Equipe Ecologie Quantitative et Evolutive des Communautés
Thioulouse Jean
Directeur de recherche
CNRS
Batiment Mendel, 1er étage. Bureau 11.048
Page biblio: Vous pouvez visiter ma page biblio ici :https://jthome.thioulouse.fr/ref/
Recherche reproductible: Liste d'articles avec reproductibilité des calculs:
https://jthome.thioulouse.fr/Reproducible_Research/
https://pbil.univ-lyon1.fr/members/thioulouse/RRBibJT/
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=fr&user=1sjOJvSAAAAJO
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-7664-05980
IdHAL: https://cv.archives-ouvertes.fr/jean-thioulouse
ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Jean-Thioulouse
Livre ade4: Multivariate Analysis of Ecological Data with ade4
https://link.springer.com/book/10.1007/978-1-4939-8850-1
https://www.amazon.fr/Multivariate-Analysis-Ecological-Data-Ade4/dp/1493988484/
Reproductibilité de l'article Evol. Biol. 2021:
Overcoming the Spurious Groups Problem in Between-Group PCA
Activités de recherche
Mon activité de recherche est centrée sur l’innovation dans le domaine de la méthodologie statistique en biologie. Ces dernières années, je me suis plus particulièrement intéressé aux méthodes d’analyse statistique de la diversité bactérienne et de la diversité des macro−invertébrés aquatiques dans diverses conditions. J’ai cependant poursuivi des développements méthodologiques en informatiques, conduisant à la diffusion de logiciels, ainsi que des activités de consultation et de formation
Le package R ade4 :ade4
Le package R adegraphics :adegraphics
Le package R ade4TkGUI :ade4TkGUI
Publications
Affichage des publications 121 à 150 sur 167 au total
Experimental and theoretical evaluation of typing methods based upon random amplification of genomic restriction fragments (AFLP) for bacterial population genetics
Genetics Selection Evolution . 33 : S319-S338
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voir la publicationCharacterization of bacterial and fungal soil communities by automated ribosomal intergenic spacer analysis fingerprints: biological and methodological variability.
Applied and Environmental Microbiology . 67 ( 10 ) : 4479-87
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voir la publicationMycorrhizal soil infectivity and AM fungal spore communities of different aged fallows in Senegal
Applied Soil Ecology . 17 : 239-251
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voir la publicationExperimental and theoretical evaluation of typing methods based upon random amplification of genomic restriction fragments (AFLP) for bacterial population genetics
Genetics Selection Evolution . 33 ( 1 ) : 319-338
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voir la publicationCharacterization of bacterial and fungal soil communities by automated ribosomal intergenic spacer analysis fingerprints : biological and methodological variability
Applied and Environmental Microbiology . 67 ( 10 ) : 4479-4487
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voir la publicationThe mycorrhizal soil infectivity and arbuscular mycorrhizal fungal spore communities in soils of different aged fallows in Senegal
Applied Soil Ecology . 17 : 239-251
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voir la publicationRelationships between abiotic and biotic soil properties during fallow periods in the sudanian zone of Senegal
Applied Soil Ecology . 14 : 89-101
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voir la publicationSuccessional trends in the characteristics of soil nematodes communities in cropped and fallow lands in Senegal (Sonkorong)
Applied Soil Ecology . 14 : 5-15
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voir la publicationA soil microscale study to reveal the heterogeneity of Hg (II) impact on indigenous bacteria by quantification of adapted phenotypes and analysis of community DNA fingerprints
FEMS Microbiology Ecology . 31 : 107-115
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voir la publicationRecherche de méthodes de gestion des peuplements de nématodes phytoparasites par les facteurs du sol en zone soudano-sahélienne au Sénégal
Étude et Gestion des Sols . 7 ( 4 ) : 261-270
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voir la publicationA soil microscale study to reveal the heterogeneity of Hg(II) impact on indigenous bacteria by quantification of adapted phenotypes and analysis of community DNA fingerprints
FEMS Microbiology Ecology . 31 ( 2 ) : 107-115
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voir la publicationEctomycorrhization of six Acacia auriculiformis provenances from Australia Papua New Guinea and Senegal in glasshouse conditions: effect on the plant growth and on the multiplication of plant parasitic nematodes
Australian Journal of Experimental Agriculture . 40 : 443-450
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voir la publicationHeterogeneous Cell Density and Genetic Structure of Bacterial Pools Associated with Various Soil Microenvironments as Determined by Enumeration and DNA Fingerprinting Approach (RISA)
Microbial ecology . 39 : 263-272
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voir la publicationDiversity of the bacterial hyperparasite Pasteuria penetrans in relation to the control of root-knot nematodes (Meloidogyne spp.) on Acacia holosericea
Nematology . 2 : 435-442
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voir la publicationIdentification of birds as biological markers along a neotropical urban-rural gradient using co-inertia analysis
Journal of Environmental Management . 59 : 121-140
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voir la publicationHeterogeneous cell density and genetic structure of bacterial pools associated with various microenvironments as determined by enumeration and DNA fingerprinting approach (RISA)
Microbial ecology . 39 : 263-272
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voir la publicationApproche qualitative et quantitative de l'effet de la jachère sur des populations de champignons mycorhiziens à arbuscules
Le sol, milieu vivant : fonctionnement et gestion .
Acte de congrès
voir la publicationSusceptibility of several sahelian Acacia to Meloidogyne javanica (Treub) Chitw
Agroforestry Systems . 46 : 123-130
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voir la publicationEcology of larval mosquitoes with special reference to Anopheles arabiensis (Diptera: Culcidae) in market-garden wells in urban Dakar Senegal
Journal of Medical Entomology . 35 : 948-955
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voir la publicationADE-4 Software: a tool for multivariate analysis and graphical display
Océanis : Série de documents océanographiques . 24 ( 4 ) : 393-416
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationIdentification of soil factors that relate to the structure of the plant parasitic nematode community
Applied Soil Ecology . 8 : 35-49
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voir la publicationFunctional data analysis of curve asymmetry with application to the color pattern of Hydropsyche contubernalis head capsule
Biometrics . 53 : 294-305
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voir la publicationADE-4: a multivariate analysis and graphical display software
Statistics and Computing . 7 : 75-83
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voir la publicationNetMul a World-Wide Web user interface for multivariate analysis sofware
Computational Statistics and Data Analysis . 21 : 369-372
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voir la publicationOn-line tools for sequence retrieval and multivariate statistics in molecular biology
Computer Applications in the Biosciences . 12 : 63-69
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voir la publicationCorrespondence discriminant analysis: a multivariate method for comparing classes of protein and nucleic acid sequences
Computer Applications in the Biosciences . 12 : 519-524
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voir la publicationTowards Better Graphics for Multivariate Analysis: the Interactive Factor Map
Computational Statistics and Data Analysis . 11 : 11-21
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voir la publicationCo-inertia analysis of amino-acid physico-chemical properties and protein composition with the ADE package
Bioinformatics . 11 : 321-329
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voir la publicationDE software: multivariate analysis and graphical display of environmental data
incollection . -- : 57-62
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voir la publicationMultivariate analysis of spatial patterns: a unified approach to local and global structures
Environmental and Ecological Statistics . 2 : 1-14
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