GECO Génomique Computationnelle et Evolutive
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Computing Thermodynamically Consistent Elementary Flux Modes with Answer Set Programming
CMSB 2024 - 22nd International Conference Computational Methods in Systems Biology . LNCS-14971 : 80-88
Acte de congrès
voir la publicationA genome-wide study of ruminants reveals two endogenous retrovirus families still active in goats
Pré-publication
voir la publicationSMBE Secretary’s Report
Molecular Biology and Evolution . 41 ( 6 )
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voir la publicationLook4LTRs: a Long terminal repeat retrotransposon detection tool capable of cross species studies and discovering recently nested repeats
Mobile DNA . 15 ( 1 ) : 8
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voir la publicationDiversité et diversification des Pectobacteriaceae, une famille de bactéries phytopathogènes d’importance mondiale
Cahiers Scientifiques de la Fondation Pierre Vérots . ( 10 ) : 19-29
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voir la publicationISMB/ECCB 2023 organization benefited from the strengths of the French bioinformatics community
Bioinformatics Advances . 4 ( 1 ) : vbae040
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voir la publicationBradyrhizobium hardenbergiae sp. nov., isolated from Hardenbergia violacea in Australia, represents a novel basal lineage of the B. elkanii supergroup
Pré-publication
voir la publicationA Wright–Fisher graph model and the impact of directional selection on genetic variation
Theoretical Population Biology . 159 : 13-24
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voir la publicationInvestigating demic versus cultural diffusion and sex bias in the spread of Austronesian languages in Vietnam
PLoS ONE . 19 ( 6 ) : e0304964
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voir la publicationComplete mitochondrial genomes of patients from Thailand with cardiovascular diseases
PLoS ONE . 19 ( 7 ) : e0307036
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voir la publicationGTDrift: a resource for exploring the interplay between genetic drift, genomic and transcriptomic characteristics in eukaryotes
NAR Genomics and Bioinformatics . 6 ( 2 ) : lqae064
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voir la publicationLogic programming-based Minimal Cut Sets reveal consortium-level therapeutic targets for chronic wound infections
npj Systems Biology and Applications . 10 ( 1 ) : 34
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voir la publicationRegulatory and evolutionary impact of DNA methylation in two songbird species and their naturally occurring F1 hybrids
BMC Biology . 22 ( 1 ) : 124
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voir la publicationHigh prevalence of PRDM9-independent recombination hotspots in placental mammals
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 121 ( 23 ) : e2401973121
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voir la publicationLncRNA analyses reveal increased levels of non-coding centromeric transcripts in hepatocellular carcinoma
Pré-publication
voir la publicationPersistent homology reveals strong phylogenetic signal in 3D protein structures
PNAS Nexus . 3 ( 4 ) : 158
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voir la publicationThe genetic legacy of the expansion of Bantu-speaking peoples in Africa
Nature . 625 ( 7995 ) : 540–547
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voir la publicationPRDM9 drives the location and rapid evolution of recombination hotspots in salmonids
Pré-publication
voir la publicationThe role of recombination dynamics in shaping signatures of direct and indirect selection across the Ficedula flycatcher genome †
Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 291 ( 2015 )
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voir la publicationEvidence that genetic drift not adaptation drives fast‐Z and large‐Z effects in Ficedula flycatchers
Molecular Ecology .
DOI: 10.1111/mec.17262
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voir la publicationDescription of a new genus of the Pectobacteriaceae family isolated from water in coastal brackish wetlands of the French Camargue region, Prodigiosinella gen. nov., including the new species Prodigiosinella aquatilis sp. nov
Systematic and Applied Microbiology . 47 ( 2-3 ) : 126497
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voir la publicationMicroAnnot: A Dedicated Workflow for Accurate Microsporidian Genome Annotation
International Journal of Molecular Sciences . 25 ( 2 ) : 880
DOI: 10.3390/ijms25020880
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voir la publicationIdentification and quantification of transposable element transcripts using Long-Read RNA-seq in Drosophila germline tissues
Peer Community Journal . 4 ( e89 )
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voir la publicationRandom genetic drift sets an upper limit on mRNA splicing accuracy in metazoans
eLife . 13 : RP93629
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voir la publicationDe novo analysis of splicing from RNA-seq data: models, algorithms and applications
Mitigation of the diagenesis risk in biological apatite δ18O interpretation
Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology . 630 : 111812
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voir la publicationδ2H and δ18O of river water from a high-altitude humid plain of the southern Alps: Implications for the interpretation of the isotopic compositions of bioapatite from humans living close to mountain areas
Journal of Archaeological Science: Reports . 49 : 104020
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voir la publicationGenomic portrait and relatedness patterns of the Iron Age Log Coffin culture in northwestern Thailand
Nature Communications . 14 ( 1 ) : 8527
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voir la publicationGenome-wide variation in the Angolan Namib Desert reveals unique pre-Bantu ancestry
Science Advances . 9 ( 38 )
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