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Publications

Affichage des publications 2971 à 3000 sur 6823 au total

DegreeCox – a network-based regularization method for survival analysis

André Veríssimo, Arlindo Limede Oliveira, Marie-France Sagot, Susana Vinga

BMC Bioinformatics . 17 ( Suppl 16 ) : 109-121

DOI: 10.1186/s12859-016-1310-4

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Enumeration of minimal stoichiometric precursor sets in metabolic networks

Ricardo Andrade, Martin Wannagat, Cecilia C. Klein, Vicente Acuña, Alberto Marchetti-Spaccamela, Paulo V. Milreu...

Algorithms for Molecular Biology . 11 ( 1 ) : 25

DOI: 10.1186/s13015-016-0087-3

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Robustness of the Parsimonious Reconciliation Method in Cophylogeny

Laura Urbini, Blerina Sinaimeri, Catherine Matias, Marie-France Sagot

Lecture Notes in Computer Science . 9702 : 12

DOI: 10.1007/978-3-319-38827-4_10

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Computing and Listing st-Paths in Subway Networks

Kateřina Böhmová, Matúš Mihalák, Tobias Pröger, Gustavo Sacomoto, Marie-France Sagot, Peter Widmayer

CSR 2016 - 11th International Computer Science Symposium in Russia . 9691 : 102-116

DOI: 10.1007/978-3-319-34171-2_8

Acte de congrès

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Introduction to the Special Theme - Tackling Big Data in the Life Sciences

Roeland M.H. Merks, Marie-France Sagot

Autre publication

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Qualité des données NGS : de la séquence aux bases de données

Pierre Peyret, Julie Aubert, Vincent Breton, François Enault, Line Le Gall, Denis Le Paslier...

La génomique environnementale . 978-1-78405-151-8 : 180 p.

Chapitre d'ouvrage

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Selective disappearance of individuals with high levels of glycated haemoglobin in a free-living bird

Charlotte Récapet, Adélaïde Sibeaux, Laure Cauchard, Blandine Doligez, Pierre Bize

Biology Letters . 12 ( 8 )

DOI: 10.1098/rsbl.2016.0243

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Interspecific variation in the relationship between clutch size, laying date and intensity of urbanization in four species of hole-nesting birds.

Marie Vaugoyeau, Frank Adriaensen, Alexandr Artemyev, Jerzy Bańbura, Emilio Barba, Clotilde Biard...

Ecology and Evolution . 6 ( 16 ) : 5907-5920

DOI: 10.1002/ece3.2335

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Food supplementation mitigates dispersal-dependent differences in nest defence in a passerine bird

Charlotte Récapet, Grégory Daniel, Joëlle Taroni, Pierre Bize, Blandine Doligez

Biology Letters . 12 ( 5 )

DOI: 10.1098/rsbl.2016.0097

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Relative fitness of a generalist parasite on two alternative hosts: a cross-infestation experiment to test host specialization of the hen flea Ceratophyllus gallinae (Schrank)

A. Appelgren, Karen Mccoy, H. Richner, Blandine Doligez

Journal of Evolutionary Biology . 29 ( 5 ) : 1091-1101

DOI: 10.1111/jeb.12850

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Evolutionary signals of selection on cognition from the great tit genome and methylome

V.N. Laine, T.I. Gossmann, K.M. Schachtschneider, C.J. Garroway, O. Madsen, K.J. Verhoeven...

Nature Communications . 7 : 10474

DOI: 10.1038/ncomms10474

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Differences in the oxidative balance of dispersing and non-dispersing individuals: an experimental approach in a passerine bird

Charlotte Récapet, Alexandre Zahariev, Stéphane Blanc, Mathilde Arrivé, François Criscuolo, Pierre Bize...

BMC Evolutionary Biology . 16 : 125

DOI: 10.1186/s12862-016-0697-x

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Solutions for archiving data in long-term studies: a reply to whitlock et al.

James A. Mills, Céline Teplitsky, Beatriz Arroyo, Anne Charmantier, Peter H Becker, Tim R. Birkhead...

Trends in Ecology & Evolution . 31 ( 2 ) : 85-87

DOI: 10.1016/j.tree.2015.12.004

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Combined Genotypic, Phylogenetic, and Epidemiologic Analyses of Mycobacterium tuberculosis Genetic Diversity in the Rhône Alpes Region, France

Catherine Pichat, David Couvin, Gérard Carret, Isabelle Frédénucci, Véronique Jacomo, Anne Carricajo...

PLoS ONE . 11 ( 4 ) : e0153580

DOI: 10.1371/journal.pone.0153580

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The influence of weather conditions during gestation on life histories in a wild Arctic ungulate

Mathieu Douhard, Leif Egil Loe, Audun Stien, Christophe Bonenfant, R. Justin Irvine, Vebjørn Veiberg...

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 283 ( 1841 )

DOI: 10.1098/rspb.2016.1760

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A prospective exploration of farm, farmer, and animal characteristics in human-animal relationships: An epidemiological survey

Alice de Boyer Des Roches, Isabelle Veissier, Xavier Boivin, Emmanuelle Gilot-Fromont, Luc Mounier

Journal of Dairy Science . 99 : 1-13

DOI: 10.3168/jds.2015-10633

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Individual variation in an acute stress response reflects divergent coping strategies in a large herbivore

C. Monestier, Emmanuelle Gilot-Fromont, N. Morellet, Lucie Debeffe, N. Cebe, J. Merlet...

Behavioural Processes . 132 : 22-28

DOI: 10.1016/j.beproc.2016.09.004

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Wildlife Interactions on Baited Places and Waterholes in a French Area Infected by Bovine Tuberculosis

A. Payne, S. Philipon, J. Hars, Barbara Dufour, Emmanuelle Gilot-Fromont

Frontiers in Veterinary Science . 3 : 122

DOI: 10.3389/fvets.2016.00122

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Wildlife visits to farm facilities assessed by camera traps in a bovine tuberculosis-infected area in France

A. Payne, S. Chappa, J. Hars, Barbara Dufour, Emmanuelle Gilot-Fromont

European Journal of Wildlife Research . 62 ( 1 ) : 33-42

DOI: 10.1007/s10344-015-0970-0

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Splicing misregulation of SCN5A contributes to cardiac-conduction delay and heart arrhythmia in myotonic dystrophy

Fernande Freyermuth, Frédérique Rau, Yosuke Kokunai, Thomas Linke, Chantal Sellier, Masayuki Nakamori...

Nature Communications . 7 : 11067

DOI: 10.1038/ncomms11067

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Age and sex-dependent effects of landscape cover and trapping on the spatial genetic structure of the stone marten (Martes foina)

J. Larroque, S. Ruette, J.M. Vandel, G. Queney, S. Devillard

Conservation Genetics . 17 : 1293-1306

DOI: 10.1007/s10592-016-0862-1

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Silencing of natural transformation by an RNA chaperone and a multitarget small RNA

Laetitia Attaiech, Aïda Boughammoura, Céline Brochier-Armanet, Omran Allatif, Flora Peillard-Fiorente, Ross A. Edwards...

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 113 ( 31 ) : 8813-8818

DOI: 10.1073/pnas.1601626113

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Transcriptional start site turnover in the evolution of bacterial paralogous genes - the pelE-pelD virulence genes in Dickeya

Alexandre Duprey, William Nasser, Simon Leonard, Céline Brochier-Armanet, Sylvie Reverchon

FEBS Journal . 283 ( 22 ) : 4192-4207

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In silico experimental evolution provides independent and challenging benchmarks for comparative genomics

Priscila Biller, Eric Tannier, Guillaume Beslon, Carole Knibbe

Journées ouvertes Biologie Informatique Mathématiques . : 79-82

Acte de congrès

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Comparative Genomics on Artificial Life

Priscila Biller, Carole Knibbe, Guillaume Beslon, Eric Tannier

Computability in Europe . 9709 : 35-44

Acte de congrès

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Breaking Good: Accounting for Fragility of Genomic Regions in Rearrangement Distance Estimation

Priscila Biller, Laurent Guéguen, Carole Knibbe, Eric Tannier

Genome Biology and Evolution . 8 ( 5 ) : 1427-1439

DOI: 10.1093/gbe/evw083

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Sorting Signed Permutations by Reversal (Reversal Sequence)

Eric Tannier

Encyclopedia of Algorithms . 978-1-4939-2863-7 : 2028-2032

Chapitre d'ouvrage

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Genome rearrangements with indels in intergenes restrict the scenario space

Laurent Bulteau, Guillaume Fertin, Eric Tannier

BMC Bioinformatics . 17 ( Suppl 14 ) : 426 (7 pages)

DOI: 10.1186/s12859-016-1264-6

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Strong phylogenetic inertia on genome size and transposable element content among 26 species of flies

Camille Sessegolo, Nelly Burlet, Annabelle A. Haudry

Biology Letters . 12 ( 8 )

DOI: 10.1098/rsbl.2016.0407

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Allometric scaling of the elevation of maternal energy intake during lactation

Frédéric Douhard, Jean-François Lemaître, Wendy M. Rauw, Nicolas N.C. Friggens

Frontiers in Zoology . 13 ( 1 ) : 12 p.

DOI: 10.1186/s12983-016-0164-y

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