Mon travail de recherche est pluridisciplinaire et se situe à l’interface de la biologie et des mathématiques. Je développe des outils statistiques (analyses multivariées, spatiales, de réseaux, etc.) pour l'analyse de données biologiques. Je m’intéresse plus
particulièrement au domaine de l’écologie (écologie des communautés, dynamique
de population) en essayant de comprendre l'effet de multiples facteurs (biotiques, abiotiques) sur la distribution des organismes.
Plus de détails à https://sdray.github.io/
Publications
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Trait matching without traits: using correspondence analysis to analyze the latent structure of interaction networks
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voir la publicationZero-shot animal behavior classification with vision-language foundation models
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voir la publicationBeing confident in confidence scores: calibration in deep learning models for camera trap image sequences
Remote Sensing in Ecology and Conservation .
DOI: 10.1002/rse2.412
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voir la publicationCommunity ionomics reveals a diversity of mineral nutrition in a species‐rich shrubland on infertile soil
Journal of Vegetation Science . 35 ( 5 ) : e13301
DOI: 10.1111/jvs.13301
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voir la publicationade4: Analysis of Ecological Data: Exploratory and Euclidean Methods in Environmental Sciences
Logiciel
voir la publicationInsights on the effect of mega-carcass abundance on the population dynamics of a facultative scavenger predator and its prey
Peer Community Journal . 4 : e53
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voir la publicationUsing the multivariate Hawkes process to study interactions between multiple species from camera trap data
Ecology . 105 ( 4 ) : e4237
DOI: 10.1002/ecy.4237
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voir la publicationBeyond accuracy : score calibration in deep learning models for camera trap image sequences
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voir la publicationPhylteR: Efficient Identification of Outlier Sequences in Phylogenomic Datasets
Molecular Biology and Evolution . 40 ( 11 ) : msad234
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voir la publicationQuantifying the overall effect of biotic interactions on species distributions along environmental gradients
Ecological Modelling . 483 : 110424
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voir la publicationThe global spectrum of plant form and function: enhanced species-level trait dataset
Scientific Data . 9 ( 1 ) : 755
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voir la publicationMycobacterium tuberculosis genetic features associated with pulmonary tuberculosis severity
International Journal of Infectious Diseases . 125 : 74-83
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voir la publicationEditorial: Advances in Statistical Ecology: New Methods and Software
Frontiers in Ecology and Evolution . 9
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voir la publicationAn appraisal of graph embeddings for comparing trophic network architectures
Methods in Ecology and Evolution . 13 ( 1 ) : 203-216
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voir la publicationGenetic and species‐level biodiversity patterns are linked by demography and ecological opportunity
Evolution - International Journal of Organic Evolution . 76
DOI: 10.1111/evo.14407
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voir la publicationDeterminants of genetic diversity and species richness of North American amphibians
Journal of Biogeography . 49 ( 11 ) : 2005-2015
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voir la publicationOvercoming the Spurious Groups Problem in Between-Group PCA
Evolutionary Biology .
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voir la publicationAre human natal sex ratio differences across the world adaptive? A test of Fisher's principle
Biology Letters . 17 ( 3 )
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voir la publicationLong‐term high densities of African elephants clear the understorey and promote a new stable savanna woodland community
Journal of Vegetation Science . 32 ( 6 )
DOI: 10.1111/jvs.13101
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voir la publicationImages, écologie et deep learning
Regards sur la biodiversité .
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voir la publicationHeterogeneity of water physico-chemical characteristics in artificially pumped waterholes: do African herbivores drink at the same locations and does it lead to interference competition?
Journal of Arid Environments . 173 : 104014
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voir la publicationInvestigating microbial associations from sequencing survey data with co-correspondence analysis
Molecular Ecology Resources . 20 ( 2 ) : 468-480
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voir la publicationCan an herbivore affect where a top predator kills its prey by modifying woody vegetation structure?
Oecologia . 192 ( 3 ) : 779-789
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voir la publicationPhenotypic plasticity in the invasive pest Drosophila suzukii: activity rhythms and gene expression in response to temperature
Journal of Experimental Biology . 222 : jeb199398
DOI: 10.1242/jeb.199398
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voir la publicationFlower phenology as a disruptor of the fruiting dynamics in temperate oak species
New Phytologist . 225 ( 3 ) : 1181-1192
DOI: 10.1111/nph.16224
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voir la publicationTesting the Mantel statistic with a spatially‐constrained permutation procedure
Methods in Ecology and Evolution . 10 ( 4 ) : 532-540
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voir la publicationNine Quick Tips for Analyzing Network Data
PLoS Computational Biology . 15 ( 12 ) : e1007434
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voir la publicationDiversity indices for ecological networks: a unifying framework using Hill numbers
Ecology Letters . 22 ( 4 ) : 737-747
DOI: 10.1111/ele.13221
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voir la publicationSpatial analyses of multi-trophic terrestrial vertebrate assemblages in Europe
Global Ecology and Biogeography . 28 ( 11 ) : 1636-1648
DOI: 10.1111/geb.12981
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voir la publicationSupervised Multiblock Analysis in R with the ade4 Package
Journal of Statistical Software . 86 ( 1 )
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