Burlet Nelly
Ingénieure d'études
CNRS
Je suis en charge du développement des activités de biologie cellulaire au LBBE. Pour cela, je me suis spécialisée dans 3 domaines d’expertise.
- Microscopie
Les projets au LBBE qui nécessite de la microscopie sont de plus en plus nombreux et variés tant au niveau des techniques que des modèles d’études. A titre d’exemples, cet outil est utilisé pour déterminer la localisation de gènes et/ou protéines au sein d’un tissu, analyser l’impact d’une molécule ou un virus sur l’expression de gènes, réaliser des mesures de phénotypages (e.g. taille des ailes d’insectes) et plus récemment pour déterminer le sex-ratio X/Y sur des spermatozoïdes.
Pour répondre à toutes ces problématiques, le LBEE est équipé d’un microscope numérique à fluorescence et d’un microscope confocal.
Expression de la protéine piwi dans des ovaires drosophiles
Expression du gène OdsH dans des testicules de drosophiles
- Cytométrie en flux
Depuis de nombreuses années, j’utilise cet outil afin d’estimer la taille des populations et répondre à des problématiques qui concerne l’évolution des espèces et comment les pressions de sélection environnementales peuvent influencer la taille des génomes.
De nouveaux projets émergent au LBBE portant sur des thématiques en immunologie et pour cela la cytométrie est un outil de choix et d’avenir au LBBE pour de nombreuses analyses.
- L'analyse de sperme
Le LBBE a acquis en 2023 le système CASA SCA (Computational Assisted Semen Analysis Sperm Class Analyser) de Microptics® permettant une analyse automatisée complète des spermatozoïdes (e.g analyses de mobilité et concentration, morphométrie, fragmentation de l'ADN).
A titre d’exemples, cet outil permet d’analyser la qualité du sperme au cours de la vie d’un individu ou encore d’étudier l’impact de polluants chimique sur la qualité du sperme en lien avec des questions sur la fertilité.
Ces analyses peuvent être réalisées au laboratoire ou directement sur le terrain pour les analyses sur des populations de faune sauvage.
Analyse morphométrique d'un spermatozoïde de chevreuil
Publications
Affichage des publications 1 à 23 sur 23 au total
The transposable element-rich genome of the cereal pest Sitophilus oryzae
Pré-publication
voir la publicationSocial interactions throughout life impair longevity and age-specific mating success in male parasitoids
Behavioral Ecology and Sociobiology . 78 : 90
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voir la publicationA novel and diverse family of filamentous DNA viruses associated with parasitic wasps
Virus Evolution . 10 ( 1 ) : veae022
DOI: 10.1093/ve/veae022
Article dans une revue
voir la publicationCommunity structure of heritable viruses in a Drosophila-parasitoids complex
Peer Community Journal . 4 : e16
Article dans une revue
voir la publicationIdentification and quantification of transposable element transcripts using Long-Read RNA-seq in Drosophila germline tissues
Peer Community Journal . 4 ( e89 )
Article dans une revue
voir la publicationA comprehensive evolutionary scenario for the origin and neofunctionalization of the Drosophila speciation gene Odysseus (OdsH)
G3 . 14 ( 3 ) : jkad299
Article dans une revue
voir la publicationThe assembly of the rice weevil Sitophilus oryzae is dominated by transposable elements and shades light on the evolution of endosymbiosis in a major crop pest.
Arthropod Genomics Symposium 2022 .
Acte de congrès
voir la publicationThe transposable element-rich genome of the cereal pest Sitophilus oryzae
BMC Biology . 19 ( 1 ) : 241
Article dans une revue
voir la publicationTransposable element activity in the transcriptomic analysis of mouse pancreatic tumors
Pré-publication
voir la publicationA transposon story : from TE content to TE dynamic invasion of Drosophila genomes using the single-molecule sequencing technology from Oxford Nanopore
Cells . 9 ( 8 ) : 1776
DOI: 10.3390/cells9081776
Article dans une revue
voir la publicationDynamic Interactions Between the Genome and an Endogenous Retrovirus: Tirant in Drosophila simulans Wild-Type Strains
G3 . 9 ( 3 ) : 855-865
Article dans une revue
voir la publicationEvaluating the essentiality of the primary endosymbiont of the rice weevil Sitophilus oryzae through genome analysis
VI Meeting of the Spanish Society for Evolutionary Biology (SESBE) .
Poster
voir la publicationAn attempt to select non-genetic variation in resistance to starvation and reduced chill coma recovery time in Drosophila melanogaster
Journal of Experimental Biology . 221 ( 23 ) : jeb186254
DOI: 10.1242/jeb.186254
Article dans une revue
voir la publicationIdentification of misexpressed genetic elements in hybrids between Drosophila-related species
Scientific Reports . 7 : 40618
DOI: 10.1038/srep40618
Article dans une revue
voir la publicationDrosophila Females Undergo Genome Expansion after Interspecific Hybridization
Genome Biology and Evolution . 8 ( 3 ) : 556-561
DOI: 10.1093/gbe/evw024
Article dans une revue
voir la publicationThe draft genome sequence of the rice weevil Sitophilus oryzae as a model to explore the host-symbiont interactions in a nascent stage of endosymbiosis
Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM) .
Poster
voir la publicationStrong phylogenetic inertia on genome size and transposable element content among 26 species of flies
Biology Letters . 12 ( 8 )
Article dans une revue
voir la publicationIs genome size of Lepidoptera linked to host plant range?
Entomologia Experimentalis et Applicata . 159 ( 3 ) : 354-361
DOI: 10.1111/eea.12446
Article dans une revue
voir la publicationMaternally deposited germline piRNAs silence the tirant retrotransposon in somatic cells
EMBO Reports . 14 ( 5 ) : 458-64
Article dans une revue
voir la publicationA comparative analysis of the amounts and dynamics of transposable elements in natural populations of Drosophila melanogaster and Drosophila simulans.
Journal of Environmental Radioactivity . 113 : 83-86
Article dans une revue
voir la publicationtirant, a newly discovered active endogenous retrovirus in Drosophila simulans.
Journal of Virology . 86 ( 7 ) : 3675-3681
DOI: 10.1128/JVI.07146-11
Article dans une revue
voir la publicationComparative analysis of transposable elements in the melanogaster subgroup sequenced genomes.
Gene . 473 ( 2 ) : 100-9
Article dans une revue
voir la publicationGenomic environment influences the dynamics of the tirant LTR retrotransposon in Drosophila.
FASEB Journal . 23 ( 5 ) : 1482-9
DOI: 10.1096/fj.08-123513
Article dans une revue
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