Equipe Modélisation et Ecotoxicologie Prédictives
Membres
Professeur des universités
UCBL
Tél : 33 04 72 43 29 00
Doctorante
CNRS
Ingénieure d'études CDD
UCBL
Maître de conférences
UCBL
Tél : 33 04 72 44 80 51
Les activités de recherches de l’équipe MEPS visent à proposer des approches intégrées de modélisation mathématique et statistique pour prédire les effets de perturbations environnementales à différents niveaux d’organisation biologique, ainsi que leurs conséquences (fonctionnelles et évolutives), que ce soit sur la fitness individuelle, la dynamique des populations, des communautés et/ou des écosystèmes. Afin d’obtenir des modèles génériques à fort pouvoir prédictif, l’équipe s’attache en particulier à la compréhension du fonctionnement et pas seulement à la description extensive des systèmes complexes considérés. Ainsi, les modèles développés respectent le principe de parcimonie, pour veiller à rester suffisamment simples et donc limiter les effets « boîte noire ». Une attention particulière est donnée à la robustesse, et donc le caractère généralisable, des connaissances produites, dans l’objectif d’une meilleure acceptabilité de la modélisation pour aider à la prise de décision en évaluation du risque environnemental.
Cette réduction de la complexité des systèmes pour produire des modèles pertinents ne doit pas en occulter les éléments essentiels de fonctionnement, afin qu’ils restent des outils de compréhension des mécanismes sous-jacents aux processus de perturbation et aux effets observés sur les tissus, les organismes, les populations, les communautés et les écosystèmes. Ces modèles, mécanistes, doivent en outre intégrer la dimension temporelle, incontournable dès lors que l’on parle de processus dynamiques. En parallèle, il faut prendre en compte des critères complémentaires d’effet à court et à long terme pour répondre tout autant à des problématiques de remédiation et de restauration de milieux, que de prédiction dynamique et intégrative des effets sur plusieurs générations.
Dans ce contexte, les problématiques actuelles de l’équipe MEPS concernent :
- Le développement de modèles mécanistes à base physiologique, de type et toxico-cinétique / toxico-dynamique (TKTD), pour proposer des outils de prédiction et de diagnostic de la qualité des milieux ;
- La plasticité des réponses individuelles à un (ou une combinaison de) facteur(s) de stress (par ex., contamination et/ou réchauffement climatique) et des effets des phénomènes d’adaptation sur la dynamique à long terme des populations ;
- La prédiction de la distribution de sensibilité d’une communauté d’espèces à des contaminants en intégrant la variabilité inter-espèces sur divers paramètres biologiques d’intérêt et pas uniquement sur une concentration critique ;
- Le développement de la plateforme MOSAIC (MOdeling and StAtistical tools for ecotoxICology, http://mosaic.univ-lyon1.fr) qui propose une collection d’outils d’analyse et de modélisation de données en écotoxicologie.
Publications
Affichage des publications 31 à 60 sur 189 au total
Recent advances in the development of the comet assay on the hemocytes of zebra mussels and its application in field studies for evaluating environmental genotoxicity
International Comet Assay Workshop - 14th annual meeting .
Acte de congrès
voir la publicationPredicting characterization factors of chemical substances from a set of molecular descriptors based on machine learning algorithms
Peer Community In Ecotoxicology and Environmental Chemistry . : 100001
Autre publication
voir la publicationTaking full advantage of modelling to better assess environmental risk due to xenobiotics
Environmental Science and Pollution Research .
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voir la publicationGeneric Solving of One-compartment Toxicokinetic Models
Journal of Exploratory Research in Pharmacology .
Article dans une revue
voir la publicationKeeping modelling notebooks with TRACE: Good for you and good for environmental research and management support
Environmental Modelling & Software . 136 : 104932
Article dans une revue
voir la publicationOne and multi-compartments toxico-kinetic modeling to understand metals’ organotropism and fate in Gammarus fossarum
Environment International . 156 : 106625
Article dans une revue
voir la publicationThe added value of Bayesian inference for estimating biotransformation rates of organic contaminants in aquatic invertebrates
Aquatic Toxicology . 234 : 105811
Article dans une revue
voir la publicationAccumulation-depuration data collection in support of toxicokinetic modelling
Pré-publication
voir la publicationHow to account for the uncertainty from standard toxicity tests in species sensitivity distributions: An example in non-target plants
PLoS ONE .
Article dans une revue
voir la publicationApplication of General Unified Threshold Models of Survival Models for Regulatory Aquatic Pesticide Risk Assessment Illustrated with an Example for the Insecticide Chlorpyrifos
Integrated Environmental Assessment and Management . 17 ( 1 ) : 243-258
DOI: 10.1002/ieam.4327
Article dans une revue
voir la publicationIn Situ Reproductive Bioassay with Caged Gammarus fossarum (Crustacea): Part 1—Gauging the Confounding Influence of Temperature and Water Hardness
Environmental Toxicology and Chemistry . 39 ( 3 ) : 667-677
DOI: 10.1002/etc.4655
Article dans une revue
voir la publicationIn Situ Reproductive Bioassay with Caged Gammarus fossarum (Crustacea): Part 2—Evaluating the Relevance of Using a Molt Cycle Temperature‐Dependent Model as a Reference to Assess Toxicity in Freshwater Monitoring
Environmental Toxicology and Chemistry . 39 ( 3 ) : 678-691
DOI: 10.1002/etc.4656
Article dans une revue
voir la publicationModèles de croissance des micro-organismes, in Micro-organismes & biodiversité
Textes et documents pour la classe . 1130 : 60-63
Article dans une revue
voir la publicationRecommendations to address uncertainties in environmental risk assessment using toxicokinetic-toxicodynamic models
Scientific Reports . 9 ( 1 )
Article dans une revue
voir la publicationA Bayesian framework for estimating parameters of a generic toxicokinetic model for the bioaccumulation of organic chemicals by benthic invertebrates: Proof of concept with PCB153 and two freshwater species
Ecotoxicology and Environmental Safety . 180 : 33-42
Article dans une revue
voir la publicationScientific Opinion on the state of the art of Toxicokinetic/Toxicodynamic (TKTD) effect models for regulatory risk assessment of pesticides for aquatic organisms
EFSA Journal . 16 ( 8 )
Article dans une revue
voir la publicationFit Reduced GUTS Models Online: From Theory to Practice
Integrated Environmental Assessment and Management . 14 ( 5 ) : 625-630
DOI: 10.1002/ieam.4061
Article dans une revue
voir la publicationNew Insights to Compare and Choose TKTD Models for Survival Based on an Interlaboratory Study for Lymnaea stagnalis Exposed to Cd
Environmental Science and Technology . 52 ( 3 ) : 1582-1590
Article dans une revue
voir la publicationMOSAIC: a web-interface for statistical analyses in ecotoxicology
Environmental Science and Pollution Research . 25 ( 12 ) : 11295-11302
Article dans une revue
voir la publicationMOSAIC : une plate-forme web pour l’analyse statistique des données d’écotoxicologie. Fiche Thématique N°13
: 4 p.
tRophicPosition , an r package for the Bayesian estimation of trophic position from consumer stable isotope ratios
Methods in Ecology and Evolution . 9 ( 6 ) : 1592-1599
Article dans une revue
voir la publicationCombined effect of temperature and ammonia on molecular response and survival of the freshwater crustacean Gammarus pulex
Ecotoxicology and Environmental Safety . 137 : 42-48
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voir la publicationDe la bioaccumulation aux effets écotoxicologiques : comment modéliser le cycle de vie de Gammarus fossarum pour prédire et évaluer l’impact d’une contamination sur les populations d’une espèce sentinelle en biosurveillance ?
Colloque 2016 de la Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée . : 56
Acte de congrès
voir la publicationCombined effect of temperature and ammonia on the freshwater crustacean Gammarus pulex
SETAC Europe 26th Annual Meeting .
Acte de congrès
voir la publicationModelling survival: exposure pattern, species sensitivity and uncertainty
Scientific Reports . 6 : 29178
DOI: 10.1038/srep29178
Article dans une revue
voir la publicationCombined effect of temperature and ammonia on the freshwater crustacean Gammarus pulex
SETAC Europe 26th Annual Meeting .
Poster
voir la publicationMechanistic modelling of daphnid-algae dynamics within a laboratory microcosm
Ecological Modelling . 320 : 213–230
Article dans une revue
voir la publicationEcophysiological responses of Gammarus pulex to the combined effects of temperature and ammonia
26th Annual Meeting SETAC Europe .
Poster
voir la publicationOptimizing the design of a reproduction toxicity test with the pond snail Lymnaea stagnalis
Regulatory Toxicology and Pharmacology . 81 : 47-56
Article dans une revue
voir la publication