Statistiques et Modélisation pour les Sciences de la Santé
Subtil Fabien
Maître de conférences - praticien hospitalier
UCBL
Tél : 33 04 72 11 52 38
Activité de recherche
Recherche actuelle
Identification de profils de trajectoires typiques dans les études cliniques ou épidémiologiques
Une trajectoire est constituée par les mesures longitudinales d’un biomarqueur chez un individu. L’identification de profils typiques de trajectoire permet de classer les individus, et d’avoir une meilleure connaissance de l’hétérogénéité naturelle entre les patients. Le lien entre les groupes de trajectoire et le pronostique peut ensuite être recherché, ainsi que des facteurs prédisposant à l’appartenance à un groupe donné.
Deux travaux principaux ont été menés dans cette thématique de recherche.
Application à la recherche de facteurs cliniques prédisant la réponse à un traitement antihypertenseur
Recherche des facteurs de réponse au traitement lorsque la réponse est évaluée par des mesures répétées de pression artérielle. Travail réalisé en partenariat avec le Pr Gueyffier de l’équipe EMET.
Adaptation des méthodes à des biomarqueurs binaires ou résultant d’un comptage
Participation aux tâches 3 (KmlCov) et 5 (KmlVar) de l’ANR IDOL (responsable : C. Genolini, Bordeaux ; financement obtenu en 2012).
Travail fondamental d’adaptation des méthodes usuelles de classification de trajectoires à des biomarqueurs binaires ou résultant d’un comptage.
Projets de recherche
Utilisation des trajectoires typiques pour établir le diagnostic précoce de maladies
Utilisation de la méthodologie d’identification de trajectoires typiques pour évaluer la capacité d’un biomarqueur longitudinal à établir un diagnostic précoce. L’application portera sur l’analyse des variations de β-HCG suite à un premier curetage de mole hydatiforme pour le diagnostic d’échec du curetage.
Prise en compte des conséquences cliniques dans le choix des tests diagnostiques
Le choix d’un test diagnostique (ou de son seuil) repose très fréquemment sur l’analyse de sa courbe ROC. Le succès de cet outil en a fait oublier la non prise en compte de la prévalence et des conséquences cliniques des erreurs de classement (maladie non détectée ou traitement à tort). Ces paramètres impactent pourtant grandement le bénéfice espéré en population de la stratégie diagnostique.
Le travail de recherche visera à adapter de façon simple les courbes ROC pour prendre en compte ces deux facteurs. L’objectif est que cet outil aussi populaire en recherche clinique soit désormais, par des modifications simples, utilisé de façon rationnelle en termes de prise de décision médicale.
Etablissement de seuils pour la médecine personnalisée
La médecine personnalisée repose sur des biomarqueurs qui orientent le choix de la stratégie de traitement. Aujourd’hui, les seuils de décision associés à ces biomarqueurs tiennent compte du caractère répondeur ou non du patient au traitement, mais rarement de la qualité de vie. La thématique de recherche portera sur les méthodes de prise en compte de l’état de santé futur d’un patient dans le choix du seuil optimal d’un biomarqueur prédictif, et sur l’intérêt de la prise en compte de ce paramètre.
Activités d'enseignement
Enseignements au sein du Master Santé Publique
M2 UE " Modéle linéaire et linéaires généralisé " : TD. M2 UE " Inférence Fréquentiste et Bayésienne, Paramétrique et non Paramétrique " : cours et TD sur les méthodes d’estimations en situation de paramètres multiples. M2 UE " Modélisation diagnostique et pronostique. Propriétés prédictives des modèles " : cours/TD M2 UE " Modèles linéaires et linéaires généralisés à effets mixtes " : cours/TD M2 UE " Méthodes statistiques pour les essais cliniques " : cours/TD
Enseignements au sein de l’INSA de Lyon
4ème année, module " Modèle linéaire généralisé " : cours. 5ème année, module " Statistique bayésienne et applications " : cours et TD/TP.
Enseignements au sein de la Faculté de Médecine Lyon Sud Charles Mérieux
PASS, UE " Evaluation des méthodes d’analyse appliquées aux sciences de la vie et de la santé " : cours et ED.
PASS, UE " Projet d'études " . FGSM 2, UE " Biomédecine quantitative " : cours.
DFGSM1, UE "Formation générale à la recherche" : cours.
Conférences d’internat pour la préparation à l’ECN.
Formation LBBE
Formation continue sur l'inférence bayésienne
Publications
Affichage des publications 61 à 90 sur 163 au total
Senior-COVID-Rea Cohort Study: A Geriatric Prediction Model of 30-day Mortality in Patients Aged over 60 Years in ICU for Severe COVID-19
Aging and disease . 13 ( 2 ) : 614-623
Article dans une revue
voir la publicationEndoscopic submucosal dissection combined with clip for closure of gastrointestinal fistulas including those refractory to previous therapy
Endoscopy . 54 ( 07 ) : 700-705
DOI: 10.1055/a-1641-7938
Article dans une revue
voir la publicationRisk factors associated with day-30 mortality in patients over 60 years old admitted in ICU for severe COVID-19: the Senior-COVID-Rea Multicentre Survey protocol
BMJ Open . 11 ( 7 ) : e044449
Article dans une revue
voir la publicationThe Effect of Foot Reflexology on Chemotherapy-Induced Nausea and Vomiting in Patients With Digestive or Lung Cancer: Randomized Controlled Trial
JMIR Cancer . 7 ( 4 ) : e25648
DOI: 10.2196/25648
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voir la publicationTrajectory clustering using mixed classification models
Statistics in Medicine . 40 ( 15 ) : 3425-3439
DOI: 10.1002/sim.8975
Article dans une revue
voir la publicationDetermination of the optimal dose of ephedrine in the treatment of arterial hypotension due to general anesthesia in neonates and infants below 6 months old: the ephedrine study protocol for a randomized, open-label, controlled, dose escalation trial
Trials . 22 ( 1 ) : 208
Article dans une revue
voir la publicationResults of in vitro fertilization versus intrauterine insemination in patients with low anti-Müllerian hormone levels. A single-center retrospective study of 639 + 119 cycles
Journal of Gynecology Obstetrics and Human Reproduction . 50 ( 3 ) : 101874
Article dans une revue
voir la publication[Health issues of patients aged 65 years or over managed in general practice: which associations are remarkable?]
Gériatrie et psychologie & neuropsychiatrie du vieillissement . 19 ( 4 ) : 366-374
Article dans une revue
voir la publicationA fixed-duration, measurable residual disease–guided approach in CLL: follow-up data from the phase 2 ICLL-07 FILO trial
Blood . 137 ( 8 ) : 1019-1023
Article dans une revue
voir la publicationToward Pediatric T Lymphoblastic Lymphoma Stratification Based on Minimal Disseminated Disease and NOTCH1/FBXW7 Status
HemaSphere . 5 ( 10 ) : e641
Article dans une revue
voir la publicationHemodynamic Response to Treatment and Outcomes in Pulmonary Hypertension Associated With Interstitial Lung Disease Versus Pulmonary Arterial Hypertension in Systemic Sclerosis: Data From a Study Identifying Prognostic Factors in Pulmonary Hypertension Ass
Arthritis & rheumatology . 73 ( 2 ) : 295-304
DOI: 10.1002/art.41512
Article dans une revue
voir la publicationPLAN-e-PSY, a mobile application to improve case management and patient’s functioning in first episode psychosis: protocol for an open-label, multicentre, superiority, randomised controlled trial
BMJ Open . 11 ( 9 ) : e050433
Article dans une revue
voir la publicationThe Effect of Foot Reflexology on Chemotherapy-Induced Nausea and Vomiting in Patients With Digestive or Lung Cancer: Randomized Controlled Trial
JMIR Cancer . 7 ( 4 ) : e25648
DOI: 10.2196/25648
Article dans une revue
voir la publicationManagement and Prognosis of Localized Duodenal Neuroendocrine Neoplasms
Neuroendocrinology . 111 ( 8 ) : 718-727
DOI: 10.1159/000508102
Article dans une revue
voir la publicationWhat are the factors influencing the aesthetic requirement in the choice of orthodontic appliances in adults?
Orthodontie Française . 92 ( 2 ) : 239-255
Article dans une revue
voir la publicationOtoskills training during covid-19 pandemic: a before-after study
BMC Medical Education . 21 ( 1 ) : 284
Article dans une revue
voir la publicationWhat are the risk factors specific to patient for debonding of orthodontic brackets?
Orthodontie Française . 92 ( 4 ) : 391-401
Article dans une revue
voir la publicationValue of a patient-reported-outcome measure of carcinoid syndrome symptoms
European Journal of Endocrinology . 184 ( 5 ) : 711-722
DOI: 10.1530/EJE-20-1138
Article dans une revue
voir la publicationRisk factors associated with day-30 mortality in patients over 60 years old admitted in ICU for severe COVID-19: the Senior-COVID-Rea Multicentre Survey protocol
BMJ Open . 11 ( 7 ) : e044449
Article dans une revue
voir la publicationAdherence to cysteamine in nephropathic cystinosis: A unique electronic monitoring experience for a better understanding. A prospective cohort study: CrYSTobs
Pediatric Nephrology . 36 ( 3 ) : 581-589
Article dans une revue
voir la publicationMaintien à long terme d’une réponse complète avec maladie résiduelle indétectable après une stratégie de traitement combinant de l’ibrutinib à une immunochimiothérapie ≪ adaptée ≫ chez les patients atteints d’une leucémie lymphoïde c
40e Congrès de la Société Française d’Hématologie . 26 ( S4 ) : 125
Poster
voir la publicationThe Effects of Foot Reflexology on Chemotherapy-Induced Nausea and Vomiting in Patients with Digestive System or Lung Cancer: Protocol for a Randomized Controlled Trial
JMIR Research Protocols . 9 ( 7 ) : e17232
DOI: 10.2196/17232
Article dans une revue
voir la publicationObservation and Interview-based Diurnal Sleepiness Inventory for measurement of sleepiness in patients referred for narcolepsy or idiopathic hypersomnia
Journal of Clinical Sleep Medicine . 16 ( 9 ) : 1507-1515
DOI: 10.5664/jcsm.8574
Article dans une revue
voir la publicationRisk of neoplastic change in large gastric hyperplastic polyps and recurrence after endoscopic resection
Endoscopy . 52 ( 06 ) : 444-453
DOI: 10.1055/a-1117-3166
Article dans une revue
voir la publicationEndoscopic submucosal dissection with double clip and rubber band traction for residual or locally recurrent colonic lesions after previous endoscopic mucosal resection
Endoscopy . 52 ( 05 ) : 383-388
DOI: 10.1055/a-1104-5210
Article dans une revue
voir la publicationAge- and Sex-Specific TSH Upper-Limit Reference Intervals in the General French Population: There Is a Need to Adjust Our Actual Practices
Journal of Clinical Medicine . 9 ( 3 ) : 792
DOI: 10.3390/jcm9030792
Article dans une revue
voir la publicationFirst‐line treatment of double‐hit and triple‐hit lymphomas: Survival and tolerance data from a retrospective multicenter French study
American Journal of Hematology . 96 ( 3 ) : 302 - 311
DOI: 10.1002/ajh.26068
Article dans une revue
voir la publicationEarly Detection of Patients at Risk of Developing a Post-Traumatic Stress Disorder After an ICU Stay*
Critical Care Medicine . 48 ( 11 ) : 1572-1579
Article dans une revue
voir la publicationScope of health problems managed by general practitioners in Mali and France: awaiting practice transition in sub-Saharan Africa?
Family Practice . 37 ( 5 ) : 668-674
Article dans une revue
voir la publicationPredictors of re-consultation and impact of the retainer on relapse and debonding rate ten years after removal of orthodontic appliances
Orthodontie Française . 91 ( 3 ) : 179-190
Article dans une revue
voir la publication