GECO Génomique Computationnelle et Evolutive

Equipe Bioinformatique, Phylogénie et Génomique Evolutive

Coluzzi Charles

Enseignant-chercheur CPJ

UCBL

Adresse : 43 bd du 11 novembre 1918
69622 VILLEURBANNE cedex

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Publications

Affichage des publications 1 à 17 sur 17 au total

Evo‐Scope : Fully automated assessment of correlated evolution on phylogenetic trees

Maxime Godfroid, Charles Coluzzi, Amaury Lambert, Philippe Glaser, Eduardo P C Rocha, Guillaume Achaz

Methods in Ecology and Evolution . 15 ( 2 ) : 282 - 289

DOI: 10.1111/2041-210x.14190

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Hijackers, hitchhikers, or co-drivers? The mysteries of mobilizable genetic elements

Manuel Ares-Arroyo, Charles Coluzzi, Jorge A Moura de Sousa, Eduardo P C Rocha

PLoS Biology . 22 ( 8 ) : e3002796

DOI: 10.1371/journal.pbio.3002796

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A type IVB secretion system contributes to the pathogenicity of Yersinia pseudotuberculosis strains responsible for the Far East scarlet-like fever

Marion Lemarignier, Cyril Savin, Ines Ruedas Torres, Anne Derbise, Charles Coluzzi, Julien Burlaud-Gaillard...

DOI: 10.1101/2024.06.14.598817

Pré-publication

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Chance Favors the Prepared Genomes: Horizontal Transfer Shapes the Emergence of Antibiotic Resistance Mutations in Core Genes

Charles Coluzzi, Martin Guillemet, Fanny Mazzamurro, Marie Touchon, Maxime Godfroid, Guillaume Achaz...

Molecular Biology and Evolution . 40 ( 10 ) : msad217

DOI: 10.1093/molbev/msad217

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ICEscreen

Hélène Chiapello, Charles Coluzzi, Nathalie N. Leblond-Bourget, Thomas Lacroix, Julie Lao, Gérard Guédon

Logiciel

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ICEscreen: a valuable tool for automatic detection of ICEs and IMEs in Firmicutes

Nathalie N. Leblond-Bourget, Julie Lao, Sophie Payot, Thomas Lacroix, Gérard Guédon, Charles Coluzzi...

Réunion du GDR3546 Eléments transposables .

Acte de congrès

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ICEscreen: a tool to detect Firmicute ICEs and IMEs, isolated or enclosed in composite structures

Julie Lao, Thomas Lacroix, Gérard Guédon, Charles Coluzzi, Sophie Payot, Nathalie Leblond-Bourget...

NAR Genomics and Bioinformatics . 4 ( 4 ) : lqac079

DOI: 10.1093/nargab/lqac079

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NAR Breakthrough Article Origins of transfer establish networks of functional dependencies for plasmid transfer by conjugation

Manuel Ares-Arroyo, Charles Coluzzi, Eduardo P.C. Rocha

Nucleic Acids Research . 51 ( 7 ) : 3001–3016

DOI: 10.1093/nar/gkac1079

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Streptococcus suis as a reservoir of antibiotic resistance genes carried by Mobile Genetic Elements transferring by conjugation

Sophie Payot, Virginie Libante, Yves Nombre, Charles Coluzzi, Johan Staub, Gérard Guédon...

5th International Caparica Congress in Antibiotic Resistance (IC2AR 2022) .

Acte de congrès

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Evolution of Plasmid Mobility: Origin and Fate of Conjugative and Nonconjugative Plasmids

Charles Coluzzi, Maria Pilar Garcillán-Barcia, Fernando de la Cruz, Eduardo P.C. Rocha

Molecular Biology and Evolution . 39 ( 6 ) : msac115

DOI: 10.1093/molbev/msac115

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Intracellular Salmonella Paratyphi A is motile and differs in the expression of flagella-chemotaxis, SPI-1 and carbon utilization pathways in comparison to intracellular S. Typhimurium

Helit Cohen, Claire Hoede, Felix Scharte, Charles Coluzzi, Emiliano Cohen, Inna Shomer...

PLoS Pathogens . 18 ( 4 ) : 35 p.

DOI: 10.1371/journal.ppat.1010425

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Chromosomal Conjugative and Mobilizable Elements in Streptococcus suis: Major Actors in the Spreading of Antimicrobial Resistance and Bacteriocin Synthesis Genes

Virginie Libante, Yves Nombre, Charles Coluzzi, Johan Staub, Gérard Guédon, Marcelo Gottschalk...

Pathogens . 9 ( 1 ) : 22

DOI: 10.3390/pathogens9010022

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Key role of chromosomal mobile genetic elements transferred by conjugation in the dissemination of antimicrobial resistance in S. suis

Virginie Libante, Yves Nombre, Charles Coluzzi, Johan Staub, Gérard Guédon, Marcelo Gottschalk...

4th International Workshop on Streptococcus suis .

Acte de congrès

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L'exploration des génomes par l'outil ICEFinder révèle la forte prévalence et l'extrême diversité des ICE et des IME de streptocoques

Charles Coluzzi

Thèse

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A Glimpse into the World of Integrative and Mobilizable Elements in Streptococci Reveals an Unexpected Diversity and Novel Families of Mobilization Proteins

Charles Coluzzi, Gérard Guédon, Marie-Dominique Devignes, Chloé C. Ambroset, Valentin Loux, Thomas Lacroix...

Frontiers in Microbiology . 8 : 16

DOI: 10.3389/fmicb.2017.00443

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The obscure world of integrative and mobilizable elements

Gérard Guédon, Virginie Libante, Charles Coluzzi, Sophie Payot, Nathalie N. Leblond-Bourget

Genes . 8 ( 11 ) : 337

DOI: 10.3390/genes8110337

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A glimpse into an unexplored world: very high diversity of integrative and mobilizable elements in Streptococci

Charles Coluzzi, Gérard Guédon, Chloé Ambroset, Marie-Dominique Devignes, Sophie Payot, Nathalie N. Leblond-Bourget

8th ASM conference on Streptococcal Genetics .

Poster

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