GECO Génomique Computationnelle et Evolutive
Equipe Bioinformatique, Phylogénie et Génomique Evolutive
Lartillot Nicolas
Directeur de recherche
CNRS
Tél : 04 72 44 84 87
Publications
Affichage des publications 31 à 60 sur 73 au total
A mixed relaxed clock model
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 371 : 20150132
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voir la publicationReply to Halanych et al.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 113 ( 8 ) : E948-E949
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voir la publicationRevBayes: Bayesian Phylogenetic Inference Using Graphical Models and an Interactive Model-Specification Language
Systematic Biology . 65 : 726-36
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voir la publicationProbabilistic models of eukaryotic evolution: time for integration
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 370 ( 1678 ) : 20140338
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voir la publicationGenomic data do not support comb jellies as the sister group to all other animals
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 112 ( 50 ) : 15402-15407
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voir la publicationMonte Carlo algorithms for Brownian phylogenetic models
Bioinformatics . 30 ( 21 ) : 3020-3028
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voir la publicationA phylogenetic Kalman filter for ancestral trait reconstruction using molecular data
Bioinformatics . 30 ( 4 ) : 488-96
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voir la publicationSite-heterogeneous mutation-selection models within the PhyloBayes-MPI package
Bioinformatics . 30 ( 7 ) : 1020-1
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voir la publicationReconstructing the Phylogenetic History of Long-Term Effective Population Size and Life-History Traits Using Patterns of Amino Acid Replacement in Mitochondrial Genomes of Mammals and Birds
Genome Biology and Evolution . 5 ( 7 ) : 1273 - 1290
DOI: 10.1093/gbe/evt083
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voir la publicationLateral Gene Transfer from the Dead.
Systematic Biology . 62 ( 3 ) : 386-397
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voir la publicationPhylogenetic Patterns of GC-Biased Gene Conversion in Placental Mammals and the Evolutionary Dynamics of Recombination Landscapes
Molecular Biology and Evolution . 30 ( 3 ) : 489-502
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voir la publicationAn Experimentally Tested Scenario for the Structural Evolution of Eukaryotic Cys2His2 Zinc Fingers from Eubacterial Ros Homologs
Molecular Biology and Evolution . 30 ( 7 ) : 1504 - 1513
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voir la publicationInteraction between Selection and Biased Gene Conversion in Mammalian Protein-Coding Sequence Evolution Revealed by a Phylogenetic Covariance Analysis
Molecular Biology and Evolution . 30 : 356 - 368
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voir la publicationStatistical Potentials for Improved Structurally Constrained Evolutionary Models
Molecular Biology and Evolution . 27 ( 7 ) : 1546 - 1560
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voir la publicationA Phylogenetic Model for Investigating Correlated Evolution of Substitution Rates and Continuous Phenotypic Characters
Molecular Biology and Evolution . 28 ( 1 ) : 729 - 744
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voir la publicationA Dirichlet Process Covarion Mixture Model and Its Assessments Using Posterior Predictive Discrepancy Tests
Molecular Biology and Evolution . 27 ( 2 ) : 371-384
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voir la publicationFast optimization of statistical potentials for structurally constrained phylogenetic models
BMC Evolutionary Biology . 9 ( 1 ) : 227
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voir la publicationComputational Methods for Evaluating Phylogenetic Models of Coding Sequence Evolution with Dependence between Codons
Molecular Biology and Evolution . 26 ( 7 ) : 1663 - 1676
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voir la publicationBayesian computation for statistical models with intractable normalizing constants
Pré-publication
voir la publicationImprovement of Molecular Phylogenetic Inference and the Phylogeny of Bilateria
Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences (1934–1990) . 363 ( 1496 ) : 1463-1472
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voir la publicationUniformization for Sampling Realizations of Markov Processes: Applications to Bayesian Implementations of Codon Substitution Models
Bioinformatics . 24 ( 1 ) : 56-62
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voir la publicationPhylogenetic Mixture Models for Proteins
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 363 : 3965-3976
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voir la publicationBayesian Comparisons of Codon Substitution Models
Genetics . 180 ( 3 ) : 1579-1591
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voir la publicationA Site- and Time-Heterogeneous Model of Amino Acid Replacement
Molecular Biology and Evolution . 25 ( 5 ) : 842-858
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voir la publicationAdditional molecular support for the new chordate phylogeny.
Genesis - The Journal of Genetics and Development . 46 ( 11 ) : 592-604
DOI: 10.1002/dvg.20450
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voir la publicationEmpirical Profile Mixture Models for Phylogenetic Reconstruction
Bioinformatics . 29 : 2317-2323
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voir la publicationParallel Adaptations to High Temperatures in the Archean Eon
Nature . 456 ( 7224 ) : 942-945
DOI: 10.1038/nature07393
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voir la publicationA General Comparison of Relaxed Molecular Clock Models
Molecular Biology and Evolution . 24 ( 12 ) : 2669-2680
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voir la publicationExploring Fast Computational Strategies for Probabilistic Phylogenetic analysis
Systematic Biology . 56 : 711-726
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