
GECO Génomique Computationnelle et Evolutive
Mary Arnaud
Maître de conférences
UCBL
Tél : 04 72 43 15 52
Publications
Affichage des publications 1 à 27 sur 27 au total
Models and Algorithms for Managing Repeats in the De Novo Assembly of Transcriptomes Models and Algorithms for Managing Repeats in the De Novo Assembly of Transcriptomes
JOBIM 2025 .
Poster
voir la publicationEnumeration of minimal transversals of hypergraphs of bounded VC-dimension
Pré-publication
voir la publicationComplexity and algorithms for Swap median and relation to other consensus problems
Pré-publication
voir la publicationEfficient enumeration of maximal split subgraphs and induced sub-cographs and related classes
Discrete Applied Mathematics . 345 : 34-51
Article dans une revue
voir la publicationIdentification and quantification of transposable element transcripts using Long-Read RNA-seq in Drosophila germline tissues
Peer Community Journal . 4 ( e89 )
Article dans une revue
voir la publicationPolynomial Delay Algorithm for Minimal Chordal Completions
49th International Colloquium on Automata, Languages, and Programming (ICALP) .
Acte de congrès
voir la publicationEfficiently sparse listing of classes of optimal cophylogeny reconciliations
Algorithms for Molecular Biology . 17 ( 1 ) : 1-16
Article dans une revue
voir la publicationTotoro: Identifying Active Reactions During the Transient State for Metabolic Perturbations
Frontiers in Genetics . 13 : 1-12
Article dans une revue
voir la publicationCALDERA: Finding all significant de Bruijn subgraphs for bacterial GWAS
Bioinformatics .
Article dans une revue
voir la publicationMOOMIN – Mathematical explOration of ’Omics data on a MetabolIc Network
Bioinformatics . 36 ( 2 ) : 514-523
Article dans une revue
voir la publicationAlgorithms for the quantitative Lock/Key model of cytoplasmic incompatibility
Algorithms for Molecular Biology . : 1-16
Article dans une revue
voir la publicationThe Perfect Matching Reconfiguration Problem
MFCS 2019 - 44th International Symposium on Mathematical Foundations of Computer Science . : 1-14
Acte de congrès
voir la publicationEfficient enumeration of solutions produced by closure operations
Discrete Mathematics and Theoretical Computer Science . : 1-30
Article dans une revue
voir la publicationBounding the Order of a Graph Using Its Diameter and Metric Dimension: A Study Through Tree Decompositions and VC Dimension
SIAM Journal on Discrete Mathematics . 32 ( 2 ) : 902 - 918
DOI: 10.1137/16M1097833
Article dans une revue
voir la publicationReconfiguration of graphs with connectivity constraints
WAOA 2018 - International Workshop on Approximation and Online Algorithms . 11312 : 295-309
Acte de congrès
voir la publicationAlgorithms for k-meet-semidistributive lattices
Theoretical Computer Science . 658 : 391 - 398
Article dans une revue
voir la publicationBacHBerry: BACterial Hosts for production of Bioactive phenolics from bERRY fruits
Phytochemistry Reviews . : 1-36
Article dans une revue
voir la publicationToken Jumping in minor-closed classes
International symposium on fundamentals of computer theory (FCT 2017) . 10472 : 136-149
Acte de congrès
voir la publicationA Polynomial Delay Algorithm for Enumerating Minimal Dominating Sets in Chordal Graphs
WG 2015: Graph-Theoretic Concepts in Computer Science . : 138-153
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationA Combinatorial Algorithm for Microbial Consortia Synthetic Design
Scientific Reports .
DOI: 10.1038/srep29182
Article dans une revue
voir la publicationMultiPus: Conception de communautés microbiennes pour la production de composés d'intérêt
Jobim .
Poster
voir la publicationEfficient Enumeration of Solutions Produced by Closure Operations
33rd Symposium on Theoretical Aspects of Computer Science, STACS 2016 . 47
Acte de congrès
voir la publicationOn Maximal Chain Subgraphs and Covers of Bipartite Graphs
Combinatorial Algorithms - 27th International Workshop, IWOCA 2016 . 9843 : 137-150
Acte de congrès
voir la publicationPolynomial Delay Algorithm for Listing Minimal Edge Dominating Sets in Graphs
Algorithms and Data Structures (WADS) . 9214 : 446-457
Acte de congrès
voir la publicationAn average study of hypergraphs and their minimal transversals
Theoretical Computer Science . 596 : 124-141
Article dans une revue
voir la publicationIncremental complexity of a bi-objective hypergraph transversal problem
Fundamentals of Computation Theory (FCT2015) . 9210 : 202-213
Acte de congrès
voir la publicationOn the Enumeration of Minimal Dominating Sets and Related Notions
SIAM Journal on Discrete Mathematics . 28 ( 4 ) : 1916 - 1929
DOI: 10.1137/120862612
Article dans une revue
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