Ecologie Evolutive
Le département d'Ecologie Evolutive rassemble des compétences complémentaires en écologie comportementale, dynamique des populations, biologie des populations, écologie communautaire et méthodologie (statistiques et modélisation). Les recherches menées dans le département visent à étudier la façon dont les espèces animales évoluent dans un environnement variable en comprenant les causes de l'évolution des traits, des adaptations et des interactions. Pour cela, nous considérons différents niveaux d'organisation : individus, populations, communautés. Comme les organismes ne peuvent pas être considérés comme isolés des autres facteurs biotiques, nous considérons les pathogènes mais aussi les espèces en compétition au sein des communautés.
Nous étudions comment les individus s'adaptent à leur environnement qui est largement impacté par les pressions anthropiques, et comment les traits d’histoire de vie et le comportement évoluent en réponse à ces pressions. Bien que nous nous intéresserons principalement au phénotype, nous considérons de plus en plus le lien mécaniste entre le génotype et le phénotype. Nous développons le cadre théorique de notre discipline par une approche conceptuelle et de modélisation. En parallèle, nous testons les hypothèses qui découlent des prédictions théoriques par des approches expérimentales, comparatives et observationnelles sur différents modèles biologiques (insectes, oiseaux, mammifères). Les approches expérimentales sont développées en laboratoire (modèles insectes) et en milieu naturel (modèles oiseaux, insectes et mammifères). Les études observationnelles et comparatives concernent principalement les vertébrés. Nos approches s'intéressent également, et de plus en plus, aux mécanismes des réponses adaptatives. En plus des approches classiques d'analyse démographique et de changement de traits, des méthodes d'écophysiologie, d'écologie chimique et de biologie moléculaire sont utilisées.
Notre département porte également plusieurs suivis à long terme sur les populations sauvages de différentes espèces. Ces études à long terme offrent un moyen précieux de comprendre comment les facteurs biotiques et abiotiques affectent les traits d’histoire de vie des individus, et le fonctionnement des populations naturelles. Cinq populations d'espèces de mammifères sont ainsi suivies depuis plusieurs années (plus de 40 ans pour les chevreuils, 30 ans pour les marmottes des Alpes, 25 ans pour les chats, 16 ans pour les zèbres et 20 ans pour les impalas). Deux de nos sites d'étude, La Sassière dans le Parc national de la Vanoise (marmottes des Alpes) et le Parc national du Hwange, ont été certifiés "Site d'Etude en Ecologie Globale" (SEEG), et deux (ZA "Hwange" et ZA "Antarctique et sub-Antarctique") ont été certifiés "Zone Atelier" par le CNRS.
Le département d'écologie évolutive est également largement impliqué dans les activités de formation. Enfin, nous avons également des relations socio-économiques fortes. Nous abordons des questions d'intérêt sociétal majeur (réchauffement climatique, santé publique) et nous collaborons donc étroitement avec des partenaires socio-économiques (Office Français de la Biodiversité, Parc National de la Vanoise, Parc National de Hwange au Zimbabwe, Office National des Forêts, etc.) et participons à des événements grand public et médiatiques.
Publications
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Avis de l’Anses relatif à l'évaluation des mesures de gestion à mettre en place en cas de découverte d’un cas de peste porcine africaine dans la faune sauvage dans les différentes zones réglementées françaises
: 17 p.
Rapport
voir la publicationAvis de l'Anses relatif à l'évaluation de l'impact des activités en forêt sur le risque de diffusion de la Peste Porcine Africaine sur le territoire national, par le dérangement des sangliers. Deuxième partie (activités humaines de loisir et d'expl
: 29 p.
Rapport
voir la publicationAvis de l’Anses relatif à la Réévaluation des mesures de prévention et de gestion mises en place afin de prévenir et maîtriser le risque de diffusion de la PPA vers le territoire national
: 13 p.
Rapport
voir la publicationIsolement et caractérisation de bactéries du genre aeromonas en élevages de poissons d’étangs situes en Pays de Loire
6. Journées de la Recherche Filière Piscicole . ( 6ème ed. ) : 86 p.
Poster
voir la publicationAvis de l’Anses relatif à l’évaluation de l'impact des activités en forêt sur les risques d’introduction et de diffusion de la Peste Porcine Africaine sur le territoire national . Première partie
: 27 p.
Rapport
voir la publicationÉvaluation de l’impact des activités humaines d’exploitation forestière et de loisir sur le risque de propagation du virus de la peste porcine africaine : première élicitation d’experts
Epidémiologie et Santé Animale . 76 : 67-75
Article dans une revue
voir la publicationPrévalence des pathogènes portés par les tiques chez les ongulés de montagne dans 4 régions de France
37ème rencontres du GEEFSM .
Acte de congrès
voir la publicationImmune senescence in two populations of a wild mammal, the roe deer
Annual Meeting ECOFECT .
Acte de congrès
voir la publicationMaladies vectorisées par les tiques chez les ongulés sauvages de montagne : revue systématique
37èmes Rencontres du GEEFSM .
Acte de congrès
voir la publicationAssessment of diagnostic tests in the absence of a gold standard: a Bayesian approach simultaneously using latent class and mixture models for the diagnosis of bovine dictyocaulosis
BAYES2019 Lyon: Bayesian Biostatistics .
Acte de congrès
voir la publicationUn cas d’echec de traitement sélectif de la dictyocaulose avec de l’éprinomectine injectable dans un troupeau de vaches laitières
Bulletin des G.T.V. . 94 : 105-114
Article dans une revue
voir la publicationPertinence d'un traitement sélectif à l'échelle du groupe lors de dictyocaulose bovine
Journées Nationales des GTV .
Acte de congrès
voir la publicationBon usage du traitement sélectif. Exemple d’échec d’un traitement sélectif de la dictyocaulose avec de l’éprinomectine injectable dans un troupeau de vaches laitières.
Journées Nationales des GTV .
Acte de congrès
voir la publicationEndemic foot and mouth disease: pastoral in-herd disease dynamics in sub-Saharan Africa
Scientific Reports . 9 ( 1 ) : 17349
Article dans une revue
voir la publicationAssessing the potential of plains zebra to maintain African horse sickness in the Western Cape Province, South Africa
PLoS ONE . 14 ( 10 ) : e0222366
Article dans une revue
voir la publicationFramework for Estimating Indirect Costs in Animal Health Using Time Series Analysis
Frontiers in Veterinary Science . 6
Article dans une revue
voir la publicationCharacterizing Livestock Markets, Primary Diseases, and Key Management Practices Along the Livestock Supply Chain in Cameroon
Frontiers in Veterinary Science . 6
Article dans une revue
voir la publicationRevisiting the genetic diversity of emerging hantaviruses circulating in Europe using a pan-viral resequencing microarray
Scientific Reports . 9
Article dans une revue
voir la publicationMicrobial cross-feeding promotes multiple stable states and species coexistence, but also susceptibility to cheaters
Journal of Theoretical Biology . 465 : 63-77
Article dans une revue
voir la publicationTrophy hunting mediates sex‐specific associations between early‐life environmental conditions and adult mortality in bighorn sheep
Journal of Animal Ecology . 88 ( 5 ) : 734-745
Article dans une revue
voir la publicationMaternal longevity and offspring sex in wild ungulates
Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 286 ( 1896 ) : 20181968
Article dans une revue
voir la publicationThe Adaptive Sex in Stressful Environments
Trends in Ecology & Evolution . 34 ( 7 ) : 628--640
Article dans une revue
voir la publicationWhich primer set(s) for your bat diet metabarcoding study? Application to two insectivorous bat species sharing maternity roosts
8. European Congress of Mammalogy .
Acte de congrès
voir la publicationPopulation genetics as a tool for conservation biology: defining management units for the greater horseshoe bat
8. European Congress of Mammalogy .
Acte de congrès
voir la publicationDoes host socio-spatial behavior lead to a fine-scale spatial genetic structure in its associated parasites?
Parasite . 26 : 64
Article dans une revue
voir la publicationDetection of tick-borne pathogens in questing Ixodes ricinus in the French Pyrenees and first identification of Rickettsia monacensis in France
Parasite . 26 : 20
Article dans une revue
voir la publicationAnalyzing patterns in population dynamics using repeated population surveys with three types of detection data
Ecological Indicators . 106 : 105546
Article dans une revue
voir la publicationThe time frame of home‐range studies: from function to utilization
Biological Reviews . 94 ( 6 ) : 1974-1982
DOI: 10.1111/brv.12545
Article dans une revue
voir la publicationRecommendations to address uncertainties in environmental risk assessment using toxicokinetic-toxicodynamic models
Scientific Reports . 9 ( 1 )
Article dans une revue
voir la publicationRight on track? Performance of satellite telemetry in terrestrial wildlife research
PLoS ONE . 14 ( 5 ) : e0216223
Article dans une revue
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