COEVOL Coévolution Multi-Echelles
Equipe Génétique et Evolution des Interactions
Vavre Fabrice
Directeur de recherche
CNRS
Qui suis-nous ? Qui sommes-je ?
Ces deux étranges questions définissent parfaitement mes intérêts de recherche. J'étudie les relations interspécifiques, notamment les interactions symbiotiques, en utilisant comme modèle les interactions entre arthropodes et bactéries transmises principalement verticalement (de la mère à la descendance). L'objectif est de comprendre la dynamique de cet individu chimère, les facteurs qui orientent ces interactions vers le conflit ou la coopération, et leurs conséquences sur le phénotype étendu de l'individu et l'évolution de chacun des partenaires. La subtilité de ces interactions, qui naviguent continuellement entre intérêts égoïstes et partagés, est particulièrement importante à considérer et à intégrer dans l'étude à la mode de l'holobionte et du microbiote. Ce thème général est actuellement structuré autour de 3 projets principaux :
La co-adaptation au sein des holobiontes. Dans le cadre du projet ANR Hmicmac, nous cherchons, avec Laurence Mouton, à tester l'hypothèse selon laquelle les interactions hôte-microbiote devraient conduire à une co-adaptation entre les partenaires. Cette hypothèse est testée à l'aide d'une approche d’évolution expérimentale basée sur des situations où ces possibles co-adaptations sont initialement cassées puis laissées libres d'évoluer à nouveau. Cette approche est menée sur l'aleurode Bemisia tabaci et ses bactéries symbiotiques au LBBE, et est comparée à des expériences similaires menées sur le puceron du pois. Ce projet implique également les laboratoires IGEPP (Rennes) et BF2I (Lyon).
Réponse des symbioses au stress. Dans le cadre du projet RESIST (ANR JCJC, coord. Natacha Kremer, LBBE), nous cherchons à tester si la symbiose est un moteur ou une barrière à l'adaptation à de nouveaux stress environnementaux. Nous utilisons l'association entre Drosophila melanogaster et Wolbachia (souche wMelPop), qui est soumise à des stress ponctuels ou chroniques avec soit un agent pro-oxydant (l'herbicide paraquat), soit le virus C, soit les deux simultanément.
Dynamique des interactions symbiotiques obligatoires chez les tiques. Dans le cadre du projet MICROM (ANR, coord. O. Duron, MIVEGEC), nous cherchons à comprendre le pourquoi et le comment des remplacements récurrents des symbiotes nutritionnels obligatoires chez les tiques. En effet, ces arthropodes hématophages stricts dépendent de symbiotes nutritionnels leur apportant des vitamines B. Cependant, de multiples événements de remplacement ont eu lieu au cours de l'évolution des tiques. Les futurs travaux au LBBE seront consacrés à la génomique comparative des symbiotes de différentes espèces de tiques.
Enfin, dans le cadre de plusieurs projets (SBP MicroBeHave, 2 thèses CIFRE, une ANR et un projet région), nous avons développé avec Julien Varaldi et Natacha Kremer, en collaboration avec le laboratoire BF2I et la société Izinovation, un nouveau projet sur les punaises de lit, un ravageur ré-émergent du fait de sa résistance aux insecticides, strictement hématophage et totalement dépendant de symbiotes du genre Wolbachia pour l'apport en vitamines B. Nos travaux visent à caractériser les mécanismes génétiques de résistance et à mieux comprendre le dialogue génétique et métabolique entre l'insecte et son symbiote.
Développement des approches "One Health" à Lyon
Au-delà de ces aspects scientifiques, je suis également impliqué dans la construction de l'écosystème de recherche lyonnais sur les approches One Health. Cela m'a conduit à diriger le projet de plateforme Symbiotron pendant plus de 10 ans, et depuis 2021 à coordonner le projet Equipex+ Infectiotron, récemment financé et porté par l'Université Lyon 1. Ce projet vise à développer un ensemble d'outils coordonnés pour le développement opérationnel de projets sur les maladies infectieuses depuis leur environnement naturel jusqu'au laboratoire, avec un accent particulier sur les pathogènes de niveau 3. Je suis également activement impliqué dans la mise en œuvre et le développement du projet SHAPE-Med@Lyon, également coordonnée par l'Université de Lyon 1, et en particulier pour le développement de l'Institut Transdisciplinaire de Santé de Lyon.
Publications
Affichage des publications 61 à 90 sur 100 au total
Interactions between vertically transmitted symbionts: cooperation or conflict ?
Trends in Microbiology . 17 : 95-99
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voir la publicationEvolution des interactions symbiotiques chez les insectes : A quel niveau de sélection se vouer ?
incollection . -- : 33-35
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voir la publicationEviter les tricheurs: mode de transmission et stabilité des symbioses
Biofutur . 299 : 33-35
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voir la publicationDrosophila-parasitoid communities as model systems for host-Wolbachia interactions.
Advances in Parasitology . 70 : 299-331
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voir la publicationInfecciones múltiples regulación y evolución de poblaciones simbióticas
incollection . -- : 197-226
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voir la publicationDrosophila–Parasitoid Communities as Model Systems for Host–Wolbachia Interactions
incollection . 70 : 229-331
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voir la publicationWolbachia interferes with ferritin expression and iron metabolism in insects.
PLoS Pathogens . 5 ( 10 ) : e1000630
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voir la publicationImmunity and symbiosis.
Molecular Microbiology . 73 ( 5 ) : 751-9
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voir la publicationDo vertically transmitted symbionts co-existing in a single host compete or cooperate? A modelling approach
Journal of Evolutionary Biology . 21 : 145-161
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voir la publicationInherited intracellular ecosystem: symbiotic bacteria share bacteriocytes in whiteflies
FASEB Journal . 22 : 1-9
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voir la publicationIntense transpositional activity of insertion sequences in an ancient obligate endosymbiont
Molecular Biology and Evolution . 25 ( 9 ) : 1889-1896
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voir la publicationIs symbiosis evolution influenced by the pleiotropic role of programmed cell death in immunity an development ?
Insect Symbiosis . 3 : 57-76
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationEvolution and invasion dynamics of multiple infections with Wolbachia investigated using matrix based models.
Journal of Theoretical Biology . 245 : 197-209
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voir la publicationParasitic inhibition of cell death facilitates symbiosis.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 104 ( 1 ) : 213-5
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voir la publicationTomato yellow leaf curl virus transmission efficacy is determined by symbiotic bacteria in the vector the sweet potato whitefly Bemisia tabaci
Entomological Research . 37(1) : A42-A43
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voir la publicationA Survey of the Bacteriophage WO in the Endosymbiotic Bacteria Wolbachia
Molecular Biology and Evolution . 24 : 427-435
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voir la publicationInteraction between host genotype and environmental conditions affects bacterial density in Wolbachia symbiosis
Biology Letters . 3 : 210-213
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voir la publicationEffect of temperature on Wolbachia density and impact on cytoplasmic incompatibility
Parasitology . 132 : 49-56
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voir la publicationMultiple infections and diversity of cytoplasmic incompatibility in a haplodiploid species
Heredity . 94 : 187-192
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voir la publicationAn efficient procedure for purification of the obligate intracellular Wolbachia pipientis and representative amplification of its genome by multiple displacement amplification
Applied and Environmental Microbiology . 71 : 6910-6917
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voir la publicationWolbachia requierement for oogenesis : occurence within the genus Asobara (Hynoptera, Braconidae) and evidence for intraspecific variation in A. tabida.
Heredity . 95 : 394-400
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voir la publicationEfficient procedure for purification of obligate intracellular Wolbachia pipientis and representative amplification of its génome by multiple-pisplacement amplification
Applied and Environmental Microbiology . 71 ( 11 ) : 6910-6917
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voir la publicationWolbachia requirement for oogenesis: occurrence within the genus Asobara (Hymenoptera Braconidae) and evidence for intraspecific variation in A. tabida
Heredity . -- : 267-282
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voir la publicationCytogenetic mechanism and genetic consequences of thelytoky in the wasp Trichogramma cacoeciae
Heredity . 93 : 592-596
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voir la publicationVirulence multiple infections and regulation of symbiotic population in the Wolbachia-Asobara tabida symbiosis
Genetics . 168 : 181-189
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voir la publicationDiversity distribution and specificity of WO phage infection in Wolbachia of four insect species
Insect Molecular Biology . 13 : 147-153
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voir la publicationIntra-individual coexistence of a Wolbachia strain required for host oogenesis with two strains inducing cytoplasmic incompatibility in the wasp Asobara tabida
Evolution - International Journal of Organic Evolution . 58 : 2167-2174
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voir la publicationStrain-specific regulation of intracellular Wolbachia density in multiply infected insects
Molecular Ecology . 12 : 3459-3465
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voir la publicationBetween- and within-host species selection on cytoplasmic incompatibility-inducing Wolbachia in haplodiploids
Evolution - International Journal of Organic Evolution . 57 : 421-427
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voir la publicationInfection polymorphism and cytoplasmic incompatibility in Hymenoptera-Wolbachia associations
Heredity . 88 : 361-365
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