GECO Génomique Computationnelle et Evolutive
Publications
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Polynomial Delay Algorithm for Minimal Chordal Completions
49th International Colloquium on Automata, Languages, and Programming (ICALP) .
Acte de congrès
voir la publicationMutations in the non-coding RNU4ATAC gene affect the homeostasis and function of the Integrator complex
Nucleic Acids Research .
DOI: 10.1093/nar/gkac1182
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voir la publicationGeometric programming to Solve Optimal Concentrations of Metabolites and Enzymes in Constraint-based modelling
International Conference on System Biology .
Acte de congrès
voir la publicationSpecial Issue on “Frontiers in Connecting Steady-State and Dynamic Approaches for Modelling Cell Metabolic Behavior”
Processes . 10 ( 8 ) : 1612
DOI: 10.3390/pr10081612
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voir la publicationHybrid metabolic modeling to identify new control strategies of living organisms
Hybrid models and methods in systems medicine .
Acte de congrès
voir la publicationMod ́elisation m ́etabolique pour identifier de nouvelles strat ́egies de contrˆole des organismes vivants
Meetochondrie .
Acte de congrès
voir la publicationGenes and sites under adaptation at the phylogenetic scale also exhibit adaptation at the population-genetic scale
Pré-publication
voir la publicationThe birth-death diffusion leading to present-day Mammal diversity
Pré-publication
voir la publicationBrumiR: A toolkit for de novo discovery of microRNAs from sRNA-seq data
GigaScience . 11
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voir la publicationCodiversification of gut microbiota with humans
Science . 377 ( 6612 ) : 1328-1332
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voir la publicationProtein conformational space at the edge of allostery: turning a nonallosteric malate dehydrogenase into an “allosterized” enzyme using evolution-guided punctual mutations
Molecular Biology and Evolution . 39 ( 9 ) : msac186
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voir la publicationGOntact: using chromatin contacts to infer Gene Ontology enrichments for cis -regulatory elements
Pré-publication
voir la publicationAn Improved Codon Modeling Approach for Accurate Estimation of the Mutation Bias
Molecular Biology and Evolution . 39
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voir la publicationIdentifying the best approximating model in Bayesian phylogenetics: Bayes factors, cross-validation or wAIC?
Pré-publication
voir la publicationEfficiently sparse listing of classes of optimal cophylogeny reconciliations
Algorithms for Molecular Biology . 17 ( 1 ) : 1-16
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voir la publicationTotoro: Identifying Active Reactions During the Transient State for Metabolic Perturbations
Frontiers in Genetics . 13 : 1-12
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voir la publicationRecent Bioinformatic Progress to Identify Epigenetic Changes Associated to Transposable Elements
Frontiers in Genetics . 13
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voir la publicationCALDERA: Finding all significant de Bruijn subgraphs for bacterial GWAS
Bioinformatics .
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voir la publicationA divide-and-conquer phylogenomic approach based on character supermatrices resolves early steps in the evolution of the Archaea
BMC Ecology and Evolution . 22 ( 1 ) : 1-12
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voir la publicationLong-range promoter–enhancer contacts are conserved during evolution and contribute to gene expression robustness
Genome Research . 32 ( 2 ) : 280-296
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voir la publicationExploring correlations in genetic and cultural variation across language families in northeast Asia
Science Advances . 7 ( 34 )
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voir la publicationVariation of microRNA expression in the human placenta driven by population identity and sex of the newborn
BMC Genomics . 22 : 286
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voir la publicationReconstructing the Human Genetic History of Mainland Southeast Asia: Insights from Genome-Wide Data from Thailand and Laos
Molecular Biology and Evolution . 38 ( 8 ) : 3459 - 3477
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voir la publicationGenomic insights into population history and biological adaptation in Oceania
Nature . 592 ( 7855 ) : 583-589
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voir la publicationThe genomic prehistory of peoples speaking Khoisan languages
Human Molecular Genetics . 30 ( 2 ) : R49-R55
DOI: 10.1093/hmg/ddaa221
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voir la publicationPositive selection plays a major role in shaping signatures of differentiation across the genomic landscape of two independent Ficedula flycatcher species pairs
Evolution - International Journal of Organic Evolution . 75 ( 9 ) : 2179-2196
DOI: 10.1111/evo.14234
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voir la publicationThe Effects of GC-Biased Gene Conversion on Patterns of Genetic Diversity among and across Butterfly Genomes
Genome Biology and Evolution . 13 ( 5 )
DOI: 10.1093/gbe/evab064
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voir la publicationLes isotopes de l'hydrogène contenus dans les tissus osseux et dentaires de populations archéologiques et leurs usages comme proxys paléoclimatiques et paléoalimentaires
27e édition de la Réunion des Sciences de la Terre .
Acte de congrès
voir la publicationAnswer set programming to compute constraint elementary flux modes
Computational Methods in System Biology .
Acte de congrès
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