Publications
Affichage des publications 91 à 120 sur 211 au total
Close 3D proximity of evolutionary breakpoints argues for the notion of spatial synteny
BMC Genomics . 12 ( 1 ) : 303
Article dans une revue
voir la publicationWolbachia detection: an assessment of standard PCR protocols.
Molecular Ecology Resources . 11 ( 3 ) : 567-72
Article dans une revue
voir la publicationInitial metabolic reconstruction of Klebsiella pneumoniae Kp13, a multidrug resistant pathogen involved in nosocomial outbreaks in Brazil
X-meeting .
Acte de congrès
voir la publicationUsing the “CycADS” annotation management system to develop a BioCyc metabolic network database for sequenced arthropods genomes: first steps towards “ArthropodsCyc”
Rencontres bioinformaticiens et statisticiens de l’INRA . : 1 p.
Poster
voir la publicationAbsence of a core metabolic network common to symbiotic bacteria
6. Meeting GDRE-RA Comparative genomics . : 33 diapositives
Acte de congrès
voir la publicationCycADS: an annotation database system to ease the development and update of BioCyc databases.
Database - The journal of Biological Databases and Curation . 2011 : bar008
Article dans une revue
voir la publicationBacterial syntenies: an exact approach with gene quorum.
BMC Bioinformatics . 12 : 193
Article dans une revue
voir la publicationMetExplore: a web server to link metabolomic experiments and genome-scale metabolic networks
JOBIM 2010 . : 1 p.
Poster
voir la publicationMod/Resc Parsimony Inference
Combinatorial Pattern Matching . 6129 : 202--213
Acte de congrès
voir la publicationA note on the complexity of finding and enumerating elementary modes.
BioSystems . 99 ( 3 ) : 210-4
Article dans une revue
voir la publicationA tale of genome, annotations, metabolism and phylogenomics: the pea aphid genome resources
10. Cold Spring Harbor Laboratory / Wellcome Trust conference on Genome Informatics . : 1 p.
Poster
voir la publicationEnumerating Chemical Organisations in Consistent Metabolic Networks: Complexity and Algorithms
Algorithms in Bioinformatics . 6293 : 226-237
Acte de congrès
voir la publicationUsing the “CycADS” annotation management system to develop a BioCyc metabolic network database for sequenced arthropods genomes: first steps towards “ArthropodsCyc”
4. Annual Arthropod Genomics Symposium on “Arthropod Genomics: New Approaches and Outcomes” . : 45 p.
Poster
voir la publicationIdentifying SNPs without a reference genome by comparing raw reads
String Processing and Information Retrieval . 6393 : 147-158
Acte de congrès
voir la publicationCassis: detection of genomic rearrangement breakpoints.
Bioinformatics . 26 ( 15 ) : 1897-8
Article dans une revue
voir la publicationGenome Sequence of the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum
PLoS Biology . 8 ( 2 ) : e1000313
Article dans une revue
voir la publicationRepetition-free longest common subsequence
Discrete Applied Mathematics . 158 ( 12 ) : 1315-1324
Article dans une revue
voir la publicationCombination of measures distinguishes pre-miRNAs from other stem-loops in the genome of the newly sequenced Anopheles darlingi
BMC Genomics . 11 ( 1 ) : 529
Article dans une revue
voir la publicationMetExplore: a web server to link metabolomic experiments and genome-scale metabolic networks.
Nucleic Acids Research . 38 ( Web Server issue ) : W132-7
DOI: 10.1093/nar/gkq312
Article dans une revue
voir la publicationGraph-based analysis of the metabolic exchanges between two co-resident intracellular symbionts, Baumannia cicadellinicola and Sulcia muelleri, with their insect host, Homalodisca coagulata.
PLoS Computational Biology . 6 ( 9 ) : epub ahead of print
Article dans une revue
voir la publicationSystemic analysis of the symbiotic function of Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid Acyrthosiphon pisum.
Comptes Rendus Biologies . 332 ( 11 ) : 1034-49
Article dans une revue
voir la publicationThe Acyrthosiphon pisum Cyc database (AcypiCyc) created using a novel BioCyc Annotation Database System (CycADS): a useful tool to explore and study the pea aphid metabolism
5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2, Barcelona, Espagne, juin 2009 .
Acte de congrès
voir la publicationFootprints of Inversions at Present and Past Pseudoautosomal Boundaries in Human Sex Chromosomes
Genome Biology and Evolution . 1(1) : 56-66
Article dans une revue
voir la publicationIdentification of expressed transposable element insertions in the sequenced genome of Drosophila melanogaster
Gene . 439 : 55-62
Article dans une revue
voir la publicationAnalysis of fine-scale mammalian evolutionary breakpoints provides new insight into their relation to genome organisation
BMC Genomics . 10 ( 1 ) : 335
Article dans une revue
voir la publicationMultiple alignment of biological networks: A flexible approach
Combinatorial Pattern Matching (CPM) . 5577 : 263-273
Acte de congrès
voir la publicationAssessing the exceptionality of coloured motifs in networks
EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology . 2009 : 9 pages on line
DOI: 10.1155/2009/616234
Article dans une revue
voir la publicationAcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) and CycADS (Cyc Annotation Database System): moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses
8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009) . : 1-1
Acte de congrès
voir la publicationCurrent tools for the identification of miRNA genes and their targets
Nucleic Acids Research . 2009 : 2419-2433
Article dans une revue
voir la publicationLossless filter for multiple repeats with bounded edit distance
Algorithms for Molecular Biology . 4 ( 1 ) : 3
Article dans une revue
voir la publication