COEVOL Coévolution Multi-Echelles
Equipe Génétique et Evolution des Interactions
Varaldi Julien
Maître de conférences
UCBL
Mon travail porte sur la génétique évolutive des insectes. Je développe actuellement quatre thématiques principales:
- Les organismes sont confrontés à de nombreuses infections virales au cours de leur vie. Bien que les virus sont connus pour leurs effets pathogènes, un certain nombre d’entre eux, sous étudiés, révèlent des effets plus subtils, et sont potentiellement héritables. Nous avons découvert un tel virus chez une guêpe parasitoïde dont l'effet principal est de manipuler le comportement de ponte de la guêpe, favorisant ainsi sa transmission horizontale. Ce virus s'est avéré être le premier membre d'une nouvelle de virus, les Filamentoviridae, qui infectent en réalité de nombreux insectes parasitoïdes (Guinet et al. 2024). Nous étudions la distribution, diversité et les impacts phénotypiques de ces virus.
- Au cours de l'évolution, des séquences de ces virus ont pu s’intégrer dans les chromosomes de leurs hôtes (que l'intégration fasse partie de leur cycle naturel ou non). Certaines de ces insertions, ont permis des innovations génétiques majeures comme illustré par l'"invention" du placenta chez les mammifères. Chez les hymenoptères parasitoïdes, qui vivent en parasites d'autres insectes, plusieurs clades ont "domestiqués" des virus, ce qui leur permet aujourd’hui d'adresser des facteurs de virulence à leurs hôtes. Ces virus endogénisés sont actuellement nécessaires au bon développement des parasitoïdes. Les premiers cas documentés jusque-là concernaient la superfamille des Ichneumonoidea. Notre travail récent a révélé des phénomènes similaires, bien que complètement indépendants, dans d'autres superfamilles, impliquant notamment les Filamentoviridae (Di Giovanni et al. 2020, Guinet et al. 2023, 2025). Un des enjeux est de définir l’étendue et l’impact évolutif de ces domestications chez les insectes.
- Bien que l'information génétique soit transmise très majoritairement de parents à descendants, à travers la reproduction, certaines régions du génomes ont été vraisemblablement acquises par transfert horizontal. Ces phénomènes sont bien connus chez les bactéries, mais on sait aujourd'hui que les eucaryotes peuvent également être concernés. Dans ce contexte, nous testons l'impact des connections écologiques sur ces transferts dans les communautés d'insectes en étroite interaction (hôtes-parasitoïdes). De plus, nous mesurons la contribution des virus domestiqués par les guêpes parasitoïdes à ces transferts.
- Les punaises de lit, Cimex lectularius, représentent un fléau en pleine ré-émergence. Ces insectes hématophages ont connu un boom démographique extrêmement important ces dernières années, probablement en lien avec l’évolution de la résistance aux insecticides. Nous recherchons actuellement les déterminants génétiques sous-tendant le phénotype de résistance (Haberkorn et al. 2023, 2024). Par ailleurs, ce modèle est étudié dans un contexte de spéciation. En effet, ces punaises dérivent en réalité de populations se nourrissant de sang de chauve-souris dont on retrouve des représentants contemporains. Nous essayons de comprendre l'histoire démographique de ces populations et les mécanismes ayant permis l'adaptation à ce nouvel hôte humain.
Parasitoïde déposant un œuf (et son virus) dans une larve de drosophile. (crédit dessin : J. Martinez)
Publications
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Dating the origin of a viral domestication event in parasitoid wasps attacking Diptera
Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 292 ( 2039 )
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voir la publicationTranscriptomic Response to Pyrethroid Treatment in Closely Related Bed Bug Strains Varying in Resistance
Genome Biology and Evolution . 16 ( 8 ) : evae158
DOI: 10.1093/gbe/evae158
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voir la publicationA novel and diverse family of filamentous DNA viruses associated with parasitic wasps
Virus Evolution . 10 ( 1 ) : veae022
DOI: 10.1093/ve/veae022
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voir la publicationCommunity structure of heritable viruses in a Drosophila-parasitoids complex
Peer Community Journal . 4 : e16
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voir la publicationA major 6 Mb superlocus is involved in pyrethroid resistance in the common bed bug Cimex lectularius
Evolutionary Applications . 16 ( 5 ) : 1012 - 1028
DOI: 10.1111/eva.13550
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voir la publicationEndoparasitoid lifestyle promotes endogenization and domestication of dsDNA viruses
eLife . 12 : e85993
DOI: 10.7554/eLife.85993
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voir la publicationRNA Viruses Are Prevalent and Active Tenants of the Predatory Mite Phytoseiulus persimilis (Acari: Phytoseiidae)
Microbial ecology .
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voir la publicationGenomic characterization of viruses associated with the parasitoid Anagyrus vladimiri (Hymenoptera: Encyrtidae)
Journal of General Virology . 103 ( 12 )
DOI: 10.1099/jgv.0.001810
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voir la publicationDROP: Molecular voucher database for identification of Drosophila parasitoids
Molecular Ecology Resources .
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voir la publicationA behavior-manipulating virus relative as a source of adaptive genes for Drosophila parasitoids
Molecular Biology and Evolution . 37 ( 10 ) : 2791-2807
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voir la publicationA behavior-manipulating virus relative as a source of adaptive genes for parasitoid wasps
Pré-publication
voir la publicationDeciphering the behaviour manipulation imposed by a virus on its parasitoid host: insights from a dual transcriptomic approach
Parasitology . 145 ( 14 ) : 1979-1989
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voir la publicationGenome sequencing of the behaviour manipulating virus LbFV reveals a possible new virus family
Genome Biology and Evolution . 8 : 3718-3738
DOI: 10.1093/gbe/evw277
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voir la publicationAdditional heritable virus in the parasitic wasp Leptopilina boulardi: prevalence, transmission and phenotypic effects
Journal of General Virology . 97 : 523-535
DOI: 10.1099/jgv.0.000360
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voir la publicationCompetitive outcome of multiple infections in a behavior-manipulating virus/wasp interaction
Ecology and Evolution . 5 ( 24 ) : S934-S945
DOI: 10.1002/ece3.1749
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voir la publicationThe influence of male wing shape on mating success in Drosophila melanogaster
Animal Behaviour . 85 : 1217--1223
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voir la publicationAn inherited virus influences the coexistence of parasitoid species through behaviour manipulation.
Ecology Letters . 15 ( 6 ) : 603-10
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voir la publicationInfluence of the virus LbFV and of Wolbachia in a host-parasitoid interaction.
PLoS ONE . 7 ( 4 ) : 1-10
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voir la publicationHeritable variation in an extended phenotype: the case of a parasitoid manipulated by a virus.
Journal of Evolutionary Biology . 25 ( 1 ) : 54-65
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voir la publicationAn inherited Virus manipulating the behavior of its parasitoid host : epidemiology and evolutionary consequences
Parasitoid Viruses. Symbionts and Pathogens . 978-0-12-384858-1 : 203-214
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationPrevalence of a virus inducing behavioural manipulation near species range border
Molecular Ecology . 19 ( 14 ) : 2995-3007
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voir la publicationEvolution and manipulation of parasitoid eggload
Evolution - International Journal of Organic Evolution . 63 ( 11 ) : 2974-2984
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voir la publicationMolecular Detection Penetrance and Transmission of an Inherited Virus Responsible for Behavioral Manipulation of an Insect Parasitoid
Applied and Environmental Microbiology . 75 ( 3 ) : 703-710
DOI: 10.1128/AEM.01778-08
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voir la publicationA Virus-Shaping Reproductive Strategy in a Drosophila Parasitoid
Advances in Parasitology . 70 : 334-359
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voir la publicationBehavioural manipulation of insect parasitoids by a maternally inherited virus: ecological consequences and potential applications for biological control
Entomological Research . 37 : A11-A73
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voir la publicationSuperparasitism evolution: adaptation or manipulation?
The American Naturalist . 167 ( 1 ) : E1-E22
DOI: 10.1086/498398
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voir la publicationThe virus infecting the parasitoid Leptopilina boulardi exerts a specific action on superparasitism behaviour
Parasitology . 132 : 747-756
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voir la publicationArtifical transfer and morphological description of virus particles associated with superparasitism behaviour in a parasitoid wasp.
Journal of Insect Physiology . 52 ( 11-12 ) : 1202-1212
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voir la publicationA Newly Discovered Virus Manipulates Superparasitism Behavior in a Parasitoid Wasp
Insect Symbiosis . 2 : 119-139
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationSuperparasitism acceptance and patch-leaving mechanisms in parasitoids: A comparison between two sympatric wasps
Animal Behaviour . 69 : 1227-1234
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