Equipe Ecologie Quantitative et Evolutive des Communautés
Thioulouse Jean
Directeur de recherche
CNRS
Batiment Mendel, 1er étage. Bureau 11.048
Page biblio: Vous pouvez visiter ma page biblio ici :https://jthome.thioulouse.fr/ref/
Recherche reproductible: Liste d'articles avec reproductibilité des calculs:
https://jthome.thioulouse.fr/Reproducible_Research/
https://pbil.univ-lyon1.fr/members/thioulouse/RRBibJT/
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=fr&user=1sjOJvSAAAAJO
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-7664-05980
IdHAL: https://cv.archives-ouvertes.fr/jean-thioulouse
ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Jean-Thioulouse
Livre ade4: Multivariate Analysis of Ecological Data with ade4
https://link.springer.com/book/10.1007/978-1-4939-8850-1
https://www.amazon.fr/Multivariate-Analysis-Ecological-Data-Ade4/dp/1493988484/
Reproductibilité de l'article Evol. Biol. 2021:
Overcoming the Spurious Groups Problem in Between-Group PCA
Activités de recherche
Mon activité de recherche est centrée sur l’innovation dans le domaine de la méthodologie statistique en biologie. Ces dernières années, je me suis plus particulièrement intéressé aux méthodes d’analyse statistique de la diversité bactérienne et de la diversité des macro−invertébrés aquatiques dans diverses conditions. J’ai cependant poursuivi des développements méthodologiques en informatiques, conduisant à la diffusion de logiciels, ainsi que des activités de consultation et de formation
Le package R ade4 :ade4
Le package R adegraphics :adegraphics
Le package R ade4TkGUI :ade4TkGUI
Publications
Affichage des publications 61 à 90 sur 153 au total
Le projet ECOMIC-RMQS ou comment faire de la microbiogéographie à l'échelle de la France
Journées d'animations scientifiques des ORE ACBB . : n.p.
Acte de congrès
voir la publicationArbuscular mycorrhizas and ectomycorrhizas of Uapaca bojeri L. (Euphorbiaceae): sporophore diversity patterns of root colonization and effects on seedling growth and soil microbial catabolic diversity
Mycorrhiza . 17 : 195-208
Article dans une revue
voir la publicationSoil functional diversity and P solubilization from rock phosphate after inoculation whith native or allochtonous arbuscular mycorrhizal fungi
Forest Ecology and Management . 241 ( 1-3 ) : 200-208
Article dans une revue
voir la publicationInfluence du type de sol et du mode d’occupation des sols sur la quantité d’ADN extraite et la densité des communautés bactériennes indigènes
AFEM (Association Francophone d'Ecologie Microbienne) . : n.p.
Poster
voir la publicationMicrobiogéographie à l'échelle du territoire national
AFEM (Association Francophone d'Ecologie Microbienne) . : n.p.
Acte de congrès
voir la publicationBiological control of Striga hermontica by Cubiterms mound powder amendment in sorghum culture
Applied Soil Ecology . 37 ( 3 ) : 175-183
Article dans une revue
voir la publicationImprovement of Cupressus atlantica Gaussen growth by inoculation with native arbuscular mycorrhizal fungi
Journal of Applied Ecology . 103 : 683-690
Article dans une revue
voir la publicationDetection of recombinant human erythropoietin in urine for doping analysis: interpretation of isoelectric profiles by discriminant analysis
Electrophoresis . 28 ( 12 ) : 1875-1881
Article dans une revue
voir la publicationInteractive Multivariate Data Analysis in R with the ade4 and ade4TkGUI Packages
Journal of Statistical Software . 22 : 1-14
Article dans une revue
voir la publicationArbuscular mycorrhizal symbiosis can counterbalance the negative influence of the exotic tree species Eucalyptus camaldulensis on the structure and functioning of soil microbial communities in a sahelian soil
FEMS Microbiology Ecology . 62 ( 1 ) : 32-44
Article dans une revue
voir la publicationThe Ectomycorrhizosphere Effect Influences Functional Diversity of Soil Microflora
International Journal of Soil Science . 1 : 8-19
Article dans une revue
voir la publicationDevelopment of cellular immune responses to Plasmodium falciparum blood stage antigens from birth to 36 months of age in Cameroon
Acta Tropica . 98 : 261-269
Article dans une revue
voir la publicationPotential of a 16S rRNA-based taxonomic microarray for analyzing the rhizosphere effects of maize on Agrobacterium spp. and bacterial communities
Applied and Environmental Microbiology . 72 ( 6 ) : 4302-4312
DOI: 10.1128/AEM.02686-05
Article dans une revue
voir la publicationBiological effects of native and exotic plant residues on plant growth microbial biomass and N availability under controlled conditions
European Journal of Soil Biology . 42 : 238-246
Article dans une revue
voir la publicationLitter-forager termite mounds enhance the ectomycorrhizal symbiosis between Acacia holosericea A. Cunn. Ex G. Don and Scleroderma dictyosporum isolates
FEMS Microbiology Ecology . 56 : 292-303
Article dans une revue
voir la publicationA multivariate approach to integrating Datasets using made4 and ade4
R News . -- : 1-15
Article dans une revue
voir la publicationDisplacement of an herbaceous plant species community by mycorrhizal and non-mycorrhizal Gmelina arborea, an exotic tree, grown in a microcosm experiment
Mycorrhiza . 16 ( 2 ) : 125-132
Article dans une revue
voir la publicationFluorescent pseudomonads occuring in Macrotermes subhyalinus mound structures decrease Cd toxicity and improve its accumulation in sorghum plants
Science of the Total Environment . 370 : 391-400
Article dans une revue
voir la publicationLavandula species as accompanying plants in Cupressus replanting strategies : Effect on plant growth mycorrhizal soil infectivity and soil microbial catabolic diversity
Applied Soil Ecology . -- : 190-199
Article dans une revue
voir la publicationIdentification of Genomic Species in Agrobacterium Biovar 1 by AFLP Genomic Markers
Applied and Environmental Microbiology . 72 ( 11 ) : 7123-7131
DOI: 10.1128/AEM.00018-06
Article dans une revue
voir la publicationPotential of a 16S rRNA-Based Taxonomic Microarray for Analyzing the Rhizosphere Effects of Maize on Agrobacterium spp. and Bacterial Communities
Applied and Environmental Microbiology . 72 ( 6 ) : 4302-4312
DOI: 10.1128/AEM.02686-05
Article dans une revue
voir la publicationLavendula species as accompanying plants in Cupressus replanting strategies: Effect on plant growth, mycorrhizal soil infectivity and soil microbial catabolic diversity
Applied Soil Ecology . 34 ( 2-3 ) : 190-199
Article dans une revue
voir la publicationRelationships between plant-parasitic nematode community fallow duration and soil factors in the Sudano-Sahelian area of Senegal
Agriculture, Ecosystems & Environment . 108 : 302-317
Article dans une revue
voir la publicationThe mycorrhizal fungus Glomus intraradices and rock phosphate amendment influence plant growth and microbial activity in the rhizosphere of Acacia holosericea
Soil Biology and Biochemistry . 37 : 1460-1468
Article dans une revue
voir la publicationSoil bacterial diversity responses to root colonization by an ectomycorrhizal fungus are not root-growth dependent
Microbial ecology . 50 : 350-359
Article dans une revue
voir la publicationOnline synonymous codon usage analyses with the ade4 and seqinR packages
Bioinformatics . 21 : 545-547
Article dans une revue
voir la publicationFunctional diversity of soil microbial community, rock phosphate dissolution and growth of Acacia seyal as influenced by grass-litter and soil-feeding termite nest structure amendments
Geoderma . 124 : 349-361
Article dans une revue
voir la publicationMADE4: an R package for multivariate analysis of gene expression data
Bioinformatics . 21 : 2789-2790
Article dans une revue
voir la publicationSimultaneous analysis of a sequence of paired ecological tables with the STATICO method
Ecology . 85 : 272-283
Article dans une revue
voir la publicationThe ade4 package - I : One-table methods
R News . 4 : 5-10
Article dans une revue
voir la publication