Equipe Génétique et Evolution des Interactions

Membres

Les systèmes vivants sont constitués d’une multitude de niveaux d'organisation imbriqués, impliquant coopération et conflits. La coopération et la sélection de systèmes fonctionnant de manière coordonnée a permis des transitions évolutives dites “majeures”, vers de nouvelles échelles d'individualité, comme la cellule eucaryote. Néanmoins, la sélection naturelle continue à opérer à toutes les échelles, générant de possibles conflits évolutifs entre les différentes composantes de l’individu.

Nos recherches s’inscrivent dans cette perspective, et visent à mieux comprendre la nature et les implications évolutives des interactions entre les multiples composantes des organismes, du gène aux bactéries symbiotiques, en passant par les virus et les éléments transposables. Nous explorons également l’impact de ces interactions sur la dynamique de l’information génétique, à travers le transfert horizontal, ou sur l’innovation génétique et l’adaptation, à travers la domestication. Nos recherches, essentiellement expérimentales, mais également théoriques, sont mises en œuvre sur des modèles arthropodes, et relèvent principalement de la génétique et la génomique évolutive.

L'équipe est structurée en deux grands axes:

  • Interactions intra-génomiques : les éléments transposables (resp. Marie Fablet)
    • Ex1: La dynamique évolutive des éléments transposables (ET) dans les génomes, en lien avec leur variabilité naturelle. Nous utilisons pour modèles des populations naturelles de Drosophila melanogaster et D. simulans, ainsi que des espèces d’intérêt agronomique ou sociétal, telles que l’espèce envahissante D. suzukii ou le moustique tigre Aedes albopictus.
    • Ex2: Les interactions entre le contrôle des ET et l’immunité anti-virale. Nous étudions les mécanismes moléculaires d’interférence ARN à l’origine de l’intrication de ces deux processus, ainsi que les implications co-évolutives, à l’aide d’infections expérimentales de différents virus sur plusieurs lignées de drosophiles.
    • Personnes impliquées : CV, MB, MF
  • La symbiose, moteur de l’évolution (resp. Natacha Kremer)
    • Ex1: Certaines bactéries symbiotiques apportent des capacités métaboliques dont l’insecte est dépourvu. Nous analysons ces interactions chez des insectes hématophages (punaise de lits, tiques) et phytophages (l’aleurode Bemisia tabaci) par des approches combinant analyse des phénotypes, génétique, physiologie et métabolomique.
    • Ex2: Les insectes parasitoïdes ont domestiqué des gènes viraux leur permettant de contourner les réponses immunitaire de leurs hôtes. Nous étudions la fréquence et la signification adaptative de ces évènements et, plus généralement, nous recherchons les facteurs structurant les transferts horizontaux dans les communautés hôtes-parasitoïdes.
    • Personnes impliquées : NK, LM, LZ, JMD, JV, FV, SC

 

 

 

 

Publications

Affichage des publications 241 à 270 sur 444 au total

Mod/Resc Parsimony Inference: Theory and application

Igor Nor, Danny Hermelin, Sylvain Charlat, Jan Engelstadter, Max Reuter, Olivier Duron...

Information and Computation . 213 : 23-32

DOI: 10.1016/j.ic.2011.03.008

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International Congress on Transposable Elements (ICTE) 2012 in Saint Malo and the sea of TE stories.

Abdelkader Aïnouche, Mireille Bétermier, Mick Chandler, Richard Cordaux, Gaël Cristofari, Jean-Marc Deragon...

Mobile DNA . 3 ( 1 ) : 17

DOI: 10.1186/1759-8753-3-17

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Transposon proliferation in an asexual parasitoid.

Ken Kraaijeveld, Brechtje Zwanenburg, Benjamin Hubert, Cristina Vieira, Sylvia de Pater, Jacques J.M. van Alphen...

Molecular Ecology . 21 ( 16 ) : 3898-3906

DOI: 10.1111/j.1365-294X.2012.5582.x

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High-resolution melting technology: a new tool for studying the Wolbachia endosymbiont diversity in the field.

H. Henri, Laurence Mouton

Molecular Ecology Resources . 12 ( 1 ) : 75-81

DOI: 10.1111/j.1755-0998.2011.03064.x

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Influence of Wolbachia on host gene expression in an obligatory symbiosis.

Natacha Kremer, Delphine Charif, Hélène Henri, Frédérick F. Gavory, Patrick Wincker, Patrick Mavingui...

BMC Microbiology . 12 ( Suppl 1 ) : 1-16

DOI: 10.1186/1471-2180-12-S1-S7

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Survey of Wolbachia and Its Phage WO in the Uzifly Exorista sorbillans (Diptera: Tachinidae)

Nm. Guruprasad, Laurence Mouton, P Sumithra, Hp. Puttaraju

Current Microbiology . 63 : 267-272

DOI: 10.1007/s00284-011-9973-6

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Cloning of the unculturable parasite Pasteuria ramosa and its Daphnia host reveals extreme genotype-genotype interactions: Cloning reveals extreme host specificity

Pepijn Luijckx, Frida Ben-Ami, Laurence Mouton, Louis Du Pasquier, Dieter Ebert

Ecology Letters . 14 ( 2 ) : 125-131

DOI: 10.1111/j.1461-0248.2010.01561.x

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Effect of Wolbachia infection and temperature variations on the fecundity of the Uzifly Exorista sorbillans (Diptera: Tachinidae)

N. M. Guruprasad, Laurence Mouton, H. P. Puttaraju

Symbiosis . 54 : 151-158

DOI: 10.1007/s13199-011-0138-y

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Characterisation of a large family of polymorphic collagen-like proteins in the endospore-forming bacterium Pasteuria ramosa

K. Mcelroy, Laurence Mouton, L. Du Pasquier, Q. Weihong, E. Dieter

Research in Microbiology . 162 : 701-714

DOI: 10.1016/j.resmic.2011.06.009

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Side effects of fungicides on the abundance and the species diversity of the natural populations of Drosophila and their hymenopterous parasitoids in orchards

J-M. Delpuech, Roland Allemand

Phytoparasitica . 39 : 429-435

DOI: 10.1007/s12600-011-0180-6

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Does a parthenogenesis-inducing Wolbachia induce vestigial cytoplasmic incompatibility?

Ken Kraaijeveld, Barbara M Reumer, Laurence Mouton, Natacha Kremer, Fabrice Vavre, Jacques J.M. van Alphen

The Science of Nature Naturwissenschaften . 98 ( 3 ) : 175-80

DOI: 10.1007/s00114-010-0756-x

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RNA-seq without a reference genome: a comparison of the mapping and the assembly approaches

M.-C. Carpentier, J. Charif, Vincent Lacroix, Marie-France Sagot, Fabrice Vavre

JOBIM .

Acte de congrès

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Rickettsia ‘In’ and ‘Out’: Two Different Localization Patterns of a Bacterial Symbiont in the Same Insect Species

Ayelet Caspi-Fluger, Moshe Inbar, Netta Mozes-Daube, Laurence Mouton, Martha Hunter, Einat Zchori-Fein

PLoS ONE . 6 ( 6 )

DOI: 10.1371/journal.pone.0021096

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Effect of Wolbachia infection and temperature variations on the fecundity of the Uzifly Exorista sorbillans (Diptera: Tachinidae)

N.M. Guruprasad, L. Mouton, H.P. Puttaraju

Symbiosis . 54 : 151-158

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Evolvability, epigenetics and transposable elements

Marie Fablet, C. Vieira

Biomolecular concepts . 2 : 333-341

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Isolation and gene flow: inferring the speciation history of European house mice

Ludovic Duvaux, Khalid Belkhir, Matthieu Boulesteix, Pierre Boursot

Molecular Ecology . 20 ( 24 ) : 5248-5264

DOI: 10.1111/j.1365-294X.2011.05343.x

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Bacterial symbionts in insects or the story of communities affecting communities.

Julia Ferrari, Fabrice Vavre

Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 366 ( 1569 ) : 1389-400

DOI: 10.1098/rstb.2010.0226

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Intraspecific specialization of the generalist parasitoid Cotesia sesamiae revealed by polyDNAvirus polymorphism and associated with different Wolbachia infection.

Antoine Branca, Bruno Pierre Le Ru, Fabrice Vavre, Jean-François Silvain, Stéphane Dupas

Molecular Ecology . 20 ( 5 ) : 959-71

DOI: 10.1111/j.1365-294X.2010.04977.x

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Endosymbionts of arthropods and nematodes: allies to fight infectious diseases?

Fabrice Vavre, Patrick Mavingui

Médecine/Sciences . 27 ( 11 ) : 953-958

DOI: 10.1051/medsci/20112711010

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Survey of Wolbachia and Its Phage WO in the Uzifly texitExorista sorbillans (Diptera: Tachinidae)

Nm. Guruprasad, L. Mouton, / Sumithra, Hp. Puttaraju

Current Microbiology . 63 : 267-272

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Isolation and gene flow: inferring the speciation history of European house mice

Ludovic Duvaux, K. Belkhir, Matthieu Boulesteix, P. Boursot

Molecular ecology . 20 : 5248-5264

DOI: 10.1111/j.1365-294X.2011.05343.x

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Wolbachia detection: an assessment of standard PCR protocols.

P. M. Simões, G. Mialdea, D. Reiss, Marie-France Sagot, S. Charlat

Molecular Ecology Resources . 11 ( 3 ) : 567-72

DOI: 10.1111/j.1755-0998.2010.02955.x

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Vertical inheritance and bursts of transposition have shaped the evolution of the BS non-LTR retrotransposon in Drosophila.

Adriana Granzotto, Fabrício R Lopes, Cristina Vieira, Claudia M A Carareto

Molecular Genetics and Genomics . 286 ( 1 ) : 57-66

DOI: 10.1007/s00438-011-0629-9

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Comparative analysis of transposable elements in the melanogaster subgroup sequenced genomes.

Emmanuelle Lerat, Nelly Burlet, Christian Biémont, Cristina Vieira

Gene . 473 ( 2 ) : 100-9

DOI: 10.1016/j.gene.2010.11.009

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Les Ressources

Jean-Paul Bravard, Ioan Negrutiu, Natalia del Fatti, Cristina Vieira

Actes du Colloque de l'Institut Universitaire de France . : 356 p.

Acte de congrès

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Medicago truncatula contains a second gene encoding a plastid located glutamine synthetase exclusively expressed in developing seeds

Ana Seabra, Cristina Vieira, Julie Vera Cullimore, Helena Carvalho

BMC Plant Biology . 10 ( 183 ) : 16 p.

DOI: 10.1186/1471-2229-10-183

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Induction by Chlorpyrifos of the Confusion of Males in Discriminating Female Sexual Pheromones Used for Mate Finding by Two Sympatric Trichogramma Species (Hymenoptera: Trichogrammatidae)

Celine Dupont, R. Allemand, Jean-Marie Delpuech

Environmental Entomology . 39 ( 2 ) : 535-544

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Decrease in Fecundity Induced by Interspecific Mating Between Two Trichogramma Parasitoid Species

Jean-Marie Delpuech, Celine Dupont, R. Allemand

Journal of Economic Entomology . 103 ( 2 ) : 308-313

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Mod/Resc Parsimony Inference

Igor Nor, Danny Hermelin, Sylvain Charlat, Jan Engelstadter, Max Reuter, Olivier Duron...

Combinatorial Pattern Matching . 6129 : 202--213

DOI: 10.1007/978-3-642-13509-5_19

Acte de congrès

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