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Publications

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Functional analysis of normalized difference vegetation index curves reveals overwinter mule deer survival is driven by both spring and autumn phenology

M. A. Hurley, M. Hebblewhite, Jean-Michel Gaillard, Stéphane Dray, K. A. Taylor, W. K. Smith...

Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 369 ( 1643 ) : 20130196

DOI: 10.1098/rstb.2013.0196

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The allometry between secondary sexual traits and body size is nonlinear among cervids

Jean-François Lemaître, Cécile Vanpé, Floriane Plard, Jean-Michel Gaillard

Biology Letters . 10 ( 3 ) : 20130869

DOI: 10.1098/rsbl.2013.0869

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Long-lived and heavier females give birth earlier in roe deer

Floriane Plard, Jean-Michel Gaillard, Tim Coulson, Mark Hewison, Daniel Delorme, Claude Warnant...

Ecography . 37 ( 3 ) : 241-249

DOI: 10.1111/j.1600-0587.2013.00414.x

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Do ecologically close species shift their daily activities when in sympatry? A test on chamois in the presence of mouflon

G. Darmon, G. Bourgoin, P. Marchand, M. Garel, D. Dubray, Jm. Jullien...

Biological Journal of the Linnean Society . 111 : 621-626

DOI: 10.1111/bij.12228

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Sex-specific adjustments in habitat selection contribute to buffer mouflon against summer conditions

P. Marchand, M. Garel, G. Bourgoin, D. Dubray, D. Maillard, A. Loison

Behavioral Ecology . 26 ( 2 ) : 472-482

DOI: 10.1093/beheco/aru212

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Early infections by myxoma virus of young rabbits (Oryctolagus cuniculus) protected by maternal antibodies activate their immune system and enhance herd immunity in wild populations.

Stéphane Marchandeau, Dominique Pontier, Jean-Sébastien Guitton, Jérôme Letty, David Fouchet, Jacky Aubineau...

Veterinary Research . 45 ( 1 ) : 26

DOI: 10.1186/1297-9716-45-26

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How reliable are morphological and anatomical characters to distinguish European wildcats, domestic cats and their hybrids in France?

S. Devillard, T. Jombart, F. Léger, Dominique Pontier, Ludovic Say, S. Ruette

Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research . 52 : 154-162

DOI: 10.1111/jzs.12049

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Unsuspected functional disparity in Devonian fishes revealed by tooth morphometrics?

Samuel Gauchey, Catherine Girard, Sylvain Adnet, Sabrina Renaud

The Science of Nature Naturwissenschaften . 101 ( 9 ) : 735 - 743

DOI: 10.1007/s00114-014-1211-1

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Reductive genome evolution at both ends of bacterial population size spectrum

Bérénice Batut, Carole Knibbe, Gabriel Marais, Vincent Daubin

Nature Reviews Microbiology . 12 ( 12 ) : 841-850

DOI: 10.1038/nrmicro3331

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Ribosomal proteins: Toward a next generation standard for prokaryotic systematics?

Hemalatha Golaconda Ramulu, Mathieu Groussin, Emmanuel Talla, Rémi Planel, Vincent Daubin, Céline Brochier-Armanet

Molecular Phylogenetics and Evolution . 75 : 103 - 117

DOI: 10.1016/j.ympev.2014.02.013

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Single acquisition of protelomerase gave rise to speciation of a large and diverse clade within the Agrobacterium/Rhizobium supercluster characterized by the presence of a linear chromid

Martha H. Ramírez-Bahena, Ludovic Vial, Florent Lassalle, Benjamin Diel, David Chapulliot, Vincent Daubin...

Molecular Phylogenetics and Evolution . 73 : 202-207

DOI: 10.1016/j.ympev.2014.01.005

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A Bayesian Method for Analyzing Lateral Gene Transfer

Joel Sjöstrand, Ali Tofigh, Vincent Daubin, Lars Arvestad, Bengt Sennblad, Jens Lagergren

Systematic Biology . 63 ( 3 ) : 409 - 420

DOI: 10.1093/sysbio/syu007

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Efficiently listing bounded length st-paths

Romeo Rizzi, Gustavo Sacomoto, Marie-France Sagot

Twenty-Fifth International Workshop on Combinatorial Algorithms (IWOCA 2014) . : in press

Acte de congrès

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Rime: Repeat identification

Maria Federico, Pierre Peterlongo, Nadia Pisanti, Marie-France Sagot

Discrete Applied Mathematics . 163 ( 3 ) : 275–286

DOI: 10.1016/j.dam.2013.02.016

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Telling metabolic stories to explore metabolomics data: a case study on the yeast response to cadmium exposure

Paulo Vieira Milreu, Cecilia Coimbra Klein, Ludovic Cottret, Vicente Acuña, Etienne E. Birmelé, Michele Borassi...

Bioinformatics . 30 ( 1 ) : 61-70

DOI: 10.1093/bioinformatics/btt597

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The past and the present in decision-making: the use of conspecific and heterospecific cues in nest site selection

Sm. Kivelä, Jt. Seppänen, O. Ovaskainen, Blandine Doligez, L. Gustafsson, M. Mönkkönen...

Ecology . 95 ( 12 ) : 3428-3439

DOI: 10.1890/13-2103.1

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Optimization of the reactional medium and a food impact study for a colorimetric in situ Salmonella spp. detection method

L. Morand, D. Michel, Jean-Pierre Flandrois, T. Junillon, D. Mosticon, B. Mallen...

International Journal of Food Microbiology . 181 : 48-52

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Enhanced tetrazolium violet reduction of Salmonella spp. by magnesium addition to the culture media

T. Junillon, L. Morand, Jean-Pierre Flandrois

Food Microbiology . 42 : 132-135

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A one night stand? Reproductive excursions of female roe deer as a breeding dispersal tactic

Lucie Debeffe, S. Focardi, Christophe Bonenfant, A. J. Mark Hewison, N. Morellet, Cécile Vanpe...

Oecologia . 176 ( 2 ) : 431-43

DOI: 10.1007/s00442-014-3021-8

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Construction of standardized surveillance indicators for bovine cysticercosis

C. Dupuy, C. Morlot, P. Demont, Christian Ducrot, D. Calavas, Marie-Pierre Callait-Cardinal...

Preventive Veterinary Medicine . 115 ( 3-4 ) : 288-92

DOI: 10.1016/j.prevetmed.2014.03.024

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Prévalence, facteurs associés et répartition spatiale de la cysticercose bovine en France en 2010 et perspectives en termes de surveillance épidémiologie

Céline Dupuy, Claire Morlot, Emmanuelle Gilot-Fromont, Pierre Demont, Michel Mas, Claude Grandmontagne...

Bulletin Epidémiologique . 63 : 24-28

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Prevalence of Taenia saginata cysticercosis in French cattle in 2010

Céline Dupuy, C. Morlot, Emmanuelle Gilot-Fromont, M. Mas, C. Grandmontagne, P. Gilli-Dunoyer...

Veterinary parasitology . 203 ( 1-2 ) : 65-72

DOI: 10.1016/j.vetpar.2014.02.054

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Does land use within the home range drive the exposure of roe deer (Capreolus capreolus) to two abortive pathogens in a rural agro-ecosystem?

Julie Sevila, Nicolas Cebe, Denis Picot, Joël Merlet, Hélène Verheyden, Céline Richomme...

Acta Theriologica . 59 ( 4 ) : 571-581

DOI: 10.1007/s13364-014-0197-6

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Prévalence, facteurs associés et répartition spatiale de la cysticercose bovine en France en 2010 et perspectives en termes de surveillance épidémiologique

Céline Dupuy, Claire Morlot, Emmanuelle Gilot Fromont, Pierre Demont, Michel Mas, Claude Grandmontagne...

Bulletin Epidémiologique . ( 63 ) : 24-28

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Le bien-être des vaches laitières françaises passé au crible : approche épidémiologique

Alice de Boyer Des Roches, Isabelle Veissier, Maud Coignard, Nathalie Bareille, Raphaël R. Guatteo, Jacques Capdeville...

Le Point vétérinaire . 45 ( 347 ) : 50-56

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Anaerobic oxidation of long-chain n-alkanes by the hyperthermophilic sulfate-reducing archaeon, Archaeoglobus fulgidus.

Nadia Khelifi, Oulfat Amin Ali, Philippe Roche, Vincent Grossi, Céline Brochier-Armanet, Odile Valette...

The International Society of Microbiologial Ecology Journal . : 18

DOI: 10.1038/ismej.2014.58

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Halomonas olivaria sp. nov., a moderately halophilic bacterium isolated from olive-processing effluents

A. Amouric, Pierre-Pol Liebgott, M. Joseph, Céline Brochier-Armanet, J. Lorquin

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 64 ( Pt 1 ) : 46 - 54

DOI: 10.1099/ijs.0.049007-0

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Global phylogenomic analysis disentangles the complex evolutionary history of DNA replication in archaea.

Kasie Raymann, Patrick Forterre, Céline Brochier-Armanet, Simonetta Gribaldo

Genome Biology and Evolution . 6 ( 1 ) : 192-212

DOI: 10.1093/gbe/evu004

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Evidence for Widespread Positive and Negative Selection in Coding and Conserved Noncoding Regions of Capsella grandiflora

Robert Williamson, Emily Josephs, Adrian Platts, Khaled Hazzouri, Annabelle A. Haudry, Mathieu Blanchette...

PLoS Genetics . 10 ( 9 )

DOI: 10.1371/journal.pgen.1004622

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“One code to find them all”: a perl tool to conveniently parse RepeatMasker output files

Marc Bailly-Bechet, Annabelle Haudry, Emmanuelle Lerat

Mobile DNA . 5 : 13

DOI: 10.1186/1759-8753-5-13

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