Equipe Génétique et Evolution des Interactions
Membres
Ingénieur d'études CDD
CNRS
Maître de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 16
Post-doc
CNRS
Chargé de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 44 81 01
Chargé de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 43 29 12
Maîtresse de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 16
Professeur des universités
UCBL
Post-doc
CNRS
Doctorante
CNRS
Tél : 04 72 44 81 42
Doctorant
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Post-doc
CNRS
Chargée de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 44 81 01
Doctorante
INSA
Tél : 04 72 44 81 42
Post-doc
UCBL
Maîtresse de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 29 10
Assistante ingénieure CDD
CNRS
Tél : 04 72 44 81 42
Doctorante
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Doctorante
UCBL
Doctorante
UCBL
Assistante ingénieure CDD
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Maître de conférences
UCBL
Tél : 33 04 72 44 81 01
Directeur de recherche
CNRS
Tél : 33 04 72 43 19 21
Professeure des universités
UCBL
Tél : 33 04 72 44 82 16
Doctorant
UCBL
Tél : 04 72 44 81 42
Professeur des universités
VetAgro-Sup
Tél : 33 04 78 87 27 02
Les systèmes vivants sont constitués d’une multitude de niveaux d'organisation imbriqués, impliquant coopération et conflits. La coopération et la sélection de systèmes fonctionnant de manière coordonnée a permis des transitions évolutives dites “majeures”, vers de nouvelles échelles d'individualité, comme la cellule eucaryote. Néanmoins, la sélection naturelle continue à opérer à toutes les échelles, générant de possibles conflits évolutifs entre les différentes composantes de l’individu.
Nos recherches s’inscrivent dans cette perspective, et visent à mieux comprendre la nature et les implications évolutives des interactions entre les multiples composantes des organismes, du gène aux bactéries symbiotiques, en passant par les virus et les éléments transposables. Nous explorons également l’impact de ces interactions sur la dynamique de l’information génétique, à travers le transfert horizontal, ou sur l’innovation génétique et l’adaptation, à travers la domestication. Nos recherches, essentiellement expérimentales, mais également théoriques, sont mises en œuvre sur des modèles arthropodes, et relèvent principalement de la génétique et la génomique évolutive.
L'équipe est structurée en deux grands axes:
- Interactions intra-génomiques : les éléments transposables (resp. Marie Fablet)
- Ex1: La dynamique évolutive des éléments transposables (ET) dans les génomes, en lien avec leur variabilité naturelle. Nous utilisons pour modèles des populations naturelles de Drosophila melanogaster et D. simulans, ainsi que des espèces d’intérêt agronomique ou sociétal, telles que l’espèce envahissante D. suzukii ou le moustique tigre Aedes albopictus.
- Ex2: Les interactions entre le contrôle des ET et l’immunité anti-virale. Nous étudions les mécanismes moléculaires d’interférence ARN à l’origine de l’intrication de ces deux processus, ainsi que les implications co-évolutives, à l’aide d’infections expérimentales de différents virus sur plusieurs lignées de drosophiles.
- Personnes impliquées : CV, MB, MF
- La symbiose, moteur de l’évolution (resp. Natacha Kremer)
- Ex1: Certaines bactéries symbiotiques apportent des capacités métaboliques dont l’insecte est dépourvu. Nous analysons ces interactions chez des insectes hématophages (punaise de lits, tiques) et phytophages (l’aleurode Bemisia tabaci) par des approches combinant analyse des phénotypes, génétique, physiologie et métabolomique.
- Ex2: Les insectes parasitoïdes ont domestiqué des gènes viraux leur permettant de contourner les réponses immunitaire de leurs hôtes. Nous étudions la fréquence et la signification adaptative de ces évènements et, plus généralement, nous recherchons les facteurs structurant les transferts horizontaux dans les communautés hôtes-parasitoïdes.
- Personnes impliquées : NK, LM, LZ, JMD, JV, FV, SC
Publications
Affichage des publications 91 à 120 sur 445 au total
Transposable elements in Drosophila
Mobile DNA . 11 ( 1 )
Article dans une revue
voir la publicationA transposon story : from TE content to TE dynamic invasion of Drosophila genomes using the single-molecule sequencing technology from Oxford Nanopore
Cells . 9 ( 8 ) : 1776
DOI: 10.3390/cells9081776
Article dans une revue
voir la publicationViral infection impacts transposable element transcript amounts in Drosophila
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 117 ( 22 ) : 12249-12257
Article dans une revue
voir la publicationSyndrome de Klinefelter, rôle du chromosome Y dans l’espérance de vie humaine ?
36ème Congrès de la Société Française d'Endocrinologie (SFE Marseille 2020) . 81 ( 4 ) : 194
Acte de congrès
voir la publicationWolbachia host shifts: routes, mechanisms, constraints and evolutionary consequences
Biological Reviews .
DOI: 10.1111/brv.12663
Article dans une revue
voir la publicationL’épistémologie des sciences biologiques et géologiques : une occasion d’enseigner l’incertitude ?
Raisons éducatives . N°24
Article dans une revue
voir la publicationDrosophila suzukii oxidative stress response involves Jheh gene cluster but not transposable elements
Pré-publication
voir la publicationBiological Invasion: The Influence of the Hidden Side of the (Epi)Genome
Functional Ecology . 34 ( 2 ) : 385-400
Article dans une revue
voir la publicationChromosomal resolution reveals symbiotic virus colonization of parasitic wasp genomes
Pré-publication
voir la publicationSome evolutionary insights into an accidental homing endonuclease passage from mitochondria to the nucleus
Peer Community In Evolutionary Biology . : 100101
Autre publication
voir la publicationTransposable element dynamics and regulation in a major crop pest: Sitophilus oryzae.
Congrès national sur les éléments transposables .
Poster
voir la publicationDiscovering the link between insect symbiosis and transposable elements.
Crossroads between transposons and gene regulation .
Poster
voir la publicationInfluence of bacterial symbionts on host niche and ecological diversification: a metabolic approach in a whitefly model.
Journées Microbiome .
Poster
voir la publicationInfluence of bacterial symbionts on host niche and ecological diversification: a metabolic approach in a whitefly model.
Colloque Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID) et le réseau Immunologie des Invertébrés (IMMUNINV) .
Poster
voir la publicationInfluence of symbionts on their host niche and partner's choice
PISI-net, 2 nd annual meeting of Japan-France Plant-Insect-Symbiont interaction network .
Acte de congrès
voir la publicationStudy of insect-bacteria symbiotic interactions by dual RNAseq
Journée Transcriptomique Complexe des GDR GE et BIM .
Acte de congrès
voir la publicationTransposable element dynamics in Sitophilus oryzae
Auvergne Rhône-Alpes Regional Workshop on Microbiome .
Poster
voir la publicationSublethal effects from endosulfan on parasitization by the parasitoid wasp Leptopilina boulardi and specificity of nervous pathways involved
Pest Management Science . 75 ( 5 ) : 1411-1415
DOI: 10.1002/ps.5261
Article dans une revue
voir la publicationGlobal survey of mobile DNA horizontal transfer in arthropods reveals Lepidoptera as a prime hotspot
PLoS Genetics . 15 ( 2 ) : e1007965
Article dans une revue
voir la publicationL'enseignement de l'évolution : redonner une place à l'épistémologie des sciences historiques
RDST - Recherches en didactique des sciences et des technologies .
Article dans une revue
voir la publicationOn the Importance to Acknowledge Transposable Elements in Epigenomic Analyses
Genes . 10 ( 4 ) : 258
Article dans une revue
voir la publicationSymbiotic organs shaped by distinct modes of genome evolution in cephalopods
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America .
Article dans une revue
voir la publicationInsects and incest: Sib‐mating tolerance in natural populations of a parasitoid wasp
Molecular Ecology . 29 ( 3 ) : 596-609
DOI: 10.1111/mec.15340
Article dans une revue
voir la publicationDynamic Interactions Between the Genome and an Endogenous Retrovirus: Tirant in Drosophila simulans Wild-Type Strains
G3 . 9 ( 3 ) : 855-865
Article dans une revue
voir la publication(In)exhaustible Suppliers for Evolution? Epistatic Selection Tunes the Adaptive Potential of Nongenetic Inheritance
The American Naturalist . 194 ( 4 ) : 470-481
DOI: 10.1086/704772
Article dans une revue
voir la publicationCaution Does Not Preclude Predictive and Testable Models of Cytoplasmic Incompatibility: A Reply to Shropshire et al.
Trends in Genetics . 35 ( 6 ) : 399-400
Article dans une revue
voir la publicationCategorization of species as native or nonnative using DNA sequence signatures without a complete reference library
Ecological Applications . 29
DOI: 10.1002/eap.1914
Article dans une revue
voir la publicationThe Toxin–Antidote Model of Cytoplasmic Incompatibility: Genetics and Evolutionary Implications
Trends in Genetics . 35 ( 3 ) : 175-185
Article dans une revue
voir la publicationWidespread Wolbachia infection in an insular radiation of damselflies (odonata, coenagrionidae)
Scientific Reports .
Article dans une revue
voir la publicationTick-Bacteria Mutualism Depends on B Vitamin Synthesis Pathways
Current Biology - CB . 28 ( 12 ) : 1896 - 1902.e5
Article dans une revue
voir la publication