Equipe Ecologie Quantitative et Evolutive des Communautés
Thioulouse Jean
Directeur de recherche
CNRS
Batiment Mendel, 1er étage. Bureau 11.048
Page biblio: Vous pouvez visiter ma page biblio ici :https://jthome.thioulouse.fr/ref/
Recherche reproductible: Liste d'articles avec reproductibilité des calculs:
https://jthome.thioulouse.fr/Reproducible_Research/
https://pbil.univ-lyon1.fr/members/thioulouse/RRBibJT/
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=fr&user=1sjOJvSAAAAJO
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-7664-05980
IdHAL: https://cv.archives-ouvertes.fr/jean-thioulouse
ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Jean-Thioulouse
Livre ade4: Multivariate Analysis of Ecological Data with ade4
https://link.springer.com/book/10.1007/978-1-4939-8850-1
https://www.amazon.fr/Multivariate-Analysis-Ecological-Data-Ade4/dp/1493988484/
Reproductibilité de l'article Evol. Biol. 2021:
Overcoming the Spurious Groups Problem in Between-Group PCA
Activités de recherche
Mon activité de recherche est centrée sur l’innovation dans le domaine de la méthodologie statistique en biologie. Ces dernières années, je me suis plus particulièrement intéressé aux méthodes d’analyse statistique de la diversité bactérienne et de la diversité des macro−invertébrés aquatiques dans diverses conditions. J’ai cependant poursuivi des développements méthodologiques en informatiques, conduisant à la diffusion de logiciels, ainsi que des activités de consultation et de formation
Le package R ade4 :ade4
Le package R adegraphics :adegraphics
Le package R ade4TkGUI :ade4TkGUI
Publications
Affichage des publications 31 à 60 sur 167 au total
The exotic legume tree species, Acacia mearnsii, alters microbial soil functionalities and the early development of a native tree species, Quercus suber, in North Africa
Soil Biology and Biochemistry . 65 : 172--179
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voir la publicationEctomycorrhizal diversity enhances growth and nitrogen fixation of Acacia mangium seedlings
Soil Biology and Biochemistry . 57 : 468-476
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voir la publicationAustralian acacia introduction to rehabilitate degraded ecosystems is it free of environmental risks?
Bois et Forêts des Tropiques . 318 ( 4 ) : 59-65
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voir la publicationResponse of native soil microbial functions to the controlled mycorrhization of an exotic tree legume, Acacia holosericea in a Sahelian ecosystem
Mycorrhiza . 22 ( 3 ) : 175--187
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voir la publicationRestoring native forest ecosystems after exotic tree plantation in Madagascar: combination of the local ectotrophic species Leptolena bojeriana and Uapaca bojeri mitigates the negative influence of the exotic species Eucalyptus camaldulensis and Pinus pat
Biological Invasions . 14 ( 11 ) : 2407--2421
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voir la publicationMultivariate analyses in soil microbial ecology: a new paradigm
Environmental and Ecological Statistics . 19 ( 4 ) : 499--520
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voir la publicationSpatial processes driving soil microbial community assembly on a wide scale
4. International Congress Eurosoil 2012 - Soil Science for the Benefit of Mankind and Environment .
Acte de congrès
voir la publicationCommunity ecology in the age of multivariate multiscale spatial analysis
Ecological monographs . 82 ( 3 ) : 257 - 275
DOI: 10.1890/11-1183.1
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voir la publicationLarge trends in French topsoil characteristics are revealed by spatially constrained multivariate analysis
Geoderma . 161 : 107-114
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voir la publicationDiversity, Geographic Distribution, and Habitat-Specific Variations of Microbiota in Natural Populations of the Chicken Mite, Dermanyssus gallinae
Journal of Medical Entomology . 48 ( 4 ) : 788-796
DOI: 10.1603/ME10113
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voir la publicationNurse shrubs increased the early growth of Cupressus seedling by enhancing belowground mutualism ans doil microbial activity
Soil Biology and Biochemistry . 43 ( 10 ) : 2160-2168
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voir la publicationBiogeographical patterns of soil molecular microbial biomass as influenced by soil characteristics and management
Global Ecology and Biogeography . 20 : 641-652
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voir la publicationSIMULTANEOUS ANALYSIS OF A SEQUENCE OF PAIRED ECOLOGICAL TABLES: A COMPARISON OF SEVERAL METHODS
Annals of Applied Statistics . 5 ( 4 ) : 2300-2325
DOI: 10.1214/10-AOAS372
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voir la publicationBiogeography of soil microbial communities: a review and a description of the ongoing french national initiative
Sustainable Agriculture Volume 2 . 978-94-007-0393-3 : 857-865
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationDiversity Geographic Distribution and Habitat-Specific Variations of Microbiota in Natural Populations of the Chicken Mite Dermanyssus gallinae
Journal of Medical Entomology . 48 : 788-796
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voir la publicationInsertion Sequences as Highly Resolutive Genomic Markers for Sequence Type 1 Legionella pneumophila Paris
Journal of Clinical Microbiology . 49 ( 1 ) : 315-324
DOI: 10.1128/JCM.01261-10
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voir la publicationBiogeographical patterns of soil molecular microbial biomass
Ecology of soil microorganisms : microbes as important drivers of soil processes . : 1 p.
Acte de congrès
voir la publicationSoil fungal communities ecology: a biogeographical approach
Ecology of soil Microorganisms Conference . : 1 p.
Acte de congrès
voir la publicationBiogeographical patterns of soil microbial communities at the scale of French metropolitan territory
13. International Symposium on Microbial Ecology ISME 13 . : 1 p.
Acte de congrès
voir la publicationBiogeography of soil microbial communities: a review and a description of the ongoing french national initiative
Agronomy for Sustainable Development . 30 ( 2 ) : 359-365
DOI: 10.1051/agro/2009033
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voir la publicationBiogéographie Microbienne: mythe ou réalité ?
Ecologie 2010 . : n.p.
Acte de congrès
voir la publicationOnline Reproducible Research: An Application to Multivariate Analysis of Bacterial DNA Fingerprint Data
The R Journal . 2 ( 1 ) : 44-52
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voir la publicationA phylogenomic analysis of bacterial helix-turn-helix transcription factors
FEMS Microbiology Reviews . 33 ( 2 ) : 411-429
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voir la publicationBiogeographical patterns of soil bacterial communities
Environmental Microbiology Reports . 1 ( 4 ) : 251 - 255
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voir la publicationMonitoring the Development of Nurse Plant Species to Improve the Performances of Reforestation Programs in Mediterranean Areas
incollection . -- : 443-450
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voir la publicationAphylogenomic analysis of bacterial helix^turn^helix transcription factors
FEMS Microbiology Reviews . 33 : 411-429
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voir la publicationDistribution et déterminisme de la diversité des communautés de champignons telluriques à l'échelle de trois régions françaises
4ème colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne : le livre des résumés . : 91
Acte de congrès
voir la publicationControlled ectomycorrhization of an exotic legume tree species Acacia holosericea affects the structure of root nodule bacteria community and their symbiotic effectiveness on Faidherbia albida a native Sahelian Acacia
Soil Biology and Biochemistry . 41(6) : 1245-1252
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voir la publicationPatterns biogéographiques de la diversité bactérienne des sols à l'échelle du territoire national
Congrès AFEM (Association Francophone pour l'Ecologie Microbienne . : n.p.
Acte de congrès
voir la publicationMicrobial-biogeography at the scale of France by the use of molecular tools applied to the French soil quality monitoring network (RMQS)
BAGECO10 .
Acte de congrès
voir la publication