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Publications

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Identifying repeats and transposable elements in sequenced genomes: how to find your way through the dense forest of programs

E. Lerat

Heredity . -- : 1-14

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Do elephants prevent other African herbivores from using waterholes in the dry season?

Marion Valeix, Hervé Fritz, Violaine Canévet, Sébastien Le Bel, Hillary Madzikanda

Biodiversity and Conservation . 18 ( 3 ) : 569-576

DOI: 10.1007/s10531-008-9523-0

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Patterns biogéographiques de la diversité bactérienne des sols à l'échelle du territoire national

Samuel S. Dequiedt, Mélanie M. Lelievre, Claudy C. Jolivet, Manuel M. Martin, Nicolas N. Saby, Benoit B. Toutain...

Congrès AFEM (Association Francophone pour l'Ecologie Microbienne . : n.p.

Acte de congrès

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Microbial-biogeography at the scale of France by the use of molecular tools applied to the French soil quality monitoring network (RMQS)

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré, Samuel Dequiedt, Jean Thioulouse, Claudy C. Jolivet, Nicolas N. Saby, Mélanie M. Lelievre...

BAGECO10 .

Acte de congrès

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Prédiction des propriétés du sol à l’échelle nationale à partir des données du RMQS : Exemple des Éléments Trace Métalliques

Nicolas N. Saby, Claudy C. Jolivet, Line Boulonne, Céline Ratié, Ben P. Marchant, R. Murray Lark...

10. Journées d'Etude des Sols .

Acte de congrès

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Diversité des communautés microbiennes telluriques à l'échelle du territoire national

Samuel S. Dequiedt, Mélanie M. Lelievre, Claudy C. Jolivet, Manuel Martin, Nicolas Saby, Dominique Arrouays...

Journées d'Etude des Sols . : 151-152

Acte de congrès

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ECOMIC-RMQS : biogéographie microbienne à l’échelle de la France. Etat d’avancement et premiers résultats

Samuel Dequiedt, Maud Lelièvre, Claudy C. Jolivet, Nicolas N. Saby, Manuel Pascal Martin, J. Thioulouse...

Étude et Gestion des Sols . 16 ( 3-4 ) : 219-231

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À propos de la biométrie

Sandrine Charles, Joanna Jongwane

Interstices .

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Ecophysiological attributes of adult overwintering in insects: insights from a field study of the nut weevil, Curculio nucum

Marie-Claude Bel-Venner, Nathalie Mondy, Florent Arthaud, Julien Marandet, David Giron, Samuel Venner...

Physiological Entomology . 34 : 61-70

DOI: 10.1111/j.1365-3032.2008.00652.x

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Maintenance of adaptive differentiation by Wolbachia induced bidirectional cytoplasmic incompatibility: the importance of sib-mating and genetic systems.

Antoine Branca, Fabrice Vavre, Jean-François Silvain, Stéphane Dupas

BMC Evolutionary Biology . 9 : 185

DOI: 10.1186/1471-2148-9-185

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Hybrid sterility and inviability in the parasitic fungal species complex Microbotryum

Damien de Vienne, G Refrégier, Me Hood, A Guigue, B Devier, E Vercken...

Journal of Evolutionary Biology . 22 ( 4 ) : 683--698

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Blackwell Publishing LtdA relict bank vole lineage highlights the biogeographic history of the Pyrenean region in Europe

V. Deffontaine, R. Ledevin, M. C. Fontaine, J-P. Quéré, Sabrina Renaud, R. Libois...

Molecular Ecology . 18 : 2489-2502

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The relationship between DNA replication and human genome organization.

Anamaria Necsulea, Claire Guillet, Jean-Charles Cadoret, Marie-Noëlle Prioleau, L. Duret

Molecular Biology and Evolution . 26 ( 4 ) : 729-741

DOI: 10.1093/molbev/msn303

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Multiple alignment of biological networks: A flexible approach

Yves-Pol Deniélou, Frédéric Boyer, Alain Viari, Marie-France Sagot

Combinatorial Pattern Matching (CPM) . 5577 : 263-273

DOI: 10.1007/978-3-642-02441-2_23

Acte de congrès

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Assessing the exceptionality of coloured motifs in networks

Sophie S. Schbath, Vincent Lacroix, Marie-France Sagot

EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology . 2009 : 9 pages on line

DOI: 10.1155/2009/616234

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Les Harttiini (Siluriformes, Loricariidae) des Guyanes : phylogénie et évolution des formes ou variation sur un même thème

Raphaël Covain, Sonia Fisch-Muller, Juan Montoya-Burgos, Jan Mol, Pierre-Yves Le Bail, Stéphane Dray

4. Rencontres de l'Ichtyologie en France .

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On the Use of Phylogeny-Based Tests to Detect Association between Quantitative Traits and Haplotypes

Claire Bardel, Vincent Danjean, Pierre-Emmanuel Morange, Emmanuelle Génin, Pierre Darlu

Genetic Epidemiology . 33 ( 8 ) : 729-739

DOI: 10.1002/gepi.20425

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Fast optimization of statistical potentials for structurally constrained phylogenetic models

Cécile Bonnard, Claudia L. Kleinman, Nicolas Rodrigue, Nicolas Lartillot

BMC Evolutionary Biology . 9 ( 1 ) : 227

DOI: 10.1186/1471-2148-9-227

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Des espèces en nombre

Sandrine Charles, Hubert Charles

Interstices .

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Student's Performance and Satisfaction with Web vs. paper-based practice quizzes and lecture notes

Mônica Macedo-Rouet, Muriel Ney, Sandrine Charles, Geneviève Lallich-Boidin

Computers and Education . 53 ( 2 ) : 375-384

DOI: 10.1016/j.compedu.2009.02.013

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DEBtox theory and matrix population models as helpful tools in understanding the interaction between toxic cyanobacteria and zooplankton

Elise Billoir, Aloysio da Silva Ferrão-Filho, Marie Laure Delignette-Muller, Sandrine Charles

Journal of Theoretical Biology . 258 ( 3 ) : 380

DOI: 10.1016/j.jtbi.2008.07.029

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Toxicity of ivermectin on cladocerans: comparison of toxic effects on daphnia and ceriodaphnia species

Christelle Lopes, Sandrine Charles, B. Vollat, J. Garric

Environmental Toxicology and Chemistry . 28(10) : 2160-2166

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Matrix Population Models as Relevant Modeling Tools in Ecotoxicology

Sandrine Charles, E. Billoir, Christelle Lopes, Arnaud Chaumot

incollection . 2 : 261-298

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A Virus-Shaping Reproductive Strategy in a Drosophila Parasitoid

Julien Varaldi, Sabine Patot, Maxime Nardin, Sylvain Gandon

Advances in Parasitology . 70 : 334-359

DOI: 10.1016/S0065-308X(09)70013-2

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Molecular Detection Penetrance and Transmission of an Inherited Virus Responsible for Behavioral Manipulation of an Insect Parasitoid

S. Patot, D. Lepetit, D. Charif, Julien Varaldi, Frédéric Fleury

Applied and Environmental Microbiology . 75 ( 3 ) : 703-710

DOI: 10.1128/AEM.01778-08

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Dynamics of transposable elements:towards a community ecology of the genome

Samuel Venner, C. Feschotte, C. Biémont

Trends in Genetics . 25(7) : 317-323

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Spatially heterogeneous stochasticity and the adaptive diversification of dormancy

Etienne Rajon, Samuel Venner, F. Menu

Journal of Evolutionary Biology . 22 : 2094-2103

DOI: 10.1111/j.1420-9101.2009.01825.x

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Wolbachia interferes with ferritin expression and iron metabolism in insects.

Natacha Kremer, Denis Voronin, Delphine Charif, Patrick Mavingui, Bertrand Mollereau, Fabrice Vavre

PLoS Pathogens . 5 ( 10 ) : e1000630

DOI: 10.1371/journal.ppat.1000630

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Interactions between vertically transmitted symbionts: cooperation or conflict ?

E. Vautrin, F. Vavre

Trends in Microbiology . 17 : 95-99

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