Intérêts :

Phylogénomique, génomique comparative, coévolution multi-échelle, réconciliation phylogénétique, représentation d'arbres, clustering de séquences,  web.

Base de données HOGENOM :  http://hogenom.univ-lyon1.fr/

Logiciel Thirdkind : https://github.com/simonpenel/thirdkind/wiki

 

Développement:

https://github.com/simonpenel

Rust :

https://crates.io/crates/light_phylogeny

https://crates.io/crates/thirdkind

Node.js, D3.js,  Docker :

https://gitlab.in2p3.fr/penel/docker-hogenom-compose

Participation à d'autres projets :

https://gitlab.com/vmiele/silix/

https://project.inria.fr/treerecs/

 

 

 

Publications

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