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Publications

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Optimizing the design of a reproduction toxicity test with the pond snail Lymnaea stagnalis

Sandrine Charles, Virginie Ducrot, Didier Azam, Rachel Benstead, Denise Brettschneider, Karel de Schamphelaere...

Regulatory Toxicology and Pharmacology . 81 : 47-56

DOI: 10.1016/j.yrtph.2016.07.012

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Modelling algae-duckweed interaction under chemical pressure within a laboratory microcosm

Dominique Lamonica, Bernard Clement, Sandrine Charles, Christelle Lopes

Ecotoxicology and Environmental Safety . 128 : 252-65

DOI: 10.1016/j.ecoenv.2016.02.008

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Additional heritable virus in the parasitic wasp Leptopilina boulardi: prevalence, transmission and phenotypic effects

Julien Martinez, David Lepetit, Marc Ravallec, Frédéric Fleury, Julien Varaldi

Journal of General Virology . 97 : 523-535

DOI: 10.1099/jgv.0.000360

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SNP calling from RNA-seq data without a reference genome: identification, quantification, differential analysis and impact on the protein sequence

Hélène Lopez-Maestre, Lilia Brinza, Camille Marchet, Janice Kielbassa, Sylvère Bastien, Mathilde Boutigny...

Nucleic Acids Research .

DOI: 10.1093/nar/gkw655

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Influence of oxidative homeostasis on bacterial density and cost of infection in Drosophila–Wolbachia symbioses

David Monnin, Natacha Kremer, C. Berny, Hélène Henri, Adeline Dumet, Yann Voituron...

Journal of Evolutionary Biology . 29 : 1211-1222

DOI: 10.1111/jeb.12863

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Patient outcomes with stent-Retriever Thrombectomy for Anterior circulation stroke: A Meta-Analysis and Review of the literature

R. Silvan-Hooffmann, B. Gory, Muriel Rabilloud, D.N. Gherasim, X. Armoiry, R. Riva...

The Israel Medical Association journal : IMAJ . 18 : 561-566

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Accuracy of Elastic Fusion of Prostate Magnetic Resonance and Transrectal Ultrasound Images under Routine Conditions: A Prospective Multi-Operator Study

P. Moldovan, C. Udrescu, E. Ravier, R. Souchon, Muriel Rabilloud, F. Bratan...

PLoS ONE . 11 ( 12 ) : e0169120

DOI: 10.1371/journal.pone.0169120

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Gene Acquisitions from Bacteria at the Origins of Major Archaeal Clades Are Vastly Overestimated

Mathieu Groussin, Bastien Boussau, Gergely J Szollosi, Laura Eme, Manolo Gouy, Céline Brochier-Armanet...

Molecular Biology and Evolution . 33 ( 2 ) : 305 - 310

DOI: 10.1093/molbev/msv249

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Efficient gene tree correction guided by genome evolution

Emmanuel Noutahi, Magali Semeria, Manuel Lafond, Jonathan Seguin, Bastien Boussau, Laurent Guéguen...

PLoS ONE . 11 ( 8 ) : e0159559 (22 pages)

DOI: 10.1371/journal.pone.0159559

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Wolbachia -mediated protection against viruses in the invasive pest Drosophila suzukii

Julien Cattel, Julien Martinez, F. Jiggins, L. Mouton, P. Gibert

Insect Molecular Biology . 25 ( 5 ) : 595-603

DOI: 10.1111/imb.12245

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How Structured Is the Entangled Bank? The Surprisingly Simple Organization of Multiplex Ecological Networks Leads to Increased Persistence and Resilience

Sonia Kéfi, Vincent Miele, Evie Wieters, Sergio Navarrete, Eric Berlow

PLoS Biology . 14 ( 8 ) : e1002527

DOI: 10.1371/journal.pbio.1002527

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Antihypertensive pharmacotherapy for prevention of sudden cardiac death in hypertensive individuals

G. Taverny, Y. Mimouni, A. Ledigarcher, P. Chevalier, L. Thijs, J.M. Wright...

Cochrane database of systematic reviews (Online) . 3 : CD011745

DOI: 10.1002/14651858.CD011745.pub2

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One-step partial or complete caries removal and bonding with antibacterial or traditional self-etch adhesives: study protocol for a randomized controlled trial

Cyril Villat, Jean-Pierre Attal, Nathalie Brulat, Franck Decup, Sophie Doméjean, Elisabeth Dursun...

Trials . 17 ( 1 ) : 404

DOI: 10.1186/s13063-016-1484-0

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Impact of Aldosterone Antagonists on Sudden Cardiac Death Prevention in Heart Failure and Post-Myocardial Infarction Patients: A Systematic Review and Meta-Analysis of Randomized Controlled Trials

H.-H. Le, C. El-Khatib, M. Mombled, F. Guitarian, M. Al-Gobari, M. Fall...

PLoS ONE . 11 : e0145958

DOI: 10.1371/journal.pone.0145958

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Pharmacokinetic Variability of Daptomycin during Prolonged Therapy for Bone and Joint Infections

Sylvain Goutelle, Sandrine Roux, Marie-Claude Gagnieu, Florent Valour, Sebastien Lustig, Florence Ader...

Antimicrobial Agents and Chemotherapy . 60 ( 5 ) : pp. 3148-3151

DOI: 10.1128/AAC.02597-15

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Comparison of the static in vivo approach to a physiologically based pharmacokinetic approach for metabolic drug-drug interactions prediction

M. Tod, P.B. Pierrillas, Laurent Bourguignon, Sylvain Goutelle

International Journal of Pharmacokinetics . : 1-10

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The draft genome sequence of the rice weevil Sitophilus oryzae as a model to explore the host-symbiont interactions in a nascent stage of endosymbiosis

Carlos Vargas-Chavez, Nicolas Parisot, Clément Goubert, Patrice Baa-Puyoulet, Severine Balmand, M. Boulesteix...

Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM) .

Poster

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Hormetic response triggers multifaceted anti-oxidant strategies in immature king penguins (Aptenodytes patagonicus)

Benjamin Rey, Cyril Dégletagne, Jacques Bodennec, Pierre-Axel Monternier, Mathieu Mortz, Damien Roussel...

Free Radical Biology and Medicine . 97 : 577–587

DOI: 10.1016/j.freeradbiomed.2016.07.015

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Transcriptomic data analysis and differential gene expression of antioxidant pathways in king penguin juveniles (Aptenodytes patagonicus) before and after acclimatization to marine life

Benjamin Rey, Cyril Dégletagne, Claude Duchamp

Data in Brief . 9 : 549–555

DOI: 10.1016/j.dib.2016.09.021

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Lipid-induced thermogenesis is up-regulated by the first cold-water immersions in juvenile penguins

Loïc Teulier, Benjamin Rey, Jérémy Tornos, Marion Le Coadic, Pierre-Axel Monternier, Aurore Bourguignon...

Journal of Comparative Physiology B . 186 : 639–650

DOI: 10.1007/s00360-016-0975-3

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Factors associated with poor outcomes among adults hospitalised for influenza in France: A three-year prospective multicenter study

Paul Loubet, Nezha Samih-Lenzi, Florence Galtier, Philippe Vanhems, Pierre Loulergue, Xavier Duval...

Journal of Clinical Virology . 79 : 68–73

DOI: 10.1016/j.jcv.2016.04.005

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RiboDB database: a comprehensive resource for prokaryotic systematics

Frédéric Jauffrit, Simon Penel, Stéphane Delmotte, Carine Rey, Damien M de Vienne, Manolo Gouy...

Molecular Biology and Evolution . 33 ( 8 ) : 2170--2172

DOI: 10.1093/molbev/msw088

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Impact of Wheat/Faba Bean Mixed Cropping or Rotation Systems on Soil Microbial Functionalities

Sanâa Wahbi, Yves Prin, Jean Thioulouse, Hervé Sanguin, Ezékiel Baudoin, Tasnime Maghraoui...

Frontiers in Plant Science . 7 : 1364

DOI: 10.3389/fpls.2016.01364

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Linking demographic responses and life history tactics from longitudinal data in mammals

Marlène Gamelon, Jean-Michel Gaillard, Olivier Gimenez, Tim Coulson, Shripad Tuljapurkar, Éric Baubet

Oikos . 125 ( 3 ) : 395-404

DOI: 10.1111/oik.02582

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Invasion speeds of Triatoma dimidiata, vector of Chagas disease: An application of orthogonal polynomials method

Mohammed Mesk, Tewfik Mahdjoub, Sébastien Gourbière, Jorge E. Rabinovich, Frédéric Menu

Journal of Theoretical Biology . 395 : p. 126–143

DOI: 10.1016/j.jtbi.2016.01.017

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The host specificity of ape malaria parasites can be broken in confined environments

Barthélémy Ngoubangoye, Larson Boundenga, Céline Arnathau, Illich Manfred Mombo, Durand Patrick, Thierry-Audrey Tsoumbou...

International Journal for Parasitology . 46 ( 11 ) : 737-744

DOI: 10.1016/j.ijpara.2016.06.004

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Morphological response of planktic foraminifers to habitat modifications associated with the emergence of the Isthmus of Panama

D.N. Schmidt, A.G.M. Caromel, O. Seki, J.W.B. Rae, Sabrina Renaud

Marine Micropaleontology . 128 : 28-38

DOI: 10.1016/j.marmicro.2016.08.003

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Insights on the virulence of swine respiratory tract mycoplasmas through genome-scale metabolic modeling

Mariana G. Ferrarini, Franciele M. Siqueira, Scheila G. Mucha, Tony Lionel Palama, Elodie Jobard, Bénédicte Elena-Herrmann...

BMC Genomics . 17 ( 1 ) : 353

DOI: 10.1186/s12864-016-2644-z

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