GECO Génomique Computationnelle et Evolutive

Equipe Bioinformatique, Phylogénie et Génomique Évolutive

Equipe Baobab

Publications

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Susceptibility to Aminoglycosides of 63 Strains of Stomatococcus mucilaginosus Isolated from Sputum

Monique Chomarat, Marie-Gabrielle Vital, Jean-Pierre Flandrois

Zentralblatt fur Bakteriologie, Mikrobiologie, und Hygiene. Series A, Medical microbiology, infectious diseases, virology, parasitology . 276 ( 1 ) : 63-67

DOI: 10.1016/S0934-8840(11)80219-7

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[Expert systems and antibiotic sensitivity test].

Jean-Pierre Flandrois, G. Carret

Annales de Biologie Clinique . 49 ( 3 ) : 166-71

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Coagulase-negative staphylococci emerging during teicoplanin therapy and problems in the determination of their sensitivity

Monique Chomarat, Daniel Espinouse, Jean-Pierre Flandrois

Journal of Antimicrobial Chemotherapy . 27 ( 4 ) : 475-480

DOI: 10.1093/jac/27.4.475

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Identification des organismes et construction de phylogénies moléculaires par comparaison de séquences d'acides nucléiques

Richard Christen, Bénédicte Lafay, Philippe Elbaze, Valérie Boivin, Valérie O. Cilia

Océanis : Série de documents océanographiques . 17 ( 3 ) : 239-256

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Regulation of the acetate operon in Escherichia coli: purification and functional characterization of the IclR repressor.

Jc Cortay, D. Negre, A. Galinier, B. Duclos, G. Perriere, Aj Cozzone

EMBO Journal . 10 : 675-679

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Primary structure of the intergenic region between aceK and iclR in the Escherichia coli chromosome.

A. Galinier, F. Bleicher, D. Negre, G. Perriere, B. Duclos, Aj Cozzone...

Gene . 97 : 149-150

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Comparison of estimates of Monod's growth model from the same data set

J.R. Lobry, Jean-Pierre Flandrois

Binary . 3 : 20-23

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Time-killing curves of Pseudomonas aeruginosa strains exposed to polymyxin B

M. Peyret, Jean-Pierre Flandrois, G. Fardel

Pathologie Biologie . 39 : 446-450

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Etude sur quatre ans des cas de yersiniose dans un service d'hépato-gastro-entérologie de la région lyonnaise

Jean-Pierre Flandrois, F. Bailly, M. Peyret, L. Descos

Médecine et Maladies Infectieuses . 21 : 371-375

DOI: 10.1016/S0399-077X(05)81308-3

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[Influence of the culture medium (Isosensitest or Mueller-Hinton) on the results of antibiotics susceptibility testing and its interpretation].

Jean-Pierre Flandrois, M. Peyret, J Zindel

Pathologie Biologie . 39 ( 5 ) : 455-60

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[Time-killing curves of Pseudomonas aeruginosa strains exposed to polymyxin B].

M. Peyret, Jean-Pierre Flandrois, G. Fardel

Pathologie Biologie . 39 ( 5 ) : 446-50

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Biphasic kinetics of bacterial killing by quinolones

G. Carret, Jean-Pierre Flandrois, Jean R Lobry

Journal of Antimicrobial Chemotherapy . 27 ( 3 ) : 319-327

DOI: 10.1093/jac/27.3.319

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Preparation of a Latex Reagent for the Detection of Anti-Staphylococcus aureus Ribitol Teichoic Acid Antibodies

Michèle de Montclos, Jean-Pierre Flandrois

Zentralblatt fur Bakteriologie, Mikrobiologie, und Hygiene. Series A, Medical microbiology, infectious diseases, virology, parasitology . 274 ( 1 ) : 50-60

DOI: 10.1016/S0934-8840(11)80974-6

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[Mathematical study of the sensitivity curves of Escherichia coli exposed to polymyxins].

M. Peyret, G. Carret, C. Carré, G. Fardel, Jean-Pierre Flandrois

Pathologie Biologie . 38 ( 5 ) : 441-5

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Mathematical study of the sensitivity curves of Escherichia coli exposed to polymyxins

M. Peyret, Jean-Pierre Flandrois, G. Fardel

Pathologie Biologie . 38 : 441-445

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Molecular phylogeny of Rodentia Lagomorpha Primates Artiodactyla and Carnivora and molecular clocks

W.-H. Li, Manolo Gouy, P.M. Sharp, C. O'Huigin, Y.W. Yang

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 87 ( 17 ) : 6703-6707

DOI: 10.1073/pnas.87.17.6703

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Isolation ofSporosarcina ureae from a bronchial biopsy in a child with cystic fibrosis

Jean-Pierre Flandrois, M. Chomarat, M. Montclos, F. Breysse

European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases . 9 ( 4 ) : 302-303

DOI: 10.1007/bf01968068

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Phylogenetic analysis based on rRNA sequences supports the archaebacterial rather than the eocyte tree

Manolo Gouy, W.-H. Li

Nature . 339 : 145-147

DOI: 10.1038/339145a0

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[Value of enzymuria during antibacterial therapy].

C Flandrois, Jean-Pierre Flandrois, D Coullioud, I Maire

Pathologie Biologie . 37 ( 5 Pt 2 ) : 657-63

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Bacterial Strain Characterization Using Mathematical Modelling of Growth

Marie-Joëlle Rochet, Jean-Pierre Flandrois

Zentralblatt fur Bakteriologie, Mikrobiologie, und Hygiene. Series A, Medical microbiology, infectious diseases, virology, parasitology . 271 ( 1 ) : 2-10

DOI: 10.1016/S0934-8840(89)80047-7

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Date of the monocot-dicot divergence estimated from chloroplast DNA sequence data

K.H. Wolfe, Manolo Gouy, Y.W. Yang, P.M. Sharp, W.-H. Li

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 86 ( 16 ) : 6201-6205

DOI: 10.1073/pnas.86.16.6201

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[Interpretative reading and quality control of an antibiotic sensitivity test using an expert system. Application to the API ATB system and Enterobacteriaceae].

M. Peyret, Jean-Pierre Flandrois, G. Carret, C. Pichat

Pathologie Biologie . 37 ( 5 Pt 2 ) : 624-8

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[Bacteriostatic and bactericidal antibiotics: differences in subinhibitory concentration effects on the growth of Escherichia coli].

S Comby, G. Carret, A. Pavé, Jean-Pierre Flandrois, C. Pichat

Pathologie Biologie . 37 ( 5 ) : 335-40

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Mathematical modelling of growth of Escherichia coli at subinhibitory levels of chloramphenicol or tetracyclines

Jean-Pierre Flandrois, S. Comby, J.P. Flandrois, G. Carret, C. Pichat

Research in Microbiology . 140 ( 3 ) : 243-254

DOI: 10.1016/0923-2508(89)90079-X

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RPA190 the gene coding for the largest subunit of yeast RNA polymerase A

S. Memet, Manolo Gouy, C. Marck, A. Sentenac, J.M. Buhler

Journal of Biological Chemistry . 263 ( 6 ) : 2830-2839

DOI: 10.1016/S0021-9258(18)69144-6

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Mathematical modelling of bacterial growth at subinhibitory levels of aminoglycosides

Jean-Pierre Flandrois, S Comby, G. Carret, C. Pichat

Annales de l'Institut Pasteur / Microbiologie . 139 ( 5 ) : 613-629

DOI: 10.1016/0769-2609(88)90159-7

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[An expert system as an aid to the validation of results of the antibiogram. Feasibility study based on the example of Staphylococcus aureus].

S Comby, Jean-Pierre Flandrois, A. Pavé

Pathologie Biologie . 36 ( 5 ) : 381-5

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[Demonstration of an inoculum effect on the estimation of the minimal inhibitory concentration of LY 146032].

Jean-Pierre Flandrois, G. Carret, M. Peyret, Catherine Pichat

Pathologie Biologie . 36 ( 5 ) : 377-80

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