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Publications

Affichage des publications 4081 à 4110 sur 6824 au total

Phylo-MCOA: a fast and efficient method to detect outlier genes and species in phylogenomics using multiple co-inertia analysis

Damien M. de Vienne, Sébastien Ollier, Gabriela Aguileta

Molecular Biology and Evolution . 29 ( 6 ) : 1587--1598

DOI: 10.1093/molbev/msr317

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The CycADS annotation database system to support the development and update of enriched BioCyc databases. Development of ad hoc BioCyc DB : AcypiCyc, ArthopodaCyc

Patrice Baa-Puyoulet, Augusto Vellozo, Jaime Huerta-Cepas, Gérard Febvay, Toni Gabaldon, Marie-France Sagot...

5. Réunion Réseau BAPOA .

Poster

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Navigating the unexplored seascape of pre-miRNA candidates in single-genome approaches.

Nuno D Mendes, Steffen Heyne, Ana T Freitas, Marie-France Sagot, Rolf Backofen

Bioinformatics . 28 ( 23 ) : 3034-3041

DOI: 10.1093/bioinformatics/bts574

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Variability among tobacco cyst nematode subspecies and consequences on their sustainable management with host resistances

Charline Alenda, Didier Fouville, Aurore Gallot-Le Grand, Nicolas Mariette, Eric Grenier

Journal of Nematology . 44 (4) : np

Acte de congrès

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BioNLP Shared Task - The Bacteria Track

Robert Bossy, Julien Jourde, Alain-Pierre Manine, Philippe Veber, Erick Alphonse, Maarten van de Guchte...

BMC Bioinformatics . 13 : np

DOI: 10.1186/1471-2105-13-S11-S3

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Analysis of RNA Transcripts by High-Throughput RNA Sequencing

Paolo Ribeca, Vincent Lacroix, Michael Sammeth, Roderic Guigó

Alternative pre-mRNA Splicing: Theory and Protocols . 9783527636778

DOI: 10.1002/9783527636778.ch50

Chapitre d'ouvrage

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Molecular organization, biochemical function, cellular role and evolution of NfuA, an atypical Fe-S carrier.

Béatrice Py, Catherine Gerez, Sandra Angelini, Rémy Planel, Daniel Vinella, Laurent Loiseau...

Molecular Microbiology . 86 ( 1 ) : 155-71

DOI: 10.1111/j.1365-2958.2012.08181.x

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Spotlight on the Thaumarchaeota

C. Brochier-Armanet, Simonetta Gribaldo, Patrick Forterre

The International Society of Microbiologial Ecology Journal . 6 : 227-230

DOI: 10.1038/ismej.2011.145

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Vitellogenin-like protein measurement in caged Gammarus fossarum males as a biomarker of endocrine disruptor exposure: Inconclusive experience

Guillaume Jubeaux, Romain Simon, Arnaud Salvador, Christelle Lopes, Emilie Lacaze, Hervé Quéau...

Aquatic Toxicology . 122 : 9-18

DOI: 10.1016/j.aquatox.2012.05.007

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Accurate Estimation of Substitution Rates with Neighbor-Dependent Models in a Phylogenetic Context

Jean Bérard, Laurent Guéguen

Systematic Biology . 61 ( 3 ) : 510-521

DOI: 10.1093/sysbio/sys024

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Comparison of bioassays with different exposure time patterns: The added value of dynamic modelling in predictive ecotoxicology

Elise Billoir, Hélène Delhaye, Carole Forfait-Dubuc, Bernard Clément, Gaëlle Triffault-Bouchet, Sandrine Charles...

Ecotoxicology and Environmental Safety . 75 : 80-86

DOI: 10.1016/j.ecoenv.2011.08.006

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A handbook for uncovering the complete energetic budget in insects: the van Handel's method (1985) revisited

Vincent Foray, Pierre-François Pelisson, Marie-Claude Bel-Venner, Emmanuel Desouhant, Samuel Venner, Frédéric Menu...

Physiological Entomology . 37 ( 3 ) : 295-302

DOI: 10.1111/j.1365-3032.2012.00831.x

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Effects of deltamethrin on the specific discrimination of sex pheromones in two sympatric Trichogramma species

Jean-Marie Delpuech, C. Dupont, R. Allemand

Ecotoxicology and Environmental Safety . 84 : 32--38

DOI: 10.1016/j.ecoenv.2012.06.007

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Complete Genome Sequence of "Candidatus Portiera aleyrodidarum" BT-QVLC, an Obligate Symbiont That Supplies Amino Acids and Carotenoids to Bemisia tabaci.

Diego Santos-Garcia, Pierre-Antoine Farnier, Francisco Beitia, Einat Zchori-Fein, Fabrice Vavre, Laurence Mouton...

Journal of Bacteriology . 194 ( 23 ) : 6654-6655

DOI: 10.1128/JB.01793-12

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Evolution and control of host-microbe symbiosis in arthropods: an RNAseq-based transcriptomic analysis

Yves Moné, F. Chevalier, M.C. Carpentier, N. Kremer, Patrick Mavingui, V. Raquin...

7. International Wolbachia conference . 978-2-911320-44-6

Acte de congrès

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Schwartz Formula: Is One k-Coefficient Adequate for All Children?

V. C. de Souza, Muriel Rabilloud Ferrand, P. Cochat, L. Selistre, A. Hadj-Aissa, Behrouz Kassai Koupai...

PLoS ONE . 7 : e53439

DOI: 10.1371/journal.pone.0053439

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Locally recurrent prostate cancer after initial radiation therapy: early salvage high-intensity focused ultrasound improves oncologic outcomes

S. Crouzet, F. J. Murat, P. Pommier, L. Poissonnier, G. Pasticier, O. Rouviere...

Radiotherapy & Oncology . 105 : 198--202

DOI: 10.1016/j.radonc.2012.09.014

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Fast and robust characterization of time-heterogeneous sequence evolutionary processes using substitution mapping.

Jonathan Romiguier, Emeric Figuet, Nicolas Galtier, Emmanuel J.P. Douzery, Bastien Boussau, Julien y Dutheil...

PLoS ONE . 7 ( 3 ) : e33852

DOI: 10.1371/journal.pone.0033852

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Efficient selection of branch-specific models of sequence evolution.

Julien y Dutheil, Nicolas Galtier, Jonathan Romiguier, Emmanuel J.P. Douzery, Vincent Ranwez, Bastien Boussau

Molecular Biology and Evolution . 29 ( 7 ) : 1861-1874

DOI: 10.1093/molbev/mss059

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A Phylogenomic Approach to Vertebrate Phylogeny Supports a Turtle-Archosaur Affinity and a Possible Paraphyletic Lissamphibia

Jj. Fong, Jm. Brown, Mk. Fujita, Bastien Boussau

PLoS ONE . 7 : e48990

DOI: 10.1371/journal.pone.0048990

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Evidence of diversity and recombination in Arsenophonus symbionts of the Bemisia tabaci species complex

L. Mouton, M. Thierry, H. Henri, R. Baudin, O. Gnankine, Bernard Reynaud...

BMC Microbiology . 12(Suppl 1) : 1-15

DOI: 10.1186/1471-2180-12-S1-S10

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Fitting a lognormal distribution to enumeration and absence/presence data

Natalie N. Commeau, Éric É. Parent, Marie Laure Delignette-Muller, Marie Cornu

International Journal of Food Microbiology . 155 ( 3 ) : 146 - 152

DOI: 10.1016/j.ijfoodmicro.2012.01.023

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Modeling of Clostridium perfringens vegetative cell inactivation in beef-in-sauce products: A meta-analysis using mixed linear models

S. Jaloustre, Laurent Guillier, E. Morelli, V. Noël, Marie Laure Delignette-Muller

International Journal of Food Microbiology . 154 : 44-51

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Survival data analyses in ecotoxicology: critical effect concentrations, methods and models. What should we use?

Carole Forfait-Dubuc, Sandrine Charles, Elise Billoir, Marie-Laure Delignette-Muller

Ecotoxicology . 21 : 1072--1083

DOI: 10.1007/s10646-012-0860-0

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Reappraisal of metformin efficacy in the treatment of type 2 diabetes: a meta-analysis of randomised controlled trials.

Rémy Boussageon, Irène Supper, Theodora Bejan-Angoulvant, Nadir Kellou, Michel Cucherat, Jean-Pierre Boissel...

PLoS Medicine . 9 ( 4 ) : e1001204

DOI: 10.1371/journal.pmed.1001204

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Apport de la modélisation et des populations virtuelles pour transposer les résultats des essais cliniques à la vie réelle et éclairer la décision publique

François Gueyffier, C. B. Strang, G. Berdeaux, L. R. França, P. Blin, J. Benichou...

Thérapie . 67 : 359--66

DOI: 10.2515/therapie/2012041

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Contribution of modeling approaches and virtual populations in transposing the results of clinical trials into real life and in enlightening public health decisions

François Gueyffier, Cb. Strang, G. Berdeaux, Lr. Franca, P. Blin, J. Massol

Thérapie . 67 : 367--74

DOI: 10.2515/therapie/2012042

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Virtual Patients and Sensitivity Analysis of the Guyton Model of Blood Pressure Regulation: Towards Individualized Models of Whole-Body Physiology

R. Moss, T. Grosse, I. Marchant, N. Lassau, François Gueyffier, S. R. Thomas

PLoS Computational Biology . 8 : e1002571

DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002571

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