GECO Génomique Computationnelle et Evolutive
Publications
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A divide-and-conquer phylogenomic approach based on character supermatrices resolves early steps in the evolution of the Archaea
BMC Ecology and Evolution . 22 ( 1 ) : 1-12
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voir la publicationA family of tree-based generators for bubbles in directed graphs
Journal of Graph Algorithms and Applications . 25 ( 1 ) : 549-562
DOI: 10.7155/jgaa.00571
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voir la publicationA Bayesian Mutation–Selection Framework for Detecting Site-Specific Adaptive Evolution in Protein-Coding Genes
Molecular Biology and Evolution . 38 ( 3 ) : 1199-1208
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voir la publicationUniversal probabilistic programming offers a powerful approach to statistical phylogenetics
Communications Biology . 4 ( 1 )
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voir la publicationQuantifying the impact of changes in effective population size and expression level on the rate of coding sequence evolution
Theoretical Population Biology . 142 : 57-66
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voir la publicationInferring Long-Term Effective Population Size with Mutation–Selection Models
Molecular Biology and Evolution . 38 ( 10 ) : 4573-4587
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voir la publicationReconstructing the History of Variation in Effective Population Size along Phylogenies
Genome Biology and Evolution . 13 ( 8 )
DOI: 10.1093/gbe/evab150
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voir la publicationLong-Lived Species of Bivalves Exhibit Low MT-DNA Substitution Rates
Frontiers in Molecular Biosciences . 8
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voir la publicationNatural Selection beyond Life? A Workshop Report
Life . 11 ( 10 ) : 1051
DOI: 10.3390/life11101051
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voir la publicationA derived ZW chromosome system in Amborella trichopoda, representing the sister lineage to all other extant flowering plants
New Phytologist .
DOI: 10.1111/nph.17662
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voir la publicationThe Transposable Element Environment of Human Genes Differs According to Their Duplication Status and Essentiality
Genome Biology and Evolution . 13 ( 5 )
DOI: 10.1093/gbe/evab062
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voir la publicationMassive colonization of protein-coding exons by selfish genetic elements in Paramecium germline genomes
Plos Biology . 19 ( 7 ) : e3001309
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voir la publicationMassive colonization of protein-coding exons by selfish genetic elements in Paramecium germline genomes
Plos Biology . 19 ( 7 ) : e3001309
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voir la publicationTransposable element activity in the transcriptomic analysis of mouse pancreatic tumors
Pré-publication
voir la publicationReconstruction of body mass evolution in the Cetartiodactyla and mammals using phylogenomic data.
Peer Community Journal . 1 : e42
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voir la publicationA General Framework for Enumerating Equivalence Classes of Solutions
ESA 2021 - 29th Annual European Symposium on Algorithms . : 1-14
Acte de congrès
voir la publicationMale differentiation in the marine Copepod $Oithona\ nana$ reveals the development of a new nervous ganglion and Lin12-Notch-repeat protein-associated proteolysis
Biology . 10 ( 7 ) : 657
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voir la publicationMaking Sense of a Cophylogeny Output: Efficient Listing of Representative Reconciliations
WABI 2021 - 21st International Workshop on Algorithms in Bioinformatics . : 1-18
Acte de congrès
voir la publicationA Comprehensive Evolutionary Scenario of Cell Division and Associated Processes in the Firmicutes
Molecular Biology and Evolution . 38 ( 6 ) : 2396-2412
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voir la publicationClimatic change and diet of the pre-Hispanic population of Gran Canaria (Canary Archipelago, Spain) during the Medieval Warm Period and Little Ice Age
Journal of Archaeological Science . 128 : 105336
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voir la publicationDetecting sex-linked genes using genotyped individuals sampled in natural populations
Genetics . 218 ( 2 )
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voir la publicationPlant genera Cannabis and Humulus share the same pair of well-differentiated sex chromosomes
New Phytologist . 231 ( 4 ) : 1599-1611
DOI: 10.1111/nph.17456
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voir la publicationResurrection of Ancestral Malate Dehydrogenases Reveals the Evolutionary History of Halobacterial Proteins : Deciphering Gene Trajectories and Changes in Biochemical Properties
Molecular Biology and Evolution . : 1-44
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voir la publicationA comprehensive evaluation of binning methods to recover human gut microbial species from a non-redundant reference gene catalog
NAR Genomics and Bioinformatics . 3 ( 1 )
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voir la publicationDILS: Demographic inferences with linked selection by using ABC
Molecular Ecology Resources .
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voir la publicationComplete genome of Bradyrhizobium sp. strain BDV5419, representative of Australian genospecies L
Microbiology Resource Announcements . 10 ( 8 ) : e00042-21
DOI: 10.1128/MRA.00042-21
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voir la publicationOf Evolution, Systems and Complexity
Evolutionary Systems Biology II .
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationComplete Genome Sequence of Bradyrhizobium sp. Strain BDV5040, Representative of Widespread Genospecies B in Australia
Microbiology Resource Announcements . 10 ( 3 ) : e01326-20
DOI: 10.1128/MRA.01326-20
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