyon


- 4ème année, module " Modèle linéaire généralisé " : cours.
- 5ème année, module " Statistique bayésienne et applications " : cours et TD/TP.

Enseignements au sein de la Faculté de Médecine Lyon Sud Charles Mérieux

- PASS, UE " Evaluation des méthodes d’analyse appliquées aux sciences de la vie et de la santé " : cours et ED.

- PASS, UE " Projet d'études " .
- FGSM 2, UE " Biomédecine quantitative " : cours.

- DFGSM1, UE "Formation générale à la recherche" : cours.

- Conférences d’internat pour la préparation à l’ECN.

Formation LBBE

Formation continue sur l'inférence bayésienne

Publications

Display of 61 to 90 publications on 163 in total

Senior-COVID-Rea Cohort Study: A Geriatric Prediction Model of 30-day Mortality in Patients Aged over 60 Years in ICU for Severe COVID-19

C. Falandry, L. Bitker, P. Abraham, F. Subtil, V. Collange, B. Balança...

Aging and disease . 13 ( 2 ) : 614-623

DOI: 10.14336/ad.2021.1004

Journal article

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Endoscopic submucosal dissection combined with clip for closure of gastrointestinal fistulas including those refractory to previous therapy

Pierre Lafeuille, Timothée Wallenhorst, Alexandru Lupu, Jérémie Jacques, Thomas Lambin, Marine Camus...

Endoscopy . 54 ( 07 ) : 700-705

DOI: 10.1055/a-1641-7938

Journal article

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Risk factors associated with day-30 mortality in patients over 60 years old admitted in ICU for severe COVID-19: the Senior-COVID-Rea Multicentre Survey protocol

Claire Falandry, Amélie Malapert, Mélanie Roche, Fabien Subtil, Julien Berthiller, Camille Boin...

BMJ Open . 11 ( 7 ) : e044449

DOI: 10.1136/bmjopen-2020-044449

Journal article

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The Effect of Foot Reflexology on Chemotherapy-Induced Nausea and Vomiting in Patients With Digestive or Lung Cancer: Randomized Controlled Trial

Audrey Murat-Ringot, Pierre Jean Souquet, Fabien Subtil, Florent Boutitie, Marie Preau, Vincent Piriou

JMIR Cancer . 7 ( 4 ) : e25648

DOI: 10.2196/25648

Journal article

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Trajectory clustering using mixed classification models

Amna Klich, René Ecochard, Fabien Subtil

Statistics in Medicine . 40 ( 15 ) : 3425-3439

DOI: 10.1002/sim.8975

Journal article

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Determination of the optimal dose of ephedrine in the treatment of arterial hypotension due to general anesthesia in neonates and infants below 6 months old: the ephedrine study protocol for a randomized, open-label, controlled, dose escalation trial

A. Szostek, P. Boucher, Fabien Subtil, O. Zerzaihi, C. Saunier, M. de Queiroz Siqueira...

Trials . 22 ( 1 ) : 208

DOI: 10.1186/s13063-021-05155-2

Journal article

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Results of in vitro fertilization versus intrauterine insemination in patients with low anti-Müllerian hormone levels. A single-center retrospective study of 639 + 119 cycles

Clémence Sapet, Antoine Gavoille, Alix Sesques, Thomas Freour, Fabien Subtil, Bruno Salle

Journal of Gynecology Obstetrics and Human Reproduction . 50 ( 3 ) : 101874

DOI: 10.1016/j.jogoh.2020.101874

Journal article

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[Health issues of patients aged 65 years or over managed in general practice: which associations are remarkable?]

Elodie Vandroz, Fabien Subtil, Marc Bonnefoy, Laurent Letrilliart

Gériatrie et psychologie & neuropsychiatrie du vieillissement . 19 ( 4 ) : 366-374

DOI: 10.1684/pnv.2021.0970

Journal article

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A fixed-duration, measurable residual disease–guided approach in CLL: follow-up data from the phase 2 ICLL-07 FILO trial

Anne-Sophie Michallet, Rémi Letestu, Magali Le Garff-Tavernier, Carmen Aanei, Michel Ticchioni, Marie-Sarah Dilhuydy...

Blood . 137 ( 8 ) : 1019-1023

DOI: 10.1182/blood.2020008164

Journal article

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Toward Pediatric T Lymphoblastic Lymphoma Stratification Based on Minimal Disseminated Disease and NOTCH1/FBXW7 Status

Amélie Trinquand, Adriana Plesa, Chrystelle Abdo, Fabien Subtil, Nathalie Aladjidi, Charlotte Rigaud...

HemaSphere . 5 ( 10 ) : e641

DOI: 10.1097/hs9.0000000000000641

Journal article

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Hemodynamic Response to Treatment and Outcomes in Pulmonary Hypertension Associated With Interstitial Lung Disease Versus Pulmonary Arterial Hypertension in Systemic Sclerosis: Data From a Study Identifying Prognostic Factors in Pulmonary Hypertension Ass

Louis Chauvelot, Delphine Gamondes, Julien Berthiller, Ana Nieves, Sébastien Renard, Judith Catella-Chatron...

Arthritis & rheumatology . 73 ( 2 ) : 295-304

DOI: 10.1002/art.41512

Journal article

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PLAN-e-PSY, a mobile application to improve case management and patient’s functioning in first episode psychosis: protocol for an open-label, multicentre, superiority, randomised controlled trial

Frédéric Haesebaert, Sofia El Oussoul, Amélie Pavard, Delphine Fabre, Caroline Cellard, Laurent Magaud...

BMJ Open . 11 ( 9 ) : e050433

DOI: 10.1136/bmjopen-2021-050433

Journal article

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The Effect of Foot Reflexology on Chemotherapy-Induced Nausea and Vomiting in Patients With Digestive or Lung Cancer: Randomized Controlled Trial

Audrey Murat-Ringot, Pierre Jean Souquet, Fabien Subtil, Florent Boutitie, Marie Preau, Vincent Piriou

JMIR Cancer . 7 ( 4 ) : e25648

DOI: 10.2196/25648

Journal article

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Management and Prognosis of Localized Duodenal Neuroendocrine Neoplasms

Servane Gay-Chevallier, Louis de Mestier, Julie Perinel, Julien Forestier, Valérie Hervieu, Philippe Ruszniewski...

Neuroendocrinology . 111 ( 8 ) : 718-727

DOI: 10.1159/000508102

Journal article

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What are the factors influencing the aesthetic requirement in the choice of orthodontic appliances in adults?

Mélanie Gremeret, Vanessa Valran, Fabien Subtil, Sarah Gebeile-Chauty

Orthodontie Française . 92 ( 2 ) : 239-255

DOI: 10.1684/orthodfr.2021.46

Journal article

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Otoskills training during covid-19 pandemic: a before-after study

Maxime Fieux, Antoine Gavoille, Fabien Subtil, Sophie Bartier, Stéphane Tringali

BMC Medical Education . 21 ( 1 ) : 284

DOI: 10.1186/s12909-021-02706-8

Journal article

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What are the risk factors specific to patient for debonding of orthodontic brackets?

Pierre Dingreville, Vanessa Valran, Fabien Subtil, Sarah Gebeile-Chauty

Orthodontie Française . 92 ( 4 ) : 391-401

DOI: 10.1684/orthodfr.2021.53

Journal article

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Value of a patient-reported-outcome measure of carcinoid syndrome symptoms

Juliette Maurel, Rosine Guimbaud, Thierry Lecomte, Astrid Lièvre, Vincent Hautefeuille, Philip Robinson...

European Journal of Endocrinology . 184 ( 5 ) : 711-722

DOI: 10.1530/EJE-20-1138

Journal article

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Risk factors associated with day-30 mortality in patients over 60 years old admitted in ICU for severe COVID-19: the Senior-COVID-Rea Multicentre Survey protocol

C. Falandry, A. Malapert, M. Roche, F. Subtil, J. Berthiller, C. Boin...

BMJ Open . 11 ( 7 ) : e044449

DOI: 10.1136/bmjopen-2020-044449

Journal article

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Adherence to cysteamine in nephropathic cystinosis: A unique electronic monitoring experience for a better understanding. A prospective cohort study: CrYSTobs

S. Gaillard, L. Roche, S. Lemoine, G. Deschênes, D. Morin, C. Vianey-Saban...

Pediatric Nephrology . 36 ( 3 ) : 581-589

DOI: 10.1007/s00467-020-04722-0

Journal article

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Maintien à long terme d’une réponse complète avec maladie résiduelle indétectable après une stratégie de traitement combinant de l’ibrutinib à une immunochimiothérapie ≪ adaptée ≫ chez les patients atteints d’une leucémie lymphoïde c

A.S. Michallet, M.S. Dilhuydy, F. Subtil, V. Rouille, B. Mahé, K. Laribi...

40e Congrès de la Société Française d’Hématologie . 26 ( S4 ) : 125

Poster

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The Effects of Foot Reflexology on Chemotherapy-Induced Nausea and Vomiting in Patients with Digestive System or Lung Cancer: Protocol for a Randomized Controlled Trial

Audrey Murat-Ringot, Pierre Jean Souquet, Marion Chauvenet, Charlotte Rentler, Fabien Subtil, Anne-Marie Schott...

JMIR Research Protocols . 9 ( 7 ) : e17232

DOI: 10.2196/17232

Journal article

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Observation and Interview-based Diurnal Sleepiness Inventory for measurement of sleepiness in patients referred for narcolepsy or idiopathic hypersomnia

Laure Peter-Derex, Fabien Subtil, Guillaume Lemaitre, François Ricordeau, Hélène Bastuji, Agathe Bridoux...

Journal of Clinical Sleep Medicine . 16 ( 9 ) : 1507-1515

DOI: 10.5664/jcsm.8574

Journal article

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Risk of neoplastic change in large gastric hyperplastic polyps and recurrence after endoscopic resection

Emmanuel Forté, Bérénice Petit, Thomas Walter, Vincent Lépilliez, Geoffroy Vanbiervliet, Florian Rostain...

Endoscopy . 52 ( 06 ) : 444-453

DOI: 10.1055/a-1117-3166

Journal article

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Endoscopic submucosal dissection with double clip and rubber band traction for residual or locally recurrent colonic lesions after previous endoscopic mucosal resection

Julien Faller, Jérémie Jacques, Borathchakra Oung, Romain Legros, Jérôme Rivory, Fabien Subtil...

Endoscopy . 52 ( 05 ) : 383-388

DOI: 10.1055/a-1104-5210

Journal article

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Age- and Sex-Specific TSH Upper-Limit Reference Intervals in the General French Population: There Is a Need to Adjust Our Actual Practices

Véronique Raverot, Maxime Bonjour, Juliette Abeillon Du Payrat, Pauline Perrin, Florence Roucher-Boulez, Hélène Lasolle...

Journal of Clinical Medicine . 9 ( 3 ) : 792

DOI: 10.3390/jcm9030792

Journal article

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First‐line treatment of double‐hit and triple‐hit lymphomas: Survival and tolerance data from a retrospective multicenter French study

Marie‐charlotte Laude, Laure Lebras, Pierre Sesques, Herve Ghesquieres, Simon Favre, Krimo Bouabdallah...

American Journal of Hematology . 96 ( 3 ) : 302 - 311

DOI: 10.1002/ajh.26068

Journal article

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Early Detection of Patients at Risk of Developing a Post-Traumatic Stress Disorder After an ICU Stay*

Emilie Wawer, Marie Viprey, Bernard Floccard, Mohamed Saoud, Fabien Subtil, Hashim Wafa...

Critical Care Medicine . 48 ( 11 ) : 1572-1579

DOI: 10.1097/CCM.0000000000004551

Journal article

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Scope of health problems managed by general practitioners in Mali and France: awaiting practice transition in sub-Saharan Africa?

Raphaël Naville, Fabien Subtil, Mansour Sy, Michel Marquis, Pierre Costes, Laurent Letrilliart

Family Practice . 37 ( 5 ) : 668-674

DOI: 10.1093/fampra/cmaa035

Journal article

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Predictors of re-consultation and impact of the retainer on relapse and debonding rate ten years after removal of orthodontic appliances

Laure de Launay, Marie-José Goumy, Fabien Subtil, Sarah Gebeile-Chauty

Orthodontie Française . 91 ( 3 ) : 179-190

DOI: 10.1684/orthodfr.2020.17

Journal article

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